Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374

Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374
Sylabusy - Centrum Informatyczne UG
Dział Kształcenia
Nazwa przedmiotu
Kod ECTS
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM)
Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot
13.1.0374
Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG i GUMed
Studia
wydział
Międzyuczelniany
Wydział Biotechnologii
UG i GUMed
kierunek
Biotechnologia
poziom
forma
moduł
specjalnościowy
specjalizacja
pierwszego stopnia
stacjonarne
wszystkie
wszystkie
Nazwisko osoby prowadzącej (osób prowadzących)
dr hab. Krzysztof Hinc
Formy zajęć, sposób ich realizacji i przypisana im liczba godzin
Formy zajęć
Liczba punktów ECTS
4
Strategia obliczania/szacowania punktów ECTS
odbywa się w oparciu o następujące założenia:
1 punkt ECTS oznacza 25-30 godzin pracy studenta
w różnych formach takich jak: uczestniczenie w
zajęciach dydaktycznych w UG, samodzielne
przygotowywanie się do zajęć , przygotowanie
prezentacji, indywidualne konsultacje.
Proseminarium
Sposób realizacji zajęć
zajęcia w sali dydaktycznej
Liczba godzin
Proseminarium: 30 godz.
Cykl dydaktyczny
2016/2017 zimowy
Status przedmiotu
- fakultatywny (do wyboru)
- obowiązkowy
Metody dydaktyczne
Przygotowanie przez studentów prezentacji
multimedialnej i prezentowanie danej tematyki; Praca
indywidualna i zespołowa studentów (m.in. w
przygotowaniu do zajęć); Dyskusja (odpowiednie
stawianie pytań, poszukiwanie odpowiedzi,
argumentów); Indywidualne konsultacje z
prowadzącym zajęcia (m.in. pomoc w przygotowaniu
prezentacji)
Język wykładowy
polski
Forma i sposób zaliczenia oraz podstawowe kryteria oceny lub
wymagania egzaminacyjne
Sposób zaliczenia
Zaliczenie na ocenę
Formy zaliczenia
ustalenie oceny zaliczeniowej na podstawie ocen cząstkowych
otrzymywanych w trakcie trwania semestru
Podstawowe kryteria oceny
W trakcie zajęć ocenie będzie podlegać:
• wiedza dotyczącą podstawowych technik i narzędzi badawczych stosowanych w
inżynierii genetycznej
• umiejętność korzystania z informacji naukowej do przygotowania opracowania
teoretycznego w tym umiejętność selekcji materiału
• wykorzystanie języka naukowego w tym specjalistycznej terminologii i aparatu
pojęciowego inżynierii genetycznej. W szczególności ocenie podlegać będzie
poprawne i adekwatne używanie terminów naukowych i specjalistycznych nazw
niezbędnych do opisu czynności laboratoryjnych i procedur oraz aparatury. Stosowanie
żargonu negatywnie wpłynie na uzyskaną ocenę.
• umiejętność prowadzenia dyskusji i odpowiedzi na pytania
• kompetencje do pracy w zespole, wspólnej realizacji opracowań teoretycznych
Ocena końcowa będzie wynikała z oceny powyższych elementów. Student musi
uzyskać pozytywną ocenę każdego z ocenianych elementów. Prowadzący
przeprowadzi ocenę na podstawie aktywności studenta podczas zająć, przygotowanych
przez studentów materiałów i sprawdzianu zawierającego krótkie pytania otwarte oraz
pytania i odpowiedzi do wyboru weryfikujące uzyskanie zakładanych efektów
kształcenia.
Sposób weryfikacji założonych efektów kształcenia
Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymogami wstępnymi
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374 | Strona 1 z 3
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374
Sylabusy - Centrum Informatyczne UG
Dział Kształcenia
A. Wymagania formalne
brak
B. Wymagania wstępne
Wymagane jest uzyskanie wiedzy, umiejętności i kompetencji określonych dla kursów Biologia molekularna (wykład, ćwiczenia), Biochemia (wykład,
ćwiczenia), Genetyka (wykład)
Cele kształcenia
Kurs jest tematycznie związany z zajęciami laboratoryjnymi „Pracownia Inżynierii Genetycznej”. Studenci pod opieką prowadzącego przygotowują
oraz prezentują i omawiają wybrane techniki inżynierii genetycznej i biologii molekularnej. Zakłada się indywidualna i zespołową pracę studenta w
przygotowaniu do zajęć. Prowadzący kierując dyskusją wskazuje na zalety i wady prezentowanych metod, przekazuje studentom wiedzę i
doświadczenie praktyczne stosowania omawianych technik laboratoryjnych. Studenci uczą się stawiania pytań, szukania odpowiedzi oraz potrzeby
projektowania i przeprowadzania odpowiednich kontroli eksperymentów. Podczas kursu studenci mają możliwość uczenia się i doskonalenia
sposobu prezentacji. Studenci poznają fachową nomenklaturę dotyczącą omawianych zagadnień.
Celem kursu jest przygotowanie studentów do teoretycznego opracowania metod laboratoryjnych i procedur stosowanych w inżynierii genetycznej, a
w szczególności:
• Student zdobędzie wiedzę dotyczącą podstawowych technik i narzędzi badawczych inżynierii genetycznej (K_W07)
• Zdobędzie umiejętność korzystania z informacji naukowej, wykorzystując źródła elektroniczne dostępne w zasobach bibliotek UG i GUMed (K_U02)
• Student nauczy się stosowania języka naukowego w tym specjalistycznej terminologii i aparatu pojęciowego inżynierii genetycznej (K_U06)
• Student zdobędzie umiejętność przygotowania i prezentacji w języku polskim wystąpienia ustnego obejmujące szczegółowe zagadnienia w
zakresie inżynierii genetycznej (K_U07)
• Student nauczy się pracy zespołowej dotyczącej teoretycznego przygotowywania i prezentacji zagadnień z zakresu inżynierii genetycznej (K_K02)
Treści programowe
W programie zajęć znajdują się zagadnienia związane z metodami inżynierii genetycznej, opis metod, zasady stosowania, etapy procedur
laboratoryjnych i ich podstawy teoretyczne. Zajęcia obejmą zagadnienia:
1. Izolacja kwasów nukleinowych
izolacja DNA plazidowego, izolacja DNA chromosomalnego, izolacja RNA, izolacja kwasów nukleinowych z tkanek zwierzęcych i roślinnych, izolacja
kwasów nukleinowych z bakterii, izolacja kwasów nukleinowych z organelli komórkowych, izolacja kwasów nukleinowych z materiałów archiwalnych
np. słupki parafinowe, kości
2. Metody elektroforetyczne w analizie kwasów nukleinowych
elektroforeza agarozowa, elektroforeza poliakrylamidowa, elektroforeza w żelach denaturujących, elektroforeza w polu pulsowym, elektroforeza
kapilarna, elektroforeza dwukierunkowa kwasów nukleinowych
3. Sekwencjonowanie DNA
metody klasyczne: Sangera i Maxama-Gillberta, sekwencjonowanie automatyczne, sekwencjonowanie genomów, pirosekwencjonowanie,
sekwencjonowanie z wykorzystaniem sond, 5'-RACE
4. Łańcuchowa reakcja polimeryzacji (PCR) (bez real-time PCR)
rodzaje stosowanych polimeraz do PCR, hot-start PCR, nested PCR, inverse PCR, RT-PCR
5. Mutageneza
mutageneza niespecyficzna wywołana czynnikami chemicznymi, fizycznymi, enzymatycznymi, mutageneza transpozonowa, mutageneza
ukierunkowana (z zastosowaniem primera, z zastosowaniem PCR itp.), tworzenie biblioteki mutantów, metody selekcji mutantów
6. Systemy ekspresji
bakteryjne systemy ekspresji, eukariotyczne systemy ekspresji np. drożdżowe, wirusowe, roślinne itp.
7. Izolacja białek (podstawowe techniki chromatograficzne)
przygotowanie próbek białkowych do oczyszczania, filtracja żelowa, chromatografia jonowymienna, chromatoogniskowanie, chromatografia w
odwróconym układzie faz, chromatografia oddziaływań hydrofobowych, chromatografia metalopowinowactwowa, chromatografia powinowactwowa
8. Metody elektroforetyczne w analizie białek
elektroforeza białkowa w żelach denaturujących i niedenaturujących, ogniskowanie izoelektrtyczne, elektroforeza dwukierunkowa białek, wizualizacja
białek po elektroforezie
9. Metody znakowania i modyfikacji kwasów nukleinowych i białek
znakowanie radioaktywne, znakowanie nieradioaktywne, metody znakowania, modyfikacje enzymatyczne, modyfikacje chemiczne i fizyczne
10. Metody detekcji kwasów nukleinowych i białek (Southern, Northern, Western)
Wykaz literatury
A. Literatura podstawowa
Molecular cloning - A laboratory manual by Sambrook, Fritsch and Maniatis,
Materiały przygotowane przez prowadzącego,
Materiały samodzielnie wyszukene i selekcjonowane przez studentów dotyczące zajęć korzystając z zasobów bibliotecznych i elektronicznych źródeł
informacji
Efekty kształcenia
Wiedza
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374 | Strona 2 z 3
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374
Sylabusy - Centrum Informatyczne UG
Dział Kształcenia
(obszarowe i kierunkowe)
K_W07
K_U02
K_U06
K_U07
K_K02
K_W07 - ma wiedzę dotyczącą podstawowych technik i narzędzi badawczych
stosowanych w biotechnologii oraz wybranych metod pokrewnych dziedzin i
dyscyplin naukowych; zna rozwój metod biotechnologii; rozumie podstawowe
techniki stosowane w izolacji, selekcji, syntezie, modyfikacji i analizie organizmów,
tkanek, komórek i molekuł
Umiejętności
K_U02 - posiada umiejętność korzystania z informacji naukowej, w tym
angielskojęzycznej, dotyczącej biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin
naukowych; wykorzystuje źródła elektroniczne; posiada podstawową umiejętność
korzystania z właściwych baz danych niezbędnych w prowadzeniu działalności w
zakresie biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin naukowych
K_U06 - wykorzystuje język naukowy w tym specjalistyczną terminologię i aparat
pojęciowy właściwy dla biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin
K_U07 - potrafi przygotować i przedstawić w języku polskim i/lub angielskim krótkie
wystąpienie ustne obejmujące szczegółowe zagadnienia w zakresie biotechnologii i
pokrewnych dziedzin i dyscyplin; posiada umiejętność prowadzenia dyskusji
Kompetencje społeczne (postawy)
K_K02 - posiada kompetencje do pracy w zespole, w szczególności wspólnej
realizacji prac laboratoryjnych oraz nieskomplikowanych opracowań teoretycznych
w zakresie biotechnologii i pokrewnych dziedzin i dyscyplin naukowych
Kontakt
[email protected]
Metodyka inżynierii genetycznej 4 (proseminarium KBM) #13.1.0374 | Strona 3 z 3