KARTA KURSU

KARTA KURSU
Nazwa
Metody biologii molekularnej w ochronie środowiska
Nazwa w j. ang.
Molecular biological methods in environmental protection
Kod
Punktacja ECTS*
2
Zespół dydaktyczny
Koordynator
Dr Gabriela Gołębiowska-Pikania
Dr Katarzyna Gawrońska
Dr Gabriela Gołębiowska-Pikania
Dr Michał Nosek
Opis kursu (cele kształcenia)
Poznanie metod analizy molekularnej materiału biologicznego oraz metod izolacji i oczyszczania
substancji. Zapoznanie z zasadami pracy w laboratorium i materiałem biologicznym. Poznanie
metod pracy w warunkach sterylnych, sposobów izolacji białek, oczyszczania oraz określania ich
zawartości. Poznanie metodyki rozdziałów białek metodą elektroforezy. Zapoznanie z metodami
spektrofotometrycznymi. Kształtowanie umiejętności planowania eksperymentu naukowego.
Warunki wstępne
Wiedza
Umiejętności
Kursy
Znajomość właściwości biochemicznych i fizycznych składników budulcowych
komórek roślin i zwierząt. Znajomość własności tkanek roślinnych i
zwierzęcych
Podstawowe doświadczenie w pracy laboratoryjnej, w pracy z odczynnikami i
materiałem biologicznym oraz prostym sprzętem laboratoryjnym.
Biochemia, Chemia organiczna, Genetyka
1
Efekty kształcenia
Efekt kształcenia dla kursu
Wiedza
Odniesienie do efektów
kierunkowych
W01 Zna metody izolacji i oczyszczania substancji.
K_W18, K_W23
W02 Opisuje rodzaje, zasady i zastosowanie rozdziału
elektroforetycznego.
K_W18, K_W23
W03 Określa rodzaje, zastosowanie i zasady rozdziałów
chromatograficznych.
K_W18, K_W23, K_W24
W04 Opisuje zasadę i zastosowanie metody hybrydyzacji
Western-Blot.
K_W18, K_W23, K_W24
W05 Potrafi opisać zasadę i zastosowanie metody
SELDI-TOF i MALDI-TOF.
K_W18, K_W23, K_W24
W06 Omawia selektywne znakowanie substancji w
żywych komórkach.
K_W18, K_W23,
W07 Zna zastosowanie białka GFP.
K_W18, K_W23,
W08 Opisuje zasadę testu ELISA oraz metody
mikromacierzy.
K_W18, K_W23, K_W24
W09 Zna metody uzyskania trójwymiarowych obrazów
molekuł.
K_W10, K_W18, K_W23
W10 Zna ogólne zasady bezpiecznej pracy w
laboratorium oraz pracy w warunkach sterylnych..
K_W25
2
Efekt kształcenia dla kursu
Odniesienie do efektów
kierunkowych
U01 Poprawnie posługuje się drobnym sprzętem
laboratoryjnym i aparaturą pomiarową.
K_U05, K_U18
U02 Przygotowuje odczynniki do pracy z materiałem
biologicznym.
K_U05, K_U18
U03 Przeprowadza izolacje i oczyszczanie białek różnymi K_U05, K_U18, K_U24
metodami.
Umiejętności
U04 Wykonuje spektrofotometryczne oznaczenie
zawartości białka.
K_U05, K_U18, K_U24
U05 Przeprowadza rozdział białek metodą elektroforezy
wraz z barwieniem i utrwaleniem.
K_U05, K_U18, K_U24
U06 Dokumentuje i analizuje uzyskane foregramy.
K_U19
U07 Szacuje właściwości białek na podstawie ich
sekwencji aminokwasowej w bazach danych.
K_U19, K_U20
U08 Wykonuje spektrofotometryczny pomiar aktywności
wybranych enzymów.
K_U05, K_U18, K_U24
Efekt kształcenia dla kursu
Kompetencje
społeczne
Odniesienie do efektów
kierunkowych
K01 Wykorzystuje udostępniony sprzęt laboratoryjny
zgodnie z zaleceniami.
K_K11
K02 Stosuje się do obowiązujących zasad BHP.
K_K10, K_K11
K03 Sprawnie realizuje powierzone zadania poprzez
działanie samodzielne lub pracę w grupach.
K_K08, K_K12
3
Organizacja
Forma zajęć
Ćwiczenia w grupach
Wykład
(W)
A
Liczba godzin
K
L
10
S
P
E
15
Opis metod prowadzenia zajęć
Wykłady prowadzone z wykorzystaniem takich technik jak: prezentacje multimedialne, filmy
instruktarzowe, przekaz bezpośredni oraz dyskusja. Ćwiczenia prowadzone w oparciu o
indywidualną i zespołową pracę studentów, obejmują zajęcia praktyczne z zakresu izolacji i
analizy białek.
W01
W02
W03
W04
W05
W06
W07
W08
W09
W10
W11
U01
U02
U03
U04
U05
U06
U07
U08
U09
K01
K02
K03
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
Inne
Egzamin
pisemny
Egzamin ustny
Praca pisemna
(esej)
Referat
Udział w
dyskusji
Projekt
grupowy
Projekt
indywidualny
Praca
laboratoryjna
Zajęcia
terenowe
Ćwiczenia w
szkole
Gry
dydaktyczne
E – learning
Formy sprawdzania efektów kształcenia
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
4
Kryteria oceny
Kryterium zaliczenia jest obecność oraz aktywność na zajęciach
laboratoryjnych i wykładach a także pozytywne zaliczenie kolokwium
podsumowującego kurs.
Uwagi
Treści merytoryczne (wykaz tematów)
Podział metod analizy molekularnej materiału biologicznego.
Metody izolacji i oczyszczania substancji.
Elektroforeza - rodzaje, zasady rozdziału i zastosowanie.
Wizualizacja i analiza rozdzielonych substancji metodą SDS PAGE i elektroforezy natywnej.
Chromatografia - rodzaje, zasady rozdziału i zastosowanie.
Zasada i zastosowanie metody hybrydyzacji Western-Blot.
Zasady i zastosowanie metody SELDI-TOF i MALDI-TOF.
Selektywne znakowanie substancji w żywych komórkach.
Zastosowanie białka GFP.
Zasada i zastosowanie testu ELISA i metody mikromacierzy.
Metody uzyskania trójwymiarowych obrazów biomolekuł.
Wykaz literatury podstawowej
Amersham Biosciences: Proteomics. Principles and methods,. Handbook, 2004
Bio-Rad: A Methods and Product Manual, 2009
Kozik A., Rąpała-Kozik M., Guevara-Lora I.: Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane
problemy i metody instrumentalnej biochemii analitycznej. Seria Wydawnicza Instytutu Biologii
Molekularnej Uniwersytetu Jagiellońskiego, Kraków 2001
Kęcki Z.: Podstawy spektroskopii molekularnej, PWN, Warszawa 1998
Walkowiak B.: Techniki chromatografii cieczowej. Przykłady zastosowań. Amersham Pharmacia
Biotech. MORPOL, Lublin 2000
Proteomika. Red. A. Kraj, J. Silberring. Wydział Chemii UJ, Kraków 2004
Wykaz literatury uzupełniającej
Wprowadzenie do chemii białek. Red. A. Dubin. Wydział Biotechnologii UJ, Kraków 2003
Rasch D., Herrendorfer G.: Statystyczne planowanie doświadczeń. PWN, Warszawa 1991
Harris E.L.V., Angal S.: Protein purification methods. A practical approach, IRL Press, Oxford-UK
1995.
5
Alberts B., Bray D., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walter P. (1999).
Podstawy biologii komórki Wydawnictwo Naukowe PWN. Warszawa.
Bilans godzinowy zgodny z CNPS (Całkowity Nakład Pracy Studenta)
Ilość godzin w kontakcie z
prowadzącymi
Ilość godzin pracy studenta
bez kontaktu z
prowadzącymi
Wykład
10
Konwersatorium (ćwiczenia, laboratorium itd.)
15
Pozostałe godziny kontaktu studenta z prowadzącym
5
Lektura w ramach przygotowania do zajęć
10
Przygotowanie krótkiej pracy pisemnej lub referatu po
zapoznaniu się z niezbędną literaturą przedmiotu
10
Przygotowanie projektu lub prezentacji na podany temat
(praca w grupie)
Przygotowanie do egzaminu
Ogółem bilans czasu pracy
50
Ilość punktów ECTS w zależności od przyjętego przelicznika
2
6