Uchwała Komisji habilitacyjnej wraz z

Uchwata
Komisji habilitacyjnej powotanej przez Centralnq Komisje ds. Stopni i Tytutow
w dniu 4 kwietnia 2016 r., na podstawie art. 18a, ust. 5 Ustawy z dnia 14 marca 2003 r.
o stopniach i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie sztuki, w brzmieniu ustalonym Ustawq z
dnia 18 marca 2011 r. (Dz. U. z 2011, nr 84, poz. 455)
w sprawie: przeprowadzenia postqpowania habilitacyjnego dr. Pawta Niewiadomskiego w dziedzinie
nauk biologicznych, dyscyplinie biologia.
Komisja na posiedzeniu w petnym sktadzie (7 os6b uaestniczqcych w posiedzeniu), w jawnym
gtosowaniu, przeprowadzonym w czasie wideokonferencji, dziatajqc zgodnie z w. w. Ustawq,
uwzgl~dniajqcrozporzqdzenie MNiSzW z dnia 30 paidziernika 2015 w sprawie szczegotowego trybu i
warunkow przeprowadzenia czynnoici w przewodach doktorskich, w postepowaniu habilitacyjnym oraz w
postepowaniu o nadanie tytutu profesora (Dz.U. z 2015 r., poz. 1842)) stosujqc kryteria zawarte w
Rozporzqdzeniu MNiSzW z dnia 1wrzeinia 2011 (Dz. U. Nr 196, poz. 1165) jednogtoinie (7 gtos6w za, 0
gtosbw nie, 0 gtos6w wstrzymujqcych siq) i pozytywnie opiniuje wniosek o nadanie stopnia doktora
habilitowanego Panu dr. Pawtowi Niewiadomskiemu.
Integralnq czeiciq niniejszej uchwaty jest zatqcznik nr 1stanowiqcy jej uzasadnienie.
Komisja przekazuje niniejszq uchwate Pani Dziekan Wydziatu Biologii Uniwersytetu Warszawskiego w
Warszawie.
1.prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kuliriska- przewodniczqca komisji
2. dr hab. Piotr Bebas - sekretarz komisji
3. prof. dr hab. Anna Latos-Bieleriska - recenzent
4. prof. dr hab. Grzegorz Wegrzyn - recenzent
5. prof. dr hab. Michat Witt - recenzent
6. prof. dr hab. Marek Maleszewski - cztonek komisji
7. dr hab. Dorota Wtoga - cztonek komisji
Warszawa, 6 czerwca 2016 r.
Do Uchwaty podjetej przez Komisje Habilitacyjnq powotanq w dniu 4 kwietnia 2016 roku,
przez Centralnq Komisjq do Spraw Stopni i Tytutow Naukowych w celu przeprowadzenia
postgpowania o nadanie dr. Pawtowi Niewiadomskiemu stopnia doktora habilitowanego
nauk biologicznych w dyscyplinie biologia.
Sylwetka Habilitanta
Dr Pawet Niewiadomski ukonczyt studia magisterskie na Wydziale Farmaceutycznym
Akademii Medycznej w todzi (poiniej Uniwersytet Medyczny - UM w todzi) w 2001 roku, a
takie studia magisterskie na Wydziale Matematyki Uniwersytetu todzkiego w 2003 r. Z
obydwiema jednostkami zwiqzat rdwniei swojq najwczeSniejszq kariere naukowq, odbywajqc
studia doktoranckie w latach 2001-2004 w Katedrze Farmakodynamiki Wydziatu Farmacji
UM w todzi (w tym czasie wspotpracowat takie z Zaktadem Amin Biogennych tej Uczelni), a
w latach 2003-2005 pracowat jako asystent w Katedrze lnformatyki Stosowanej Wydziatu
Matematyki Uniwersytetu todzkiego. Stopieh naukowy doktora nauk farmaceutycznych
uzyskat w roku 2004 na Wydziale Farmacji UM w todzi. W latach 2005-2009 odbywat stai,
pracujqc jako postdoctoral scholar w Semel Institute for Neuroscience and Human Behavior,
University of California w Los Angeles. Kolejne trzy lata (2010-2012) dr Niewiadomski spqdzit
w Department of Medicine, Stanford University School of Medicine, gdzie pracowat jako
scholar/research associate. Wkrotce po powrocie do Polski, w 2013 r., zostat zatrudniony na
stanowisku adiunkta w Katedrze Medycyny Molekularnej i Biotechnologii UM w todzi. W
tym samym roku rozpoczqt prace jako specjalista w Pracowni Synaptogenezy lnstytutu
Biologii Dojwiadczalnej im. M. Nenckiego PAN w Warszawie, zajmujqc to stanowisko do
2015 r. Od czerwca 2015 r. objqt kierownictwo Laboratorium Sygnalizacji Molekularnej i
Komorkowej w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego, gdzie pracuje do
dnia dzisiejszego.
Wartofciuiaca ocena naiwainieiszvch osianniet Kandvdata stanowiacvch wktad w
rozwdi dvscvpliny
Jako osiqgniqcie naukowe dr Pawet Niewiadomski przedstawit siedem prac (z kt6rych
3 to rozdziaty w ksiqzce), opatrzonych wspdlnym tytutem " Mechanizmy molekularne
sygnalizacji Hedgehog - wptyw rzqski pierwotnej i szlaku cykliczne AMPIkinaza biatkowa A".
Prace te zostaty opublikowane w latach 2011-2015. W czterech pracach (2,4,6 i 7) dr
Niewiadomskijest pierwszym autorem, w dwoch pracach ( 1i 5) mimo ze jest drugim
autorem to Jego wktad w przygotowanie publikacji byt rowny z osobq, ktorej nazwisko
widnieje na pierwszym miejscu, a w jednej pracy (3) jest 3 autorem. Udziat Habilitanta w
publikacjach wynosi 60% (prace 2,4,6), 45% (praca 7), 35% (praca 5), 30% (praca 1) i 15%
(praca 3). Publikacje te ukazaty siq w nastqpujqcych czasopismach: Journal of Neuroscience
Research (praca I), Cellular Signalling (praca 2), Nature Chemical Biology (praca 3), Methods
in Molecular Biology (prace 4-6; rozdziaty w ksiqice) i Cell Reports (praca 7 ) . Sumaryczny
wsp6tczynnik oddziatywania (IF) czasopism, w ktorych prace te byty zamieszczone wynosi
28,784, a sumaryczna liczba cytowari prac wchodzqcych w sktad osiqgniqcia wynosi 75, co
odzwierciedla wysokq rangq i duie znaczenie badari prowadzonych przez Habilitanta.
Osiqgniqcie naukowe zostato doktadnie omowione w autoreferacie, w kt6rym
przedyskutowano wyniki wyiej wymienionych siedmiu prac, na tle literatury przedmiotu.
W iwietle powyzszych publikacji osiqgniqcia naukowe dr. Pawta Niewiadomskiego
przedstawiajq siq nastqpujqco:
- Habilitant dowi6dt i e iciezka Hh jest regulowana przez o i PACAP/cAMP/PW w komdrkach
progenitorowych rdzenia kr~gowego,
- dowiodt, i e icieika Hh regulowana jest przez dwie niezalezne pule kom6rkowego PKA,
- wskazat i e PKA wptywa na czynniki transkrypcyjne Gli poprzez zmianq ich lokalizacji w
rzqsce pierwotnej,
- udowodnit, ze biatka rozpuszczalne mogq przedostawat siq do rzqski pierwotnej na
zasadzie utrudnionej dyfuzji przez sit0 molekularne. Podjqt probe wytiumaczenia dlaczego
wiqksze czpsteczki biatek dostajq siq do rzqski znacznie wolniej, n i i by to wynikato z
fizycznych praw dyfuzji w cieczach,
- opracowat nowatorskie metody badania molekularnych i biochemicznych aspektow
regulacji biatek Gli w sygnalizacji Hh,
- wykazat, i e fosforylacja biatek Gli przez PKA ma kluczowe znaczenie nie tylko dla tworzenia
skr6conych form represorowych, ale rdwniez dla zahamowania aktywnoici transkrypcyjnej
biatek Gli petnej dtugoici,
- udowodnit, i e stymulacja Smo powoduje defosforylacje biatek Gli na resztach
fosforylowanych przez PKA, co sugerowato, i i PKA jest nie tylko zewnqtrznym modulatorem
fcieiki Hh, ale i e kinaza ta stanowi integralnq czqii sygnatu Hh bezpofrednio regulowanq
przez Ptch i Smo i wptywajqcq na aktywnoii transkrypcyjnq biatek Gli.
Recenzenci i Cztonkowie Komisji uznali osipgniecie naukowe dr. Pawta
Niewiadomskiego za niezwykle wartoiciowe naukowo, stanowiqce oryginalny i nowatorski
wktad Habilitanta w wiedze na temat molekularnych podstaw sygnalizacji z udziatem biatka
Hedgehog i roli w tym procesie rzqski pierwotnej oraz kinazy biatkowej A. Jest ono przy tym
bardzo spojne i konsekwentnie jednorodne w swej zawartofci merytorycznej. Osiqgniqcie
naukowe zostato uzyskane z uiyciem nowoczesnych metod, ktore przyniosty wiele wynikow
o znaczeniu nie ograniczajqcym sie wytqcznie do poznania zjawisk opisanych przez
Kandydata w stworzonych przez Niego uktadach doiwiadczalnych. Warto takie podkrejlii
znakomitq znajomofi warsztatu matematycznego, ktory pozwolit Habilitantowi uzupetniaC
dokonania w zakresie biologii molekularnej zaawansowanymi analizami matematycznymi i
tworzeniem modeli do rozwaiari praktycznych.
Ocena pozostatego dorobku naukoweno, niewchodzaceno w sktad osianniecia
habilitacvineno
Cztonkowie komisji pozytywnie ocenili pozostaty dorobek naukowy dr. Pawta
Niewiadomskiego, ktory nie zostat wtqczony do osiqgniecia bqdqcego podstawp do ubiegania
siq o stopieri naukowy doktora habilitowanego. Stanowi go 15 prac - z czego 14 ukazato sie
w czasopismach z listy JCR, a 1to rozdziat w ksiqice o zasiegu krajowym. Wirod nich 10 to
prace opublikowane po uzyskaniu stopnia doktora, w tym 8 artykutow, w ktorych
przedstawiono wyniki badari eksperymentalnych, 1rozdziat w podreczniku akademickim i 1
praca przeglqdowa. Dr Niewiadomskijest pierwszym autorem w 2 z tych publikacji. Prace z
wspotautorstwem dr. Niewiadomskiego, niewchodzqce w sktad osiqgniecia habilitacyjnego
publikowane byty w dobrych i bardzo dobrych czasopismach, jak Molecular Endocrinology,
Developmental Biology, Journal of Molecular Neuroscience.
tqcznie publikacje dr. Pawta Niewiadomskiego osiagajq sumaryczny IF 55,84 (w tym
dla prac spoza osiqgniecia habilitacyjnego sumaryczny IF wynosi 27,096). Liczba cytowari
wszystkich prac wynosi 200 (podczas przygotowywania niniejszego dokumentu 208; bez
autocytowari 196). Dla prac spoza osiqgniqcia liczba cytowari jest r6wna 125 (aktualnie, tzn.
w dniu przygotowywania niniejszego dokumentu, 133). lndeks Hirscha osiqgniqC Habilitanta
wynosi 8, przy przeciqtnej liczbie cytowari publikacji 10,95. Lists dokonan naukowych dr.
Niewiadomskiego dopetnia 15 komunikatow zjazdowych na konferencjach o zasiqgu
miqdzynarodowym, ktore odbyty siq miqdzy innymi w Stanach Zjednoczonych i Portugalii.
Dane te wskazujq, ze badania prowadzone przez Habilitanta naleiq do nurtu Jwiatowej
nauki.
Badania dr. Pawta Niewiadomskiego koncentrujq siq na mechanizmach molekularnej
sygnalizacji z udziatem biatka Hedgehog (Hh). Badania miaty za cel ustalenie udziatu
czynnikow PACAP/cAMP/PKA w kontroli tej sygnalizacji w komorkach progenitorowych
rdzenia krqgowego, roli w tym procesie dwoch pul PKA, a w tym ich wptywu na aktywnoiC
czynnikow transkrypcyjnych Gli oraz ich lokalizacjq w rzqsce pierwotnej. Znacznq czqiC uwagi
Habilitant poiwiqcit opracowaniu metod badania molekularnych i biochemicznych podstaw
regulacji czynnikow Gli w sygnalizacji Hh. Zarowno zagadnienia badawcze, jak i warsztat
metodyczny Habilitanta ewoluowat w trakcie Jego kariery naukowej. Spoirdd prac
doiwiadczalnych wykonanych przy istotnym udziale Habilitanta (10-50%), ale nie wtqczonych
do cyklu przedstawianego jako osiqgniqcie naukowe, na uwage zastugujq prace dotyczqce
analizy porownawczej w sygnalizacji PACAP i VIP w m6zgu krqgowcbw, wptywu mutacji
genow PACAP i VIP na rozwoj postnatalny u myszy, hamujqcego wptywu PACAP na
powstawanie rdzeniaka zarodkowego u myszy z mutacjq ptchl, wptywu receptorow LXR na
sygnalizacjq Hh, funkcji miozyny VI w rozwoju komorek miqiniowych.
SpojnoSC problematyki tych wszystkich prac wskazuje, ze Habilitant byt nie tylko
wykonawcq doiwiadczeri oraz obserwacji, ale uczestniczyt w formutowaniu koncepcji badari i
przygotowaniu tekstow publikacji.
Wszyscy cztonkowie komisji uznali dorobek naukowy dr. Pawta Niewiadomskiego za
bardzo dobry.
Grantv krajowe i miedzvnarodowe
Doiwiadczenie w kierowaniu projektami badawczymi dr Pawet Niewiadomski
aktualnie zdobywa, gdyz uzyskat finansowanie z Narodowego Centrum Nauki (NCN) na
realizacjq 2 grantow afiliowanych w lnstytucie Biologii Doiwiadczalnej im. M. Nenckiego PAN
w Warszawie oraz Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego (ukonczenie
projektow planowane jest na 2018 r. i 2020 r.). Dodatkowo byt wspotautorem i gtownym
wykonawcq dw6ch projektow finansowanych przez National Institutes of Health (NIH),
zrealizowanych w University of California Los Angeles i Stanford University w latach 20112012. Ponadto, od 2005 do 2015 roku byt wykonawcq (jak to okreila w autoreferacie wspohvykonawcq) 4 projektow, ktore wykonywano w ramach Sontag Foundation
Distinguished Scientist Award, V Foundation Scholar Award oraz finansowanych przez NIH i
NCN; ich realizacja, podobnie jak poprzednich projektow odbywata siq w University of
California Los Angeles ( 1 projekt), Stanford University (2 projekty) oraz w lnstytucie Biologii
Doiwiadczalnej im. M. Nenckiego PAN w Warszawie (1projekt).
Podsumowujqc Komisja uwaza, i e dr Pawet Niewiadomski ma bardzo dobre
doiwiadczenie w zdobywaniu funduszy na badania. Z kolei udokumentowane bardzo
dobrymi publikacjami doiwiadczenie, jakie uzyskat w wiodqcych oirodkach naukowych na
iwiecie, gwarantuje i e projekty ktorymi aktualnie kieruje zostanq zrealizowane.
Dorobek dvdaktvcznv i popularvzatorski
Dziatalnoid dydaktyczna dr. Pawta Niewiadomskiego zwiqzana byta z prowadzeniem
zajqd kursowych dla studentow na dwoch uczelniach - Uniwersytecie todzkim i
Uniwersytecie Medycznym w kodzi. Na pierwszej z wymienionych uczelni zwiqzany byt z
Wydziatem Matematyki, gdzie prowadzit Cwiczenia w ramach tzw. laboratoriow
komputerowych ,Projektowanie i implementacja systemdw sieciowych" i ,,Sieci
komputerowe 2", a takie wyktady ,,Sieci komputerowe". Na podkreilenie zastuguje, i e
program wymienionych zajqd miat charakter autorski i zostat stworzony przez dr.
Niewiadomskiego. Z kolei na UM w todzi zaangaiowany byt w realizacje zajed w ramach
trzech przedmiotow: ,,FarmakodynamikaM (na Wydziale Farmacji i Oddziale Analityki
Medycznej), ,,FarmakologiaM (na Wydziale Lekarskim) oraz ,,BiostatystykaW(na Wydziale
Nauk Biomedycznych i Ksztatcenia Podyplomowego, Kierunku Biotechnologia Medyczna). Dr
Niewiadomski byt autorem materiatow w j. polskim i j. angielskim, ktdre wykorzystywali
studenci odbywajqc zajecia w ramach wyiej wymienionych przedmiotow.
Habilitant nie byt dotychczas opiekunem naukowym prac licencjackich, magisterskich,
ani promotorem lub promotorem pomocniczym prac doktorskich w rozumieniu ustawowym.
Uczestniczyt natomiast w organizacji zajet dla studentow-wolontariuszy podczas staiu w
University of California Los Angeles i w Stanford University. W tym czasie opiekowat siq 5
studentami, i co godne podkreilenia, owocem tej wspotpracy byto wtqczenie niektorych
spoirod nich do grona autorow publikacji naukowej. W latach 2006-2009 petnit role
opiekuna naukowego doktoranta w University of California Los Angeles, a od 2015 r.
podobnq role petni na Uniwersytecie Warszawskim.
DziatalnoSt popularyzatorska Habilitanta ogranicza sie do prowadzenia blogu o
tematyce naukowej, w ktorym porusza wraz z czytelnikami problematykq dotyczqcq
prowadzenia badari naukowych w Polsce i zagranicq.
Komisja pozytywnie ocenita dziatalnoit dydaktycznq i popularyzatorskqdr. Pawta
Niewiadomskiego.
Staie zagraniczne, wsp&praca miedzvnarodowa oraz udziat w konferenciach
naukowvch
Habilitant w latach 2005-2012 odbyt 2 bardzo znaczqce staie naukowe - w David
Geffen School of Medicine w University of California Los Angeles (lata 2005-2009;
laboratorium kierowane przez dr. Jamesa A. Waschek) oraz w Stanford University (lata 20102012; laboratorium kierowane przez dr. Rajata Rohatgi). W obu wymienionych oirodkach
Habilitant zatrudniony byt jako wykonawca projektow (post-doctoral researcherladiunkt
naukowy).
Dr Niewiadomski brat udziat w 10 miedzynarodowych konferencjach o wysokiej
randze. Podczas tych zjazd6w wygtosit 1wyktad. Podsumowujqc, Cztonkowie Komisji
stwierdzajq, i e Kandydat ma miedzynarodowe doiwiadczenie we wspotpracy naukowej,
aczkolwiek niewielkie w prezentowaniu wynikow podczas konferencji.
Krotkie odniesienia d o recenzji
Wszyscy Panstwo Recenzenci dobrze ocenili wniosek dr. Niewiadomskiego pod
wzgledem formalnym. Kaidy z recenzentow wyrazit bardzo pozytywnq opinie o dorobku
naukowym Habilitanta. Pan Prof. dr hab. Michat Witt wskazuje, ze ,,stanowi on catoid
merytorycznie spojnq i konsekwentnq, iwiadczqcq o skoncentrowanym spojrzeniu na
tematyke badawczq. Jest t o cykl prac badawczych, ktory w catoici oceniC naleiy jako bardzo
dobry, wnoszqcy istotny wktad do wiedzy w obszarze zainteresowan". Pan Prof. dr hab.
Grzegorz Wegrzyn wskazuje na ,,bezdyskusyjnie wysokq aktywnoid Pana doktora Pawta
Niewiadomskiego w prowadzeniu badan naukowych i wspotpracy z innymi naukowcami", o
czym iwiadczq liczne, dobrze opublikowane prace, ktore nie zostaty ujete w osiqgnieciu
habilitacyjnym. Z kolei Pani Prof. dr hab. n. med. Anna Latos-Bielenska ,,oceniajqc catoiC
dorobku naukowego Dr n. farm. Pawta Niewiadomskiego [stwierdza], ze jest on wartoiciowy
i wystarczajqcy do uzyskania stopnia naukowego doktora habilitowanego. Habilitant [wg Pani
Profesor] podejmuje aktualne tematy badawcze, [a Jego] prace zostaty docenione przez
irodowisko i sq dobrze cytowane". Wszyscy recenzenci rownie wysoko ocenili takze samo
osiqgniecie habilitacyjne dr. Niewiadomskiego. Pan Prof. Witt uwaia dorobek ,,jako
naukowo wazki i wnoszqcy istotne novum do nauki i naszej wiedzy o mechanizmach szlaku
sygnatowego Hh, chod jego formalna konstrukcja budzi - wg Pana Profesora - pewne
zastrzeienia". Wskazuje bowiem, ze zamieszczenie w osiqgnieciu az 3 rozdziatow o
charakterze metodycznym, ktore sq pozycjami bez IF, nie jest w petni uzasadnione,
szczegolnie gdy stanowiq one w tej sytuacji ponad 40% osiqgniqcia. Pan Prof. Wqgrzyn
uwaia, ze ,,publikacje wchodzqce w sktad osiqgniecia naukowego Pana doktora Pawta
Niewiadomskiego cechujq siq bardzo wysokim poziomem merytorycznym" i nadmienia ze
dwa z nich zostaty opublikowane w czasopismach, ktore ,,nalezq do najbardziej prestizowych
periodykow naukowych w dziedzinie nauk biologicznych". Z kolei Pani Prof. Latos-Bielehska
stwierdza, ze ,,to, co zwraca szczegolnq uwagq w ocenie cyklu prac [stanowiqcych osiqgniecie
habilitacyjne] t o oryginalne hipotezy badawcze i ich umiejqtne udowodnienie wymagajqce
opracowania przez Habilitanta nowatorskich metod badari i szerokie wspotprace naukowe
na zasadach partnerskich z doskonatymi oirodkami iwiatowymi". Pani Profesor podkresla, ze
,,omawiane prace Habilitanta zostaty dostrzeione i docenione [w] jrodowisku badaczy, o
czym jwiadczy liczba [ich] cytowari". Recenzenci pozytywnie ocenili takie dorobek
dydaktyczny i organizacyjny Habilitanta. Wszyscy stwierdzili, i e osiqgniecie naukowe
przedstawionejako podstawa postqpowania habilitacyjnego, ktorym jest cykl siedmiu
publikacji opatrzonych wspolnym tytutem "Mechanizmy molekularne sygnalizacji Hedgehog
- wptyw rzqski pierwotnej i szlaku cykliczne AMPIkinaza biatkowa A ",spetnia wymagania
okreflone w art. 16 Ustawy z dnia 14 marca 2003 r. o stopniach i tytule naukowym oraz o
stopniach i tytule w zakresie sztuki, w brzmieniu ustalonym Ustawq z dnia 18 marca 2011 r.
(Dz. U. z 2011, nr 84, poz. 455). Wszystkie recenzje koriczq sie jednoznacznym wnioskiem o
nadanie dr. Pawtowi Niewiadomskiemu stopnia naukowego doktora habilitowanego.
Opinia Komisji Habilitacvjnei
Wszyscy cztonkowie Komisji habilitacyjnej bardzo pozytywnie ocenili wartojC
merytorycznq osiqgniecia naukowego i pozostatego dorobku naukowego Pana dr. Pawta
Niewiadomskiego, a takie Jego mobilnoSC naukowq i pozostatq aktywnoSC naukowq. W
gtosowaniu jawnym cztonkowie Komisji zagtosowali za wnioskiem o nadaniel-r.
s
Pawtowi Niewiadomskiemu stopnia doktora habilitowanego w dziedzinie nauki biologiczne w
1Q
dyscyplinie biologia
osow przeciw,l-gtosow wstrzymujqcych sie).
fl
Warszawa, 06.06.2016
Dr hab. Piotr Bqbas
9~ yfit+&
Pro . dr hab. Z la Szweykows a- ulinska