instrukcja 2
Transkrypt
instrukcja 2
LABORATORIUM 2 Oczyszczanie oksydazy polifenolowej (PPO) wyizolowanej z pieczarek – proces wysalania siarczanem amonu oraz wytrącania acetonem CEL ĆWICZENIA: Zapoznanie się z przykładową procedurą oczyszczania enzymu poprzez selektywne wysalanie surowego ekstraktu enzymatycznego z zastosowaniem siarczanu amonu oraz wytrącanie acetonem. PRZEBIEG DOŚWIADCZENIA I. WYSALANIE SIARCZANEM AMONU Roztwór z poprzednich ćwiczeń = surowy ekstrakt enzymu do wysalania objętość V1=30 mL (próbka 1) UWAGA!!! Przed rozpoczęciem wysalania pobrać próbkę z roztworu wyjściowego (ok. 5 mL), a do procesu odmierzyć dokładnie 30 mL. 1. I wysolenie przy użyciu NH2SO4 (30% wysycenia) na 1 L supernatantu dodać 176 g NH2SO4 i mieszać na mieszadle magnetycznym (4 oC) przez 30 minut; 2. Po tym czasie mieszaninę wirować przez 20 min przy 8000 obr/min w temp. 4oC; 3. Po odwirowaniu OSAD I (próbka 2) rozpuścić w minimalnej ilości (ok. 5-10 mL) 0,1 M buforu fosforanowego o pH 7.0 i trzymać w lodzie do analityki; 4. SUPERNATANT I (próbka 3) wysalać ponownie NH2SO4; 5. II wysolenie (60% wysycenia) na 1 L supernatantu dodać 195 g NH2SO4 i mieszać na mieszadle magnetycznym (4 oC) przez 30 minut; 6. Po tym czasie mieszaninę wirować przez 20 min przy 8000 obr/min w temp. 4oC; 7. Po odwirowaniu OSAD II (próbka 4) rozpuścić w minimalnej objętości 0,1 M buforu fosforanowego o pH 7.0 (max. 10 – 12 mL !!!); 8. SUPERNATANT II pozostawić do oznaczeń; 9. Wszystkie próbki do momentu oznaczeń przechowywać w lodzie; 10. Koniecznie zapisać objętości wszystkich roztworów !!!; 11. We wszystkich próbkach oznaczyć aktywność tyrozynazy, stężenie białka metodą Lowry’ego oraz absorbancję przy 280 nm. Próbka 1 surowy ekstrakt enzymu – aktywność tyrozynazy do oznaczenia; Próbka 2 osad w buforze po I wysoleniu – brak lub b. niska aktywność tyrozynazy; Próbka 3 supernantant po I wysoleniu – aktywność tyrozynazy wyższa niż w próbce I – jest to r-r tyrozynazy do II wysolenia; Próbka 4 osad w buforze po II wysoleniu – w tej próbce powinna być najwyższa aktywność tyrozynazy (r-r enzymu oczyszczony ok.2 – 4 razy); Próbka 5 supernatant po II wysoleniu – brak lub b.b. niska aktywność tyrozynazy. II. WYTRĄCANIE ACETONEM Do procesu odmierzyć dokładnie 30 mL. 1. Do surowego ekstraktu enzymu (próbka 1’) dodać acetonu schłodzonego do temperatury około -20 ºC w proporcji 1:1,5 (enzym:aceton) i umieścić tak sporządzony roztwór w zamrażalce do czasu utworzenia się wyraźnego osadu (40 minut). 2. Powstałą zawiesinę białka odwirować (20 min przy 8000 obr/min w temp. 4oC). 3. Supernatant odrzucić, a osad rozpuścić w minimalnej objętości 0,1 M buforu fosforanowego o pH 7.0 (max. 10 – 12 mL !!!) (próbka 2’). 4. Wszystkie próbki do momentu oznaczeń przechowywać w lodzie; 5. Koniecznie zapisać objętości wszystkich roztworów !!!; 6. We wszystkich próbkach oznaczyć aktywność tyrozynazy, stężenie białka metodą Lowry’ego oraz absorbancję przy 280 nm. Próbka 1’ surowy ekstrakt enzymu– aktywność tyrozynazy do oznaczenia; Próbka 2’ osad w buforze uzyskany po wytrącaniu w acetonie w tej próbce powinna być najwyższa aktywność tyrozynazy PRZYGOTOWANIE KOLUMNY DO FILTRACJI ŻELOWEJ (Sephadex G-50, kolumna o obj. 50 mL) – szczegółowe dane poda prowadząca ćwiczenia. OZNACZANIE AKTYWNOŚCI ENZYMATYCZNEJ Pomiar aktywności enzymu natywnego prowadzić w temperaturze pokojowej, w 0,1 M buforze fosforanowym o pH 7,0 i w obecności 1 mM L-Tyrozyny lub L-DOPA jako substratu. W procedurze standardowej do 1,0 ml substratu dodać 100 μl roztworu enzymu, szybko zmieszać i przenieść do kuwety. Następnie przy użyciu spektrofotometru UV/Vis monitorować zmiany absorbancji w czasie przy długości fali λ= 475 nm. Przed pomiarami aparat wyzerować na roztwór substratu. Aktywność enzymu wyrazić liczbą jednostek aktywności w 1 mL roztworu tyrozynazy według wzoru: 1000 1 U 1000 Aktywność min mL mL A475 nm VR t VE (1) gdzie: ΔA475nm – zmiana absorbancji w czasie Δt, w liniowym zakresie pomiaru przy długości fali 475 nm [min-1]; VR – całkowita objętość analizowanego roztworu (1,1 mL) [mL]; VE – objętość enzymu użytego w pomiarach (0,1 mL) [mL]. OZNACZANIE STĘŻENIA BIAŁKA Ilość białka w badanych preparatach tyrozynazy oznaczano metodą Lowry’ego [6] przy użyciu testu Sigma 5656. Stężenie białka w badanych próbkach wyznaczano na podstawie krzywej standardowej, wykonanej dla albuminy wołowej w zakresie stężeń od 10 do 400 μg.mL-1. Procedura postępowania: - 0.5 ml próbki enzymu odpowiednio rozcieńczonej w wodzie + 0.5 ml odczynnika Lowry’ego; - przygotować również próbkę zerową 0.5 ml H2O + 0.5 ml odczynnika Lowry’ego; - tak przygotowane próbki wymieszać i zostawić na 20 min w temperaturze pokojowej; - po 20 minutach dodać 0,25 ml odczynnika Follina i natychmiast po dodaniu każdą próbkę dokładnie wymieszać!!!! i odstawić na 30 min; - po upływie 30 min od dodania odczynnika Follina zmierzyć Abs próbek przy λ=750 nm; - wynik w [mg.mL-1] obliczyć na podstawie krzywej wzorcowej: Cbiałka=[(214,1.A750 + 114,6).A750.R]/1000, gdzie R – rozcieńczenie próbki enzymu PRZYGOTOWANIE ROZTWORÓW 0,1 M bufor fosforanowy o pH 7.0 5,28 g KH2PO4 21,91 g Na2HPO4 Dopełnić wodą destylowaną do 1 L 1 mM L-Tyrozyna (M=181,2 g/mol) 1 mM L-DOPA (M=197,19 g/mol) NA KOLEJNEJ STRONIE ARKUSZ WYNIKÓW ARKUSZ WYNIKÓW WYSALANIE SARCZANEM AMONU Pomiary aktywności . Próbka Rpróbki Pomiary stężenia białka Metoda Lowry’ego Absorbancja A280 (dA475/min) R Aktywność [min-1] [U.mL-1] Rpróbki Cbiałka . A280 R Rpróbki A750 [mg.mL-1] 1 2 3 4 5 WYTRĄCANIE ACETONEM Pomiary aktywności Próbka Rpróbki 1’ 2’ Pomiary stężenia białka Metoda Lowry’ego Absorbancja A280 (dA475/min).R Aktywność [min-1] [U.mL-1] Rpróbki A280.R Cbiałka Rpróbki A750 [mg.mL-1]