MONOGRAFIE I ROZPRAWY NAUKOWE
Transkrypt
MONOGRAFIE I ROZPRAWY NAUKOWE
INSTYTUT UPRAWY NAWOŻENIA I GLEBOZNAWSTWA PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY INSTITUTE OF SOIL SCIENCE AND PLANT CULTIVATION STATE RESEARCH INSTITUTE Maria J. Król BAKTERIE ENDOFITYCZNE MONOGRAFIE I ROZPRAWY NAUKOWE 24 PUŁAWY 2009 SPIS TREŚCI 1. WSTĘP.................................................................................................................7 1.1.Wydzieliny korzeniowe ..................................................................................8 2. IZOLACJA I ZRÓŻNICOWANIE BAKTERII ENDOFITYCZNYCH...............9 2.1. Właściwości bakterii endofitycznych ..........................................................12 2.2. Endofityczne diazotrofy ...............................................................................14 2.2.1. Acetobacter ..........................................................................................15 2.2.2. Azoarcus ..............................................................................................15 2.2.3. Azospirillum ..........................................................................................18 2.2.4. Burkholderia ..........................................................................................24 2.2.5. Gluconacetobacter .................................................................................29 2.2.6. Herbaspirillum .......................................................................................30 2.2.7. Pseudomonas .........................................................................................31 2.2.7.1. Pseudomonas stutzeri ...................................................................34 2.2.7.1.1. Wykorzystywanie różnych źródeł węgla podczas wiązania azotu cząsteczkowego ......................................37 2.2.7.1.2. Wytwarzanie kwasów hydroksymasłowych i alkanonianowych ...........................................................41 2.2.7.1.3. Mineralizacja związków fosforowych .............................42 2.2.7.1.4. Genetyczne determinanty enzymów zaangażowanych w wykorzystywanie wielopierścieniowych węglowodorów aromatycznych (WWA) jako substratu pierwotnego podczas wiązania N2 ...................422.2.7.1.4.1 Wykorzystanie benzenu jako jedynego źródła węgla w wiązaniu wolnego azotu ...................................................50 2.2.7.1.4.2. Wykorzystanie węglowodorów dwui trójpierścieniowych jako jedynego źródła węgla w wiązaniu wolnego azotu ......................53 2.2.8. Endofityczne diazotrofy wyizolowane ze słodkich ziemniaków ...........57 2.2.9. Wiązanie azotu w parabrodawkach korzeni zbóż ..................................58 2.3. Endofity nieasocjacyjne beztlenowo wiążące N2 – rodzaj Clostridium .......62 3. BIOKONTROLA A ENDOFITY .......................................................................63 3.1. Wytwarzanie sideroforów przez bakterie ....................................................66 4. WYTWARZANIE FITOHORMONÓW ............................................................69 4.1. Auksyny .....................................................................................................70 4.2. Cytokininy....................................................................................................72 4.3. Gibereliny ....................................................................................................73 4.4. Brasinosteroidy ............................................................................................74 4.5. Kwas abscysynowy ......................................................................................75 4.6. Jasmonidy ....................................................................................................76 4.7. Etylen ...........................................................................................................76 5. ROLA ENDOFITÓW W DEGRADACJI ZWIĄZKÓW FENOLOWYCH ......77 5.1. Rozkład związków fenolowych przez bakterie endofityczne ......................79 5.2. Rozkład związków fenolowych przez bakterie z rodzaju Azospirillum ......80 5.3. Przemiany związków fenolowych a rola amoniakoliazy L-fenyloalaninowej (PAL) w indukcji mechanizmów obronnych rośliny ...80 5.3.1. Amoniakoliaza fenyloalaniny ................................................................82 5.3.2. Mechanizm reakcji katalizowanej przez amoniakoliazę fenyloalaniny .........................................................................................83 5.3.3. Inhibitory amoniakoliazy fenyloalaniny ................................................84 5.3.4. Oddziaływanie między amoniakoliazą fenyloalaniny a kwasem 2-amino-indano-2-fosfonowym (AIP)....................................................85 6. BAKTERIE ENDOFITYCZNE A FITOREMEDIACJA ...................................86 6.1. Naftofity – rośliny rosnące w środowisku zanieczyszczonym substancjami ropopochodnymi ....................................................................87 7. LITERATURA ....................................................................................................88 STRESZCZENIE....................................................................................................122