Polimorfizm regionów regulatorowych genów kandydujących
Transkrypt
Polimorfizm regionów regulatorowych genów kandydujących
„Polimorfizm regionów regulatorowych genów kandydujących dla cech otłuszczenia świni – związek z poziomem transkrypcji i zmiennością wybranych cech rzeźnych" Maria Grześ Stypendystka projektu pt. „Wsparcie stypendialne dla doktorantów na kierunkach uznanych za strategiczne z punktu widzenia rozwoju Wielkopolski”, Poddziałanie 8.2.2 Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki Problemem na skalę światową, przyjmującym rozmiary epidemii staje się nadwaga i otyłość. Na przypadłość tą cierpi coraz większa liczba ludzi, w niektórych krajach przekraczając 75% ludności. Istotne znaczenie w poznawaniu genetycznego podłoża otyłości ma wiedza pochodząca z badań prowadzone z wykorzystaniem zwierząt modelowych, takich jak szczur, mysz, pies czy świnia. Szczególne znaczenie ma świnia, z uwagi na szereg podobieństw anatomicznych, fizjologicznych oraz metabolicznych. Podobnie jak człowiek, świnia jest wszystkożercą, przez co zależnie od diety może wykazywać podatność na te same choroby. Ponadto za szereg zaburzeń metabolicznych, występujących u obu gatunków odpowiedzialne są mutacje w tych samych genach. W ramach realizowanej pracy doktorskiej prowadzone są analizy molekularne genów, które zostały uznane za kandydujące dla rozwoju otyłości człowieka, w rasach świń charakteryzujących się zróżnicowanym poziomem otłuszczenia. Geny te to m.in.: FASN, INSIG2, FTO czy też ME – kodujące białka zaangażowane w szeroko pojęte procesy przemiany lipidów. Badania obejmują poszukiwanie polimorfizmu w regionach regulatorowych w/w genów, następnie określenie różnic w częstościach występowania polimorfizmów pomiędzy rasami oraz związek wybranych polimorfizmów ze zmiennością otłuszczenia świń. Dla dwóch tkanek (mięśnia najdłuższego oraz podskórnej tkanki tłuszczowej) oceniona zostanie zmienność poziomu transkryptów genów FASN i INSIG2 w czterech rasach świń (technika Real – time PCR). Ponadto, dla szczególnie interesujących polimorfizmów – a więc zlokalizowanych w potencjalnych miejscach wiązania czynników transkrypcyjnych (dla regionów 5`-flankujących) bądź w obrębie sekwencji rozpoznawanych przez miRNA (w 3`UTR) przeprowadzona zostanie analiza wykorzystująca gen reporterowy kodujący lucyferazę. Praca doktorska współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego Znaczenie realizowanej pracy doktorskiej dla województwa wielkopolskiego rozpatrywać można dwojako: pod względem zdrowotnym oraz produkcyjnym. W zakresie tego pierwszego istotne jest, iż wg danych GUS problem nadwagi i otyłości dotyczy ponad 1/4 kobiet oraz więcej niż 1/3 mężczyzn zamieszkujących Wielkopolskę. Należy pamiętać, że otyłość to nie tylko pogorszenie jakości życia, ale przede wszystkim niezwykle groźne dla zdrowia i życia schorzenie, któremu towarzyszą liczne powikłania sercowo – naczyniowe. Stąd identyfikacja genetycznego podłoża rozwoju nadwagi i otyłości jest bardzo ważna, by można było w porę zastosować środki zapobiegające jej rozwinięciu. Z kolei w aspekcie produkcyjnym - Wielkopolska jest krajowym liderem w zakresie wysoko produktywnego rolnictwa, w tym hodowli zwierząt. Region ten zajmuje pierwsze miejsce pod względem pogłowia trzody chlewnej, przewyższając prawie 3-krotnie kolejne województwo (kujawsko – pomorskie). Produkcja żywca wieprzowego stanowi ponad 30% całkowitej produkcji rolniczej Wielkopolski, a wieprzowina stanowi najczęściej spożywane mięso w Polsce, stąd ważne jest identyfikowanie mechanizmów warunkujących powstawanie mięsa o wysokiej jakości (m.in. o niewielkiej zawartości tłuszczu w tuszy, przy jednoczesnym zapewnieniu odpowiedniej marmurkowatości mięsa – a więc zawartości tłuszczu śródmięśniowego). W wyniku badań prowadzonych w ramach pracy doktorskiej możliwe, że zostaną odkryte polimorfizmy wykazujące asocjację z cechami otłuszczenia świń, co mogło by być wykorzystane przy tworzeniu programów hodowlanych, których docelowym efektem jest poprawienie jakości mięsa wieprzowego. Praca doktorska współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego