Serwery aplikacji i usług w medycynie

Politechnika Gdańska, międzywydziałowy kierunek „INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA”
KONSPEKT PRZEDMIOTU
PIERWSZEGO POZIOMU STUDIÓW STACJONARNYCH
Nazwa przedmiotu Serwery aplikacji i usług w medycynie
Skrót:
Semestry:
Punkty ECTS:
VII
Rodzaj przedmiotu:
Liczba godzin w semestrze:
Wykład
Semestr VII
15
Strumień/profil:
chemia w medycynie
kierunkowy w strumieniu IWM
Ćwiczenia
Laboratorium
15
elektronika w medycynie
Osoba odpowiedzialna za przedmiot:
Imię:
Adam
E-mail: [email protected]
Projekt
Seminarium
fizyka w medycynie
Nazwisko:
Telefon:
SAIUM
3
Łącznie
30
informatyka w medycynie
X
Bujnowski
583471684
Lokal:
105 WETI
Cele przedmiotu:
Celem przedmiotu jest zapoznanie studentów z metodami reprezentacji danych multimedialnych oraz ich wymiany i
składowania. W sposób szczególny zostanie przedstawiony problem wymiany multimedialnych danych medycznych.
Ważnym celem szczegółowym jest ukazanie trendów w zakresie normalizacji wymiany danych multimedialnych (również w
medycynie) co stanowi podstawę współpracy systemów wytwarzanych przez różnych producentów. Zakłada się, że
przedstawiane treści kształcenia w zakresie tego przedmiotu powinny zachęcać do samodzielnego poszerzania wiedzy z
wykorzystaniem udostępnionych w ramach przedmiotu elementów edukacji na odległość jak i innych zasobów
elektronicznych.
Spodziewane efekty kształcenia - umiejętności i kompetencje:
- interpretacji formatu zapisu multimedialnych danych medycznych (DICOM, HL7),
- projektowania struktur danych multimedialnych danych medycznych (DICOM, HL7),
- doboru metod kompresji danych multimedialnych,
- projektowania systemów wymiany danych multimedialnych z uwzględnieniem ograniczeń w medycynie,
- opisu treści danych multimedialnych,
- projektowania interfejsów z wyszukiwaniem danych multimedialnych na bazie ich treści (deskryptory),
- interpretacji norm i rekomendacji z zakresu składowania i wymiany danych multimedialnych,
- projektowania systemów archiwizacji danych,
- zabezpieczania systemów archiwizacji danych.
Karta zajęć - wykład
Lp.
Zagadnienie
Poziom
wiedzy
A
B
C
umiejętności
D
E
Liczba
godzin
1.
Zagadnienia prawne dotyczące składowania i
przetwarzania danych medycznych
2.
Architektury serwerów. Podstawowe bloki funkcjonalne serwerów,
własności i wymagania. Maszyny wieloprocesorowe i klastry.
Serwerownie.
X
1
3.
X
1
X
1
5.
Architektury serwerów aplikacji
System operacyjny jako usługa sieciowa
Serwery poczty elektronicznej SMTP, POP
X
1
6.
7.
Serwery usług plikowych – FTP SFTP
Serwery usług plikowych - NFS SAMBA CIFS
X
X
1
1
4.
1
X
Politechnika Gdańska, międzywydziałowy kierunek „INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA”
8.0
7.2
009
9.
10.
11.
12.
13.
14.
X
Serwery usług informacyjnych – usługa news
Serwery usług informacyjnych - HTTP
1
X
Serwery usług informacyjnych – HTTP –CGI, applety
X
Serwery usług informacyjnych – HTTP - serwlety
Kontenery serwletów - TOMCAT
Serwery aplikacji J2EE, JBOSS
Serwery aplikacji w technologii .NET
X
1
1
1
1
1
1
X
X
X
X
Komponenty serwerów aplikacji i przegląd rozwiązań w
medycynie
Razem: 15
Karta zajęć - laboratorium
Zagadnienie
Lp.
Poziom
wiedzy
A
B
C
1.
2.
3.
4.
5.
Liczba
godzin
umiejętności
D
E
Serwery wymiany plików – ftp NFS SAMBA konfiguracja
administracja
Konfiguracja serwerów informacyjnych – http https bazy danych
konfiguracja administracja podstawy zarzadzania
Kontenery serwletów na przykładzie TOMCAT
Tworzenie serwisów z wykorzystaniem technologii AJAX
Konfiguracja i administracja serwerami poczty elektronicznej.
System operacyjny jako usługa zdalna
X
3
X
3
X
X
X
3
3
3
Razem: 15
Próg zaliczenia:
Semestr: VI
z wykładu
31/60
z ćwiczeń
Warunki zaliczenia przedmiotu
z laboratorium z projektu
20/40
z seminarium
Z CAŁOŚCI
51/100
Opis form zaliczenia
Wykład (semestr VI)
Id
Termin
1
Sesja
egzaminacyjna
Punkty
60
Zakres
Egzamin z przedmiotu
Razem: 60
Laboratorium (semestr VI)
Id
Termin
Punkty
1
Ćwiczenie 1
8
2
Ćwiczenie 2
8
3
Ćwiczenie 3
8
4
Ćwiczenie 4
8
5
Ćwiczenie 5
8
Razem: 40
Zakres
Zrealizowane zadania wg programu ćwiczenia laboratoryjnego nr 1
Zrealizowane zadania wg programu ćwiczenia laboratoryjnego nr 2
Zrealizowane zadania wg programu ćwiczenia laboratoryjnego nr 3
Zrealizowane zadania wg programu ćwiczenia laboratoryjnego nr 4
Zrealizowane zadania wg programu ćwiczenia laboratoryjnego nr 5
Uwagi dotyczące kryteriów zaliczenia:
Przedmiot kończy się egzaminem, którego zaliczenie wymaga zebrania ponad 50% punktów. Wcześniej wymagane jest
zaliczenie laboratorium. Ocena końcowa wyliczana jest na podstawie łącznej sumy gromadzonych punktów (przy zaliczeniu
obu części).
Lp.
1.
Przedmiot
Technologie
Przedmioty wyprzedzające wraz z wymaganiami wstępnymi
Zakres
1. Uruchamianie aplikacji
Projekt „Przygotowanie i realizacja kierunku inżynieria biomedyczna – studia międzywydziałowe”
współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Politechnika Gdańska, międzywydziałowy kierunek „INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA”
informacyjne
2.
Metody i techniki
programowania
3.
Bazy danych
1.1. Uruchamianie aplikacji z linii poleceń (terminal)
1.2. Uruchamianie aplikacji z poziomu interfejsu graficznego systemu operacyjnego
2. Konfiguracja komputera
2.1. Instalowanie oprogramowania
2.2. Ustawianie zmiennych środowiska
1. Budowa programu w programowaniu strukturalnym
1.1. Zmienne, typy danych, funkcje
1.2. Instrukcje sterujące
1.3. Kompilacja i wykonywanie programów
1.4. Podstawowe struktury danych
1.5. Umiejętność przejścia od pomysły, przez algorytm do programu
2. Budowa programu w programowaniu obiektowym
2.1. Projektowanie i zapis klas
2.2. Tworzenie i wykorzystywanie obiektów
2.3. Elementy paradygmatu obiektowego (abstrakcja, hermetyzacja, dziedziczenie,
polimorfizm)
2.4. Wykorzystywanie bibliotek klas
1. Modele danych.
1.1. Model hierarchiczny, podstawy.
1.2. Model relacyjny, podstawy.
1.4. Model obiektowy, podstawy.
2. Projektowanie baz danych.
2.1. Diagramy związków encji.
2.2. Diagramy relacyjne.
2.3. Normalizacja bazy relacyjnej.
3. Model relacyjny.
3.1. Tabele, pola, typy danych, klucze, związki, algebra relacji.
3.2. SQL – DDL, DML.
Metody dydaktyczne:
Wykład prowadzony będzie z wykorzystaniem projektora, za pomocą którego, nauczyciel zaprezentuje slajdy, ukazujące
treści przedmiotu. Ważniejsze problemy ilustrowane będą pokazami. Część wykładów (około 30%) zostanie zrealizowana z
wykorzystaniem metod i technik edukacji na odległość. Edukacja na odległość prowadzona będzie poprzez interaktywny
materiał dydaktyczny w połączeniu ze śledzeniem jego przyswajania przez studentów. Jednocześnie wykładowca będzie do
dyspozycji studentów w ramach forum tematycznego, jak również poprzez komunikator (chat). Wraz ze studentami
tworzyć będzie wirtualną grupę roboczą. Studenci po przejściu procesu interaktywnej edukacji (przedstawianie
interaktywnego materiału i testów) powinni wziąć udział w dyskusjach tematycznych prowadzonych w ramach forum jak i
komunikatora (przebieg dyskusji widoczny przez wszystkich członków grupy). Nauczyciel jest zobowiązany poświęcić i
udokumentować czas spędzony na prowadzeniu edukacji na odległość (w wymiarze co najmniej równym liczbie godzin
poświęconym na realizację danych treści wykładu w formie tradycyjnej).
Praktyczną ilustracją materiału przedstawianego w czasie wykładów są zajęcia laboratoryjne. Każdy student będzie miał do
dyspozycji komputer, na którym zainstaluje oprogramowanie wskazane przez prowadzącego laboratorium. Następnie
realizował będzie, zgodnie z ustalonymi terminami spotkań, kolejne ćwiczenia laboratoryjne. Do każdego ćwiczenia
laboratoryjnego udostępniona zostanie (na platformie edukacji na odległość) szczegółowa instrukcja z przykładami. Po
zapoznaniu się z instrukcją student wykona w sali laboratoryjnej kolejne zadania danego ćwiczenia (pod opieką i z pomocą
prowadzącego). Ocenie podlegać będzie przygotowanie studenta do zajęć i realizacja zadań wyznaczonych do
samodzielnego wykonania w czasie ćwiczenia. Zajęcia laboratoryjne rozpoczną się w drugim tygodniu wykładów.
Wykaz literatury podstawowej:
1. Skrypt z materiałami do przedmiotu „Wymiana i składowanie danych multimedialnych”
2. Materiały do przedmiotu opracowane w formie edukacji na odległość, dostęp: http://uno.biomed.gda.pl
3. NEMA, Norma DICOM, dostęp: http://medical.nema.org
4. HL7, norma i dokumenty HL7, dostęp: http://www.hl7.org
5. Metody i urządzenia do archiwizacji danych: http://www.storagestandard.pl/
6
K. R. Rao and P. Yip, Discrete Cosine Transform: Algorithms, Advantages, Applications (Academic Press, Boston,
1990).
7
N. Ahmed, T. Natarajan, and K. R. Rao, "Discrete Cosine Transform", IEEE Trans. Computers, 90-93, Jan 1974.
Projekt „Przygotowanie i realizacja kierunku inżynieria biomedyczna – studia międzywydziałowe”
współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Politechnika Gdańska, międzywydziałowy kierunek „INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA”
Wykaz literatury uzupełniającej:
1. Richardson, Iain E. G. , H.264 and MPEG-4 Video Compression: Video Coding for Next-generation Multimedia,
John Wiley & Sons, Ltd., 2003
2. B. S. Manjunath (Editor), Philippe Salembier (Editor), Thomas Sikora (Editor), Introduction to MPEG-7:
Multimedia Content Description Interface, Wiley, 2002
3. David Taubman (Editor), Michael Marcellin (Editor), JPEG2000: Image Compression Fundamentals, Standards
and Practice, Springer, 2001.
Projekt „Przygotowanie i realizacja kierunku inżynieria biomedyczna – studia międzywydziałowe”
współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.