Odkryto nowy układ naczyniowy u ssaków!,Menedżer

Czy
żywność
modyfikowana
genetycznie rzeczywiście powoduje
raka?
Kilka dni temu prasa podała sensacyjną wiadomość, jakoby żywność
modyfikowana genetycznie powodowała raka. Czy autorzy pracy mogli
manipulować wynikami?
Zobacz: Szczury karmione żywnością GMO częściej chorują na raka.
Zespół francuskich badaczy donosił w czasopiśmie „Food and Chemical
Toxicology” http://research.sustainablefoodtrust.org/wp-content/uploads/2012/09
/Final-Paper.pdf 0 wywołanych u szczurów karmionych żywnością GMO „guzów
nowotworowych wielkości piłki tenisowej”.
Wyniki te były zaskakujące dla opinii publicznej. Obecnie głos zabierają eksperci,
którzy dopatrują się w publikacji kontekstu politycznego. Zarzucają oni badaczom
nieprawidłowości przy planowaniu eksperymentów, manipulację danymi, zbyt
małe próby badanych szczurów, zbyt małe próby kontrolne (zaledwie 10 samców i
10 samic!), nieprawidłową interpretację przytaczanych wyników (!) oraz
przytaczają informację, ze jeden ze współautorów pracy jest osoba niewiarygodną
w świecie naukowym, działającą aktywnie na rzecz lobby homeopatycznego.
Co więcej – autorzy publikacji opublikowali wcześniej książkę o rzekomych
zagrożeniach GMO, działają również w CRIIGEN, – organizacji dedykowanej
lobbingowi przeciwko GMO.
Nasz portal z uwaga będzie przyglądał się dalszemu rozwojowi wypadków w tej
sprawie.
Zobacz polemikę na łamach magazynu „Forbes”:
http://www.forbes.com/sites/stevensalzberg/2012/09/24/does-genetically-modifiedcorn-cause-cancer-a-flawed-study/
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
ENCODE – nowe zaskakujące dane
na temat genomu człowieka.
Kolejny raz następuje zmiana dotychczasowych poglądów na genom
człowieka. Okazuje się, że znacznie większa część genomu Homo sapiens
niż dotychczas sądzono zawiera kodujące DNA, a śmieciowe DNA
niekoniecznie musi zawierać nic nie warte sekwencje. Nowe ustalenia
dotyczące genomu ludzkiego publikuje dzisiaj konsorcjum ENCODE pod
przewodnictwem uniwersytetu w Cambridge, na łamach magazynów
„Nature”, „Science”, „Cell”, „Genome Biology” i „Genome Research”.
W przedsięwzięciu ENCODE uczestniczyło ponad 400 specjalistów z USA, Wielkiej
Brytanii, Hiszpanii, Japonii i Singapuru. W 2003 roku opublikowali oni pierwsze
„wydanie” Encyklopedii Elementów DNA właśnie zwanej „Encode, w której
zawarto dane o zsekwencjonowaniu genomu człowieka. Obecnie badacze w
znaczący sposób poszerzyli dotychczasową wiedzę.
Do tej pory większość prac konsorcjum skupiona była na analizie fragmentów
kodujących białka, jednak konsorcjum ENCODE zajęło się również tzw.
śmieciowym DNA – o którym dotychczas sądzono, że nie pełni żadnej ważniejszej
funkcji i fragmenty te są pozostałością po rozwoju ewolucyjnym.
Tymczasem przełomowe wyniki uzyskane przez konsorcjum ENCODE świadczą o
tym, że znacznie większa część ludzkiego genomu, niż dotychczas sądzono, jest
aktywna biologicznie. Według badaczy w DNA uważanym dotychczas za
śmieciowe znajdują się ważne fragmenty regulatorowe ekspresji.
Oczywiście zaburzenia w budowie i tych fragmentów mogą być przyczyną bardzo
poważnych stanów chorobowych. Jak podają autorzy pracy dokładne zbadanie
tych mechanizmów regulacyjnych potrwa wiele lat, ale być może przyczyni się do
poznania molekularnych podstaw niektórych schorzeń.
Artykuły, które obligatoryjnie powinien przeczytać każdy, kto na poważnie
zajmuje się biologią molekularną i biotechnologią:
An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome
– The ENCODE Project Consortium
This overview of the ENCODE project outlines the data accumulated so far,
revealing that 80% of the human genome now has at least one biochemical
function assigned to it; the newly identified functional elements should aid the
interpretation of results of genome-wide association studies, as many correspond
to sites of association with human disease.
The accessible chromatin landscape of the human genome
Robert E. Thurman,
Eric Rynes,
Richard Humbert,
Jeff Vierstra,
Matthew T. Maurano
+ et al.
An extensive map of human DNase I hypersensitive sites, markers of regulatory
DNA, in 125 diverse cell and tissue types is described; integration of this
information with other ENCODE-generated data sets identifies new relationships
between chromatin accessibility, transcription, DNA methylation and regulatory
factor occupancy patterns.
An expansive human regulatory lexicon encoded in transcription
factor footprints
Shane Neph,
Jeff Vierstra,
Andrew B. Stergachis,
Alex P. Reynolds,
Eric Haugen
+ et al.
DNase I footprinting in 41 cell and tissue types reveals millions of short sequence
elements encoding an expansive repertoire of conserved recognition sequences
for DNA-binding proteins.
Architecture of the human regulatory network derived from
ENCODE data
Mark B. Gerstein,
Anshul Kundaje,
Manoj Hariharan,
Stephen G. Landt,
Koon-Kiu Yan
+ et al.
A description is given of the ENCODE consortium’s efforts to examine the
principles of human transcriptional regulatory networks; the results are
integrated with other genomic information to form a hierarchical meta-network
where different levels have distinct properties.
Landscape of transcription in human cells
Sarah Djebali,
Carrie A. Davis,
Angelika Merkel,
Alex Dobin,
Timo Lassmann
+ et al.
A description is given of the ENCODE effort to provide a complete catalogue of
primary and processed RNAs found either in specific subcellular compartments or
throughout the cell, revealing that three-quarters of the human genome can be
transcribed, and providing a wealth of information on the range and levels of
expression, localization, processing fates and modifications of known and
previously unannotated RNAs.
LETTER
The long-range interaction landscape of gene promoters
Amartya Sanyal,
Bryan R. Lajoie,
Gaurav Jain &
Job Dekker
Chromosome conformation capture carbon copy (5C) is used to look at the
relationships between functional elements and distal target genes in 1% of the
human genome in three dimensions; the study describes numerous long-range
interactions between promoters and distal sites that include elements resembling
enhancers, promoters and CTCF-bound sites, their genomic distribution and
complex interactions.
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
Czekolada chroni przed udarem
mózgu. Niestety tylko mężczyzn :(
Czekolada mleczna– spożywana z umiarem i co najważniejsze – regularnie
– obniża ryzyko wystąpienia udaru mózgu u mężczyzn. Te pomyślne dla
panów dane opublikowali w piśmie „Neurology” badacze z Instytutu
Karolinska w Sztokholmie.
Po przeanalizowaniu zwyczajów żywieniowych ponad 37 tys. mężczyzn ze
Szwecji, okazało się, że mężczyźni, którzy jedli większe ilości czekolady, byli mniej
narażeni na udar w porównaniu z panami, którzy w ogóle czekolady nie jedzą.
Ryzyko udaru malało aż o 14-17% u mężczyzn, którzy w tygodniu zjadali ponad
pół tabliczki czekolady.
Jak podkreślają badacze, to flawonoidy w czekoladzie chronią przed udarem
mózgu. Flawonoidy wykazują właściwości przeciwutleniające, przeciwzakrzepowe
i przeciwzapalne.
Publikacja
źródłowa: http://www.neurology.org/content/early/2012/08/29/WNL.0b013e31826
aacfa.abstract
Odkryto nowy układ naczyniowy u
ssaków!
Czy wydaje się Wam, że anatomia jest nauką martwą i nie ma już czego w
tej dziedzinie wiedzy odkrywać? Nic bardziej mylnego! 2 dni temu po
świecie rozeszła się wieść, że mamy nowy system naczyniowy w naszych
organizmach, a jest on zlokalizowany w mózgu.
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
Mózg nie posiada własnego unaczynienia limfatycznego. Ten dogmat anatomiczny
został właśnie obalony dzięki odkryciu neurobiologów z University of Rochester
Medical Center.
Nowy system krążenia jest „przytulony” do naczyń krwionośnych mózgu i działa
na zasadzie hydraulicznej, dlatego tak długo umykał uwadze neurologów.
Nazwany został „układem glimfatycznym” dla podkreślenia podobieństwa z
układem chłonnym. Dla zaakcentowania roli gleju , który jest jego głównym
elementem, została dopisana litera „g”.
Układ glimfatyczny pełni funkcję oczyszczającą dla mózgu- astrocyty które są jego
głównym elementem, przepuszczają niewielkie ilości płynu mózgowordzeniowego, jednocześnie odfiltrowując z niego nieprawidłowe białka, takie jak
amyloidy. Zanim płyn trafi do przestrzeni pływowych, skąd jest usuwany, jest
filtrowany właśnie przez układ glimfatyczny.
Neurobiologowie twierdzą, że może on odpowiadać za usuwanie złogów
białkowych, których kumulacja wywołuje choroby neurodegeneracyjne, takie jak
choroba Parkinsona.
Źródło: Sciencedaily
Menedżer BioTechScience – Studia
Podyplomowe
w
zakresie
zarządzania
projektami
badawczymi i komercjalizacji ich
wyników.
Studia Podyplomowe Menadżer BioTechScience to unikatowy program
finansowany z funduszy strukturalnych Unii Europejskiej, prowadzony
przez Uniwersytet Łódzki, w partnerstwie z Politechniką Łódzką i
Uniwersytetem Medycznym w Łodzi.
Projekt skierowany jest do pracowników instytutów badawczych i szkół wyższych
z terenu całej Polski.
Program studiów został opracowany na licencji Uniwersytetu Teksańskiego w
Austin (UT) – Master of Science and Technology Commercialization (MSSTC).
W ramach programu studiów podyplomowych (440h) zaplanowano realizację
czterech modułów edukacyjnych:
I. Ocena innowacji/technologii z punktu widzenia ich przydatności ekonomicznej.
II. Strategia komercjalizacji i planowanie przedsięwzięć.
III. Tworzenie biznes-planów dla nowych przedsięwzięć.
IV. Potencjał komercjalizacji w dziedzinie BIO.
Dla pięciorga najlepszych uczestników przewidziano wyjazd studyjny do Szwecji!
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
Sekwencjonowanie genomowe
potwierdziło, że każdy plemnik jest
wyjątkowy
Naukowcom ze Stanford udało się zsekwencjonować genomy pojedynczych
plemników pobranych od jednego mężczyzny. Zespół profesora Quake’a
potwierdził tym samym tezę, że każdy plemnik posiada inną kombinację
cech rodzicielskich i mutacji de novo.
Profesor Quake ze swoim zespołem nie tylko porównał materiał genetyczny 91
różnych plemników, stworzył także pierwsze mapy gorących miejsc rekombinacji i
mutacji, w których występuje najwięcej różnic pomiędzy poszczególnymi
gametami. Okazało się, że rekombinacja zachodzi średnio raz na chromosom (to
było wiadome z pośrednich obliczeń już wcześniej) i zachodzi nawet w dość
nietypowych miejscach chromosomów. Każdy plemnik niósł w sobie także ok.
25-36 całkowicie nowych mutacji, innych niż w przypadku organizmu
macierzystego – który różnił się reszty badanych plemników. Wśród
sekwencjonowanych plemników znalazły się także dwa „wybrakowane”, którym
brakowało któregoś z chromosomów.
By zsekwencjonować genomy pojedynczych komórek spermy, naukowcy
zastosowali nowatorską technikę mikrofluidyzacyjną, dzięki której wydajnie
amplifikowali genomy na potrzeby głębokiego sekwencjonowania.
Badacze ze Stanford wskazują na aplikacyjne zastosowanie swoich badań- rzucają
one zupełnie nowe światło na proces zmienności gatunkowej, rekombinacji
zachodzącej podczas mejozy, mogą rozszerzyć także możliwości w zakresie
diagnostyki zaburzeń płodności.
Źródło: Cell
Marzena Wojtaszewska
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
Chemikalia w codziennym życiu a
menopauza
Średnia długość życia statystycznej Polki wynosi niemalże 80 lat.
Menopauza występuje około 50 roku życia. Przytoczone dane świadczą o
tym, że prawie jedna trzecia życia pań przypada na okres po ustaniu
miesiączki.
Menopauza rozpoczyna kolejny etap egzystencji kobiety. W tym okresie na kobiety
czyha wiele zagrożeń – wzrasta ryzyko choroby wieńcowej, cukrzycy, raka sutka,
raka jelita grubego. Szczególnie dokuczliwym problemem są uderzenia gorąca,
obfite poty, suchość pochwy. Należy jednak pamiętać, że nieprzyjemnościom,
związanym z klimakterium, można zapobiec lub spróbować je zminimalizować.
Menopauza nie jest przecież chorobą, ale naturalnym procesem biologicznym.
Świadomość kobiet na temat menopauzy wzrasta z roku na rok. Również
naukowcy spostrzegli jak ważnym jest dokładne zbadanie mechanizmów
prowadzących do menopauzy oraz jej towarzyszących. Jedno z ostatnich badań
zostało ukierunkowane na określenie zależności przyczynowo-skutkowej pomiędzy
stężeniem perfluoroweglowodorów a menopauzą.
Podwyższony poziom PFC w organizmie wiąże się ze wzrostem nasilenia części
objawów związanych z menopauzą u kobiet między 42 a 64 rokiem życia.
Zaobserwowano także korelację pomiędzy wysokim stężeniem PFC, a istotnym
statystycznie obniżeniem poziomu estrogenu (względem grupy kontrolnej).
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
PFC to organiczne związki chemiczne, w których wszystkie atomy wodoru
zastąpione zostały atomami fluoru. Używane są w różnych produktach domowego
użytku począwszy od ubrań, dywanów, mebli, aż po farby. Swoją popularność
zawdzięczają łatwemu rozprzestrzenianiu się w wodzie, powietrzu, glebie oraz w
tkankach roślinnych, zwierzęcych i ludzkich. PFC podnoszą ryzyko wystąpienia
chorób sercowo-naczyniowych oraz osłabiają system immunologiczny.
Najnowsze badania nad wpływem PFC na wydzielanie endokrynne dowiodły, że
podwyższone stężenia PFC w surowicy krwi zwiększają prawdopodobieństwo
wystąpienia menopauzy u kobiet w okresie perimenopauzalnym.
W badaniu wzięło udział około 26 tysięcy kobiet w wieku 18 do 65 lat. Znaczącym
odkryciem było wykazanie związku pomiędzy stężeniem PFC w surowicy krwi a
obniżonym poziomem estradiolu i wystąpieniem wczesnej menopauzy u kobiet po
42 roku życia. Przyczyna takiej implikacji pozostaje nadal niejasna. Hipotetycznie
wyjaśnieniem wyżej wymienionego stanu może być brak utraty PFC z krwią
menstruacyjną, jednakże wskazywałoby to na wzrost poziomu PFC jako naturalny
efekt menopauzy. Nadal poszukuje się odpowiedzi na to pytanie.
Więcej na ten temat można przeczytać tutaj
Sondy translokacyjne SureFISH od
Agilent Technologies
Firma Agilent Technologies wprowadziła na rynek nowe, bardzo korzystne
cenowo sondy SureFISH – tym razem wykrywające translokacje. Istnieją
dwa rodzaje sond SureFISH dedykowanych translokacjom – są to sondy
typu „Break-apart” lub „Dual fusion probes”- sondy fuzyjne.
Sondy SureFISH typu „break-apart” są zaprojektowane aby hybrydyzować do
fragmentów genów znajdujących się na przeciwnych końcach miejsca złamania.
Każdy z tych punktów jest wyznakowany na inny kolor. W normalnej sytuacji, w
prawidłowych komórkach oba fragmenty znajdują się obok siebie, a kolory zlewają
się. W przypadku transkolacji fragmenty znajdują się daleko od siebie (1
chromosom) i pojawiają się osobne, ‘rozerwane’ sygnały (zielony i czerwony),
które nie są już zlokalizowane w tym samym miejscu. Drugi sygnał powinien nadal
być prawidłowy (2-gi chromosom).
Drugi rodzaj sond, tzw. sondy fuzyjne są zaprojektowane w taki sposób, aby
wykrywać miejsce fuzji w postaci zlania sygnałów. W przypadku tego typu sond,
wyznakowane są miejsca fuzyjne, które w prawidłowych komórkach są od siebie
odległe. Są one wyznakowane na dwa różne kolory (zielony i czerwony). W
przypadku translokacji, w której dochodzi do fuzji – pojawiają się sygnały
czerwony i zielony (prawidłowy chromosom) oraz żółty – będący efektem zlania
sygnałów na skutek translokacji.
W ofercie Agilent Technologies znajdziecie:
Dual Fusion Probes:
SureFISH BCR / ABL (DF)
chr22:23172168-24560508>>
chr9:133223275-133863499>>
Break Apart Probes:
SureFISH FGFR3 (BA)
chr4:1479160-1794711>>
chr4:1810639-1994868>>
SureFISH JAK2 (BA)
chr9:4700901-4987247>>
chr9:5348900-5851749>>
SureFISH MYC (BA)
chr8:128395875-128748429>>
chr8:128754954-128906787>>
SureFISH TMPRSS2 (BA)
chr21:42280582-42813912>>
chr21:42918815-43538473>>
Dystrybutorem sond translokacyjnych SureFISH jest firma Perlan
Technologies.
Studia podyplomowe „Medycyna
Molekularna
w
Praktyce
Klinicznej”
Jak informuje UJ i PTDL w roku akademickim 2012/2013 w Medycznym
Centrum Kształcenia Podyplomowego Uniwersytetu Jagiellońskiego
rozpoczną się interdyscyplinarne studia podyplomowe „Medycyna
molekularna w praktyce klinicznej”. Kierownikiem studiów jest prof. A.
Dembińska-Kieć.
Celem studiów ma być przeszkolenie słuchaczy w zakresie teorii oraz
praktycznego wykorzystania technik molekularnych służących do nowoczesnej
diagnostyki i terapii chorób w różnych dziedzinach medycyny. Studia mają
charakter interdyscyplinarny, wykłady będą prowadzone przez specjalistów wielu
dyscyplin medycznych z Uniwersytetu Jagiellońskiego –Collegium, Śląskiego
Uniwersytetu Medycznego, Centrum Onkologii – Instytut im. Marii SkłodowskiejCurie, Oddział w Krakowie oraz Gliwicach.
Cena studiów: 7500 zł za 3 semestry.
Więcej: http://www.ptdl.pl/download/Studia_Medycyna_Molekularna.pdf
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.
Genom banana opublikowany
Francuscy badacze rozszyfrowali genom banana chińskiego (Musa
acuminata), identyfikując ponad 36 tys. genów. Wyniki sekwencjonowania
genomu pomogą w ustaleniu, które geny odpowiadają za jakość owoców i
ich odporność na coraz częstsze, poważnie zagrażające plantacjom
choroby. Publikacja znajduje się w najnowszym numerze „Nature”.
Publikacja źródłowa: The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of
monocotyledonous plants.
Szczury żywione GMO, zdjęcie z cytowanej pracy francuskich naukowców.