Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów Katedry
Transkrypt
Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów Katedry
Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów Katedry Mikrobiologii UJCM Informacja o Katedrze Rozwój naukowy młodej kadry naukowców w kontekście priorytetów badawczych: W 2009 roku 1 pracownik Katedry uzyskał stopień doktora habilitowanego, zaś 3 osoby – stopnie doktora. Informacja o Katedrze Działalność naukowa Katedry koncentruje się na 3 grupach zagadnień. Główny nurt działalności jest oparty na projektach badawczych dotyczących patomechanizmów zakażeń człowieka powodowanych przez bakterie, wirusy, grzyby i pierwotniaki, a także laboratoryjnych metod wykrywania zakażeń powodowanych przez te drobnoustroje. Tego zakresu dotyczy większość publikacji Katedry zamieszczonych w recenzowanych naukowych czasopismach anglojęzycznych i polskich. Drugą grupę stanowią projekty finansowane przez MNiSW i Unię Europejską i pochodzące w wyniku ich realizacji publikacje dotyczące epidemiologii szpitalnej: nadzorowi nad zakażeniami i zapobieganiu zakażeniom szpitalnym. Trzecią też opartą na projektach finansowanych przez MNiSW – prace z zakresu ekologii drobnoustrojów zasiedlających jelito i pochwę w stanach zdrowia i choroby oraz sposobów regulacji składu mikroflory tych narządów przez podawanie probiotyków. Pracownia Ekologii Drobnoustrojów Granty finansowane ze środków UE: QLGI-1999-00050. Badania nad udziałem flory jelitowej w patogenezie przewlekłych zapaleń jelit w oparciu o modele zwierzęce — projekt w ramach 5 Programu Ramowego Unii Europejskiej. Biofilm bakteryjny wykrywany w warunkach in vitro i in vivo (czynniki regulujące proces tworzenia biofilmu). Białka połączeń ścisłych. (Tight junctions). Funkcje bariery jelitowej poprzez stymulację produkcji białek połączeń ścisłych w szczególności okludyny oraz zonuliny. Pracownia Ekologii Drobnoustrojów Projekty finansowane przez MNiSW: Grant własny MNiSW Nr K/PBW/000344. Jakościowe i ilościowe zmiany flory przewodu pokarmowego u chorych z wrzodziejącym zapaleniem jelita grubego oraz wpływ bakterii probiotycznych na te zmiany i na przebieg choroby. 2008-2010. Grant promotorski MNiSW Nr N N404 127838. Ocena metody opartej na amplifikacji DNA w laboratoryjnej diagnostyce toksoplazmozy. 20102012. Grant promotorski MNiSW Nr N N401 042938. Charakterystyka szczepów paciorkowców z gatunku Streptococcus agalactiae wyizolowanych z zakażeń inwazyjnych i przypadków kolonizacji. 2010-2012. Grant własny MNiSW Nr NN401 144638. Badanie wpływu bakterii probiotycznych z rodzaju Lactobacillus o właściwościach antyoksydacyjnych na skład mikroflory jelita i na funkcje jelita u myszy skolonizowanych ludzką florą jelitową. 2010-2013. Capabilities and resources of the Group BX51 microscopy 28 Pracownia Ekologii Drobnoustrojów Zakres aktywności naukowych: Udział drobnoustrojów w patomechanizmach przewlekłych stanów zapalnych na przykładzie IBD: Rola aktywnych form tlenu i jonów metali w formowaniu „patologicznego” biofilmu jelita grubego. Reaktywne formy tlenu Granulocytes - 1x106/1ml : (Amounts of H2O2 liberated by granulocytes during oxidative burst reach approximately > 1.0 mM ) Lactobacillus -1x108/1ml : (Amounts of H2O2 produced by certain species of Lactobacillus in aerobic conditions are about 0.2-1.0 mM ) Wykrywanie reaktywnych form tlenu produkowanych przez wybrane gatunki bakterii z wykorzystaniem metod fluorescencyjnych. Lactobacillus delbrueckii (L:+++) Lactobacillus rhamnosus (P: -) Nadtlenek wodoru produkowany przez bakterie , a zjawiska apoptozy nekrozy zachodzące w komórkach ludzkich linii hodowlanych. (dead cells labelled with propidium iodide in orange color) Incubation time: 3 hours 2 mM H2O2 - 0.006% 882 mM H2O2 - 3% Pracownia Ekologii Drobnoustrojów Zakres aktywności naukowych: Czynniki kształtujące biofilm nabłonka pochwy. Mechanizmy inwazyjnych zakażeń powodowanych przez paciorkowce ropne. Probiotyki. Działanie probiotyków: 1.na inne bakterie i grzyby 2.na komórki układu immunologiczneg o (stymulacja cytokin) 3. na komórki gospodarza (apoptoza, nekroz) Działanie wybranych substancji na proces adherencji bakterii do ludzkich linii komórkowych. FISH-detection of Streptococcus agalactiae (SAGA-CY3 probe) directly in vaginal smear taked from a pregnant women Wykrywanie, chemiczna budowa oraz biologiczne znaczenie pozakomórkowych substancji produkowanych przez bakterie (egzopolisacharyd).