Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM Zakład Biochemii Klinicznej
Transkrypt
Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM Zakład Biochemii Klinicznej
Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM Zakład Biochemii Klinicznej (nr KIDL 2213) 9 Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL: 2660) 9 Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL 2659) 9 Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL: 2661) Zakład Diagnostyki Genetycznej i Nurigenomiki 9 Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Diagnostyki (nr KIDL: 2214) Zakład Diagnostyki ( Medycyna Laboratoryjna)) 9 Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki (nr KIDL: 2951) Chair and Department of Clinical Biochemistry The Jagiellonian University Medical College (JUMC) JUMC Prof. dr hab. med. Aldona Dembińska-Kieć Office: Joanna Rusek Cell Culture and Immunofluorescence Microscopy Labs Urszula Raznyy Urszula Cialowicz Urszula Czech Anna Knapp pp Magdalena Korczynska Outpatient Clinic of Lipid Disorders and Obesity Malgorzata Malczewska-Malec Malczewska Malec Julita Stancel-Mozwillo Iwona Leszczynska-Golabek Dominika Siedlecka Dept and Chair of Metabolic Disease JUMC Dept and Chair of Endocrinology JUMC Dept.of Pathology JUMC MAŁOPOLSKIE CENTRUM BIOTECHNOLIOGII UJ Biochemistry Labs Anna Gruca Joanna Góralska Agnieszka Sliwa Anna Zdzienicka Malgorzata Kwasniak Molecular Biology and Genetics Lab Iwona Wybranska Barbara Nowak Anna Polus LIP Bioclaims consortium Beata Kiec-Wilk Teresa Staszel Magdalena Mikolajczyk Lukasz Kaczynski GENE 9 Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2660 9 9 9 9 9 9 9 9 Hodowle pierwotnych komórek oraz linii komórek nowotworowych Obrazowanie przyżyciowe procesów komórkowych (BIOIMAGER) Izolacja j DNA,, RNA , białek Badanie ekspresji genów techniką Real-Time PCR (7900HT Fast system) Badanie ekspresji genów w technice mikromacierzowej w oparciu o 7900 HF Fast System Wykrywanie zakażeń wirusowych, bakteryjnych lub grzybowych w oparciu o techniki RT-PCR Oznaczenia ilościowe i identyfikacja mikroorganizmów w lekach i żywności w oparciu o techniki RT-PCR Oznaczanie białek metodą western western-blot blot 9 Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL 2659 9 9 9 Oznaczenia ilościowe wolnych kwasów tłuszczowych Oznaczenia parametrów stresu oksydacyjnego Badanie funkcji metabolicznej mitochondriów (poziom zużycia tlenu elektroda tlenowa (OROBOROS), produkcja ATP) 9 Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznejj nr KIDL: 2661 9 9 Analiza cytokin, czynników wzrostu i hormonów metodami RIA i ELISA Wykonanie oznaczeń z wykorzystaniem cytofluorymetru przepływowego CANTO II Becton Dickinson (np. badanie apoptozy, badanie funkcji mitochondriów) 9 Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Diagnostyki Genetycznej i Nurigenomiki nr KIDL: 2214 9 9 9 Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą metody RFLP Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą techniki Real Real-Time Time PCR Wykrywanie nowych lub znanych mutacji/polimorfizmów metodą sekwencjonowania 9 Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki nr KIDL: 2951 9 Markery i parametry związane z obrotem kostnym, interleukiny i chemokiny, czynniki wzrostowe, selektyny, proteazy i ich inhibitory; hormony, markery krzepnięcia i fibrynolizy, cząsteczki adhezyjne i in. Istnieje też możliwość wykonania podstawowych badań biochemicznych. 9 METODY BILOGII MOLEKULARNEJ: Badanie ekspresji genów: TaqMan Applied microarray system (TLDA) oparty na reakcji Real –time Sekwencjonowanie metodą cykliczną : 3130xl Genetic Analyzer, Applied Biosystems Reakcja amplifikacji PCR (LabCycler), ocena jakości materiału genetycznego(Spectrophotometer NanoDrop) ■ Analiza wybranych parametrów komórek z wykorzystaniem cytometrii przepływowej: p py j FACS Canto II firmy y Becton Dickinson ■ Pracownia hodowli komórek Metody obrazowania komórek przy użyciu: mikroskopu BD Pathway 855 barwienie komórek utrwalonych ilościowe obrazowanie zmian ekspresji białek PAT, białek stresu ER, kropli lipidowych ADRP Koneksyna 43 Hoechst Białko Bodipy Krople lipidowe Kalregulina Wizualizacja ekspresji wybranych białek w komórkach SVF pod wpływem TNFα barwienie komórek przyżyciowe ilościowe obrazowanie zmian w potencjale błon mitochondrialnych (MMP, ΔΨ) BD Pathway 855 High-Content C C Cell Analysis Workflow ctrl CCCP EPA PA Hoechst MMP Zmiany MMP(ΔΨ) w komórkach SVF pod wpływem kwasów tłuszczowych BADANIE FUNKCJI ENERGETYCZNYCH MITOCHONDRIÓW: ■ Pomiar procesów oddechowych mitochondriów: elektroda tlenowrażliwa Oxygraph-2k OROBOROS ■ Pomiar g generacji j ATP: metoda luminescencji j z wykorzystaniem y y kitu: ATP Lite,Parkin Elmer Kit oraz czytnika GENios TECAN Reader Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (2000-2009) zrealizowane w latach 2000-2008: INCO-COPERNICUS; POLONIUM. COST-918 Action: Body y Weight g and Energy gy Expenditure, p , Functional Food and Energy gy Expenditure COST-B17 action Insulin resistance, obesity and diabetes mellitus in the elderly COST -926 “Impact of new technologies on the health benefits and safety of bioactive plant compounds compounds” DLARFID “Dietary lipids as Risk Factors in Development. Mechanistic Issues QLK1-CT-200100183 Stem Cells Excellence Center in Poland, QLK3-CT-2002-30307 acronym STEC, Integrated project SC&CR RTD: "Application and Process Optimization of Stem Cell Products for Myocardial Repair" (Contract no: 502988). LIPGEN: Diet, genomics and the metabolic syndrome: an integrated nutrition, agro-food, social and economic analysis dietary fat modification, genotype and the metabolic syndrome (contract nr. FOOD-CT-2003-505944). Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (realizowane 2009/2010): COST- FA 0602COST 0602 “BIOACTVE FOOD COMPONENTS, COMPONENTS MITOCHONDRIAL FUNCTION AND HEALTH” COST BM 0602 Adipose tissue: A key target for prevention of the metabolic syndrome The European Network of Excellence: " The European Nutrigenomics Organisation linking genomics, nutrition and health research" NuGO (contract nr FP6-2004-506360) Lipid droplets as dynamic organelles connecting influx, f efflux, ff and storage off lipids: Translational research towards human disease “Lipid droplets” LipidomicNet „Ochrona Ochrona przed zwyrodnieniem układu nerwowego: rola peptydów endogennych endogennych, L L-argininy argininy i kwasów tłuszczowych jako potencjalnych czynników modulujących czynność mitochondriów, zwiększających żywotność mózgu poddanego działaniu bodźców stresowych” (PNRF-104-AI-1/07) BIOmarkers of Robustness of Metabolic Homeostasis for Nutrigenomics-derived Health CLAIMS Made on Food (FP7-KBBE-2009-3 nr 244995) Bioclaims Zapraszamy do współdziałania z Katedrą Biochemii Klinicznej CM UJ w ramach projektu „Interdyscyplinarne I t d li Studia St di Doktoranckie D kt ki „Nauki molekularne dla medycyny”