sylabus przedmiotu na studiach wyższych
Transkrypt
sylabus przedmiotu na studiach wyższych
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. (OHPHQW\VNáDGRZH sylabusu Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Opis Bioinformatyka i genomika :\G]LDá%LRWHFKQRORJLL BioGenom1 polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK - JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, semestr I GUKDE3DZHá0DFNLHZLF] :\NáDGLüZLF]HQLD Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki i biologii molekularnej oraz dobra znajomRĞüMĊ]\ND angielskiego. 30/60 4/3 ECTS 3R]QDQLHSRGVWDZRZ\FK]DJDGQLHĔ]G]LHG]LQ\ JHQRPLNLLELRLQIRUPDW\NLRUD]]ZLą]DQ\FK]QLPLEaz danych; zrozumienie idei algorytmów i metod komputerowych stosowanych w analizach sekwencji nukleotydowych w skali genomowej: identyfikowanie VHNZHQFMLNRGXMąF\FKELDáNRLDQDOL]\VHNZHQFML51$ poznanie podstaw transkryptomiki: analiza bioinformatyczna SURILOXHNVSUHVMLSU]\NáDG\ ]DVWRVRZDĔPLNURPDFLHU]\ZELRORJLLLPHG\F\QLH SR]QDQLHRUJDQL]DFMLJHQRPyZPHWRGVáXĪąF\FKGRLFK analizy oraz baz genomowe. Poznanie algorytmów i PHWRGNRPSXWHURZHMDQDOL]\VHNZHQFMLELDáNRZ\FK WáXPDF]HQLHVHNZHQFMLQXNOeotydowej na DPLQRNZDVRZąRNUHĞODQLHSRGVWDZRZ\FKZáDĞFLZRĞFL IL]\NRFKHPLF]Q\FKELDáNDNRPSXWHURZHWUDZLHQLH ELDáNDSRV]XNLZDQLHUHJLRQyZWUDQVEáRQRZ\FK PRG\ILNDFMHSRWUDQVODF\MQHELDáHNRNUHĞODQLH ORNDOL]DFMLVXENRPyUNRZHMELDáHNSRV]XNLZDQLH motywóZLGRPHQZELDáNXRNUHĞODQLHVWUXNWXU\ GUXJRU]ĊGRZHMELDáNDZ\NRQ\ZDQLHSU]\UyZQDĔ strukturalnych, przewidywanie struktur przestrzennych. Poznanie baz struktur przestrzennych 3'%NODV\ILNDFMLVWUXNWXUDOQHMELDáHNRUD]SURJUDPyZ GRRJOąGDQLDVWUXNWXUprzestrzennych. HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ Podstawowe zagadnienia z dziedziny genomiki, bioinformatyki, transkryptomiki i proteomiki; rodzaje genomowych i bioinformatycznych baz danych; NRPSXWHURZHLGHQW\ILNRZDQLHVHNZHQFMLNRGXMąF\FK ELDáNRWUDQVNU\SWRPLND- metody analiz mikromacierzy; analizy genomów i genomika porównawcza. Komputerowa analiza sekwencji ELDáNRZ\FKQDSR]LRPLHVWUXNWXU\SLHUZV]RU]ĊGRZHM GUXJRU]ĊGRZHMLWU]HFLRU]ĊGRZHM3RV]XNLZDQLH UHJLRQyZWUDQVEáRQRZ\FKPRW\ZyZLGRPHQZELDáNX Bazy struktur przestrzennych (PDB), przyrównanie 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów VWUXNWXUDOQHELDáHNNODV\ILNDFMDVWUXNWXUDOQDELDáHN 1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008 2. J.-M. Claverie, C. Notredame. Bioinformatics For Dummies. Wiley Publishing, Inc. 2006. 3. A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette (red.) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. Wiley-Liss, Inc. 2005 (lub wersja WáXPDF]RQDQDMĊ]\NSROVNLZ\GDQDSU]H]3:1 ,QIRUPDFMHGRVWĊSQHQDVWURQDFKLQWHUQHWRZ\FKED] GDQ\FKLVWURQDFK]ZLą]DQ\FK]JHQRPLNąL ELRLQIRUPDW\Ną 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. (OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ RVyESURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Opis Immunologia :\G]LDá%LRWHFKQRORJLLZ\NáDG:\G]LDá1DXN %LRORJLF]Q\FKüZLF]HQLD Immu1 polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK - RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ I rok studiów II stopnia, I semestr 'UKDE(ZD0DUFLQNRZVNDZ\NáDG 'U'DULD$XJXVW\QLDNNLHURZQLNüZLF]HĔ 'U*UDĪ\QD0DMNRZVND-6NUREHNüZLF]HQLD :\NáDGW\JRGQLSRJRG]LQ\W\JRGQLRZR ûZLF]HQLD– praca w laboratorium 30/30 3/2 ECTS 3R]DOLF]HQLXZ\NáDGXVWXGHQWSRZLQLHQUR]XPLHü SRGVWDZRZHPHFKDQL]P\UHJXODFMLRGSRUQRĞFL]QDü PHFKDQL]P\G]LDáDQLDOHNyZSU]HFLZ]DSDOQ\FK przeciwalergicznych i immunosupresyjnych, metody produkcji i zastosowDQLDSU]HFLZFLDáSRGVWDZRZH metody stosowane w diagnostyce i terapii chorób XNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJRRUD]WHFKQLNLEDGDZF]H Z\NRU]\VWXMąFHSU]HFLZFLDáD ûZLF]HQLD8PLHMĊWQRĞüMDNRĞFLRZHMDQDOL]\NRPyUHN XNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJRZ\VWĊSXMąF\FKZNUZL obwodowej8PLHMĊWQRĞüIXQNFMRQDOQHMRFHQ\ Z\EUDQ\FKPHFKDQL]PyZXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR IDJRF\WR]\DNW\ZDFMLXNáDGXGRSHáQLDF]D]GROQRĞFL DJOXW\QDF\MQ\FKLQHXWUDOL]DF\MQ\FKSU]HFLZFLDá 8PLHMĊWQRĞüLORĞFLRZHMLMDNRĞFLRZHMRFHQ\ SU]HFLZFLDáDQW\JHQyZZPDWHULDOe biologicznym z zastosowaniem technik immunoenzymatycznych (/,6$8PLHMĊWQRĞü]DSURMHNWRZDQLDGRZROQHJRWHVWX ELISA (J]DPLQ SLVHPQ\ SR ]DNRĔF]HQLX F\NOX Z\NáDGyZ (termin podstawowy i poprawkowy). ûZLF]HQLD-- ocena wiedzy teoretycznej : trzy 45PLQXWRZHNRORNZLDNDĪGH]GDQHJREORNX üZLF]HQLRZHJR - oFHQD XPLHMĊWQRĞFL DQDOL]\ Z\QLNyZ ] Z\NRQDQ\FK GRĞZLDGF]HĔ GZD VSUDZR]GDQLD RUD] RFHQD XPLHMĊWQRĞFLSUDNW\F]Q\FK :\NáDG6WUXNWXUDLVNáDGQLNLXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR 2GSRUQRĞüQLHVZRLVWDLVZRLVWD2GSRUQRĞü komórkowa LKXPRUDOQD5R]ZyMNRPyUHNXNáDGX RGSRUQRĞFLRZHJR3U]HFLZFLDáDLLFK]QDF]HQLHZ RGSRUQRĞFL7ROHUDQFMDXNáDG]JRGQRĞFL tkankowej, PHFKDQL]P\UR]UyĪQLDQLDDQW\JHQyZZáDVQ\FKRG obcych. Immunologia nowotworów: naturalna obrona SU]HFLZQRZRWZRURZDDQW\JHQ\WRZDU]\V]ąFH nowotworom, immunoterapia i szczepionki przeciwnowotworowe. Stan zapalny: komórki i PHGLDWRU\ELRUąFHXG]LDáZUHDNFMDFK]DSDOQ\FK przebieg zapalenia i leki przeciwzapalne. Immunologia FLąĪ\PHFKDQL]P\UR]SR]QDQLDFLąĪ\SU]H]XNáDG 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów RGSRUQRĞFLLUR]ZyMWROHUDQFMLQDSáyGLPPXQRORJLF]QH SU]\F]\Q\QLHSáRGQRĞFL1LHGRERU\RGSRUQRĞFL SLHUZRWQHLQDE\WHGLDJQRVW\NDLSU]\NáDG\WHUDSLL Szczepionki: mechanizmy immunizacji, rodzaje szczepionek i kierunki rozwoju szczepLHĔ3U]HV]F]HS\L LPPXQRVXSUHVMD$XWRDJUHVMDF]\QQLNLZSá\ZDMąFHQD UR]ZyMDXWRDJUHVMLSU]\NáDG\FKRUyE$OHUJLHURG]DMH przyczyny rozwoju alergii i sposoby leczenia. Techniki immunologiczne w badaniach laboratoryjnych. =DVWRVRZDQLDSU]HFLZFLDáZGLDgnostyce i terapii: PRG\ILNDFMHSU]HFLZFLDáSU]HFLZFLDáDPRQRNORQDOQH SU]HFLZFLDáDFKLPHU\F]QHLKXPDQL]RZDQH ûZLF]HQLD.RPyUNLXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR– morfologia, funkcja, metody identyfikacji; Budowa i ZáDĞFLZRĞFLSU]HFLZFLDá3U]HFLZFLDáDPRQRNORQalne; Receptory PRR; struktury PAMP. Typy odpowiedzi immunologicznej; Mechanizmy RGSRUQRĞFLQLHVZRLVWHMIDJRF\WR]DXNáDGGRSHáQLDF]D F\WRWRNV\F]QRĞüQDWXUDOQDLQGXNRZDQDNRPyUNDPL1. 0HFKDQL]P\RGSRUQRĞFLVZRLVWHMPHFKDQL]P\]DOHĪQH RGSU]HFLZFLDá2GSRUQRĞüSU]HFLZ]DNDĨQD.RRSHUDFMD SRPLĊG]\SRV]F]HJyOQ\PLHOHPHQWDPLRGSRZLHG]L immunologicznej. Unikanie przez patogeny mechanizmów obronnych gospodarza. :\NáDG,PPXQRORJLDSRGUHGDNFMą-DNyELVLDND3:1 Immunologia pod UHGDNFMą5RLWWD%URVWRIIDL0DOH Wydanie polskie PZWL lub angielskie .UyWNLHZ\NáDG\,PPXQRORJLD/\G\DUG:KHODQ Fanger, PWN ûZLF]HQLD*RáąE--DNyELVLDN0/DVHN:6WRNáRVD7 ,PPXQRORJLD3:1.ąWQLN-Prastowska I. Immunochemia w biologii medycznej. Metody laboratoryjne. PWN, 2009;Abbas A, Lichtman A. ,, Basic Immunology”, ed. Saunders, 2006 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. (OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ RVyESURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne 10. :\PDJDQLDZVWĊSQe 11. /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX 12. 13. 14. 15. Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Opis Metody PCR-techniki i praktyczne wykorzystanie :\G]LDá%LRWHFKQRORJLL MetPCR1 polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK - RERZLą]NRZ\GR]DOLF]HQLDWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, I semestr Prof. dr hab. Mariusz Olczak - Z\NáDG Dr hab. Teresa Olczak - üZLF]HQLD :\NáDG=DMĊFLDRGE\ZDMąVLĊSU]H]JRG]LQ lekcyjnych, raz w tygodniu po 2 jednostki lekcyjne. ûZLF]HQLDODERUDWRU\MQH=DMĊFLDRGE\ZDMąVLĊSU]H] tygodni (6,5 godziny lekcyjnej raz w tygodniu, co drugi W\G]LHĔ - SU]\LORĞFLVWXGHQWyZQLHSU]HNUDF]DMąFHM RVyE&]ĊĞü]DMĊüSURZDG]RQDMHVWZIRUPLH GRĞZLDGF]DOQHM&]ĊĞü]DMĊüSROHJDQD SODQRZDQLXLSU]\JRWRZDQLXGRĞZLDGF]HĔ.DĪGH ]DMĊFLDVąSRSU]HG]RQHWHRUHW\F]Q\PZSURZDG]HQLHP SU]H]SURZDG]ąFHJR(1-JRG]Z]DOHĪQRĞFLRG WHPDWX6WXGHQFLSUDFXMąZJUXSDFK-10-osobowych, FRXPRĪOLZLDLQG\ZLGXDOQHNRQVXOWDFMH]SURZDG]ąF\P GODNDĪGHJRVWXGHQWD0RĪOLZRĞüNRQVXOWDFMLSR]D ]DMĊFLDPL- 1 raz w tygodniu po 1 godzinie (60 minut). 3RGVWDZRZDZLHG]D]]DNUHVXWHFKQLNXĪ\ZDQ\FKZ biologii molekularnej 15/45 5 ECTS. &HOHPSU]HGPLRWXMHVW]DSR]QDQLHVLĊ]PHWRGą3&5, MHGQą]SRGVWDZRZ\FKWHFKQLNELRORJLLPROHNXODUQHM stosowanych obecnie w laboratorium, na poziomie ]DDZDQVRZDQ\P=DNáDGDVLĊĪHVWXGHQWSRZLQLHQ GRJáĊEQLHSR]QDüWHRUHW\F]QHSRGVWDZ\WHFKQLNL3&5 RUD]MHMPRG\ILNDFMLZ\NRQDüSRGVWDZRZąUHDNFMĊ PCR, a WDNĪH]DSODQRZDüGRĞZLDGF]HQLD] wykorzystaniem reakcji PCR do mutagenezy oraz identyfikacji nieznanych sekwencji DNA. 3LVHPQHNRORNZLXP]DOLF]HQLRZH]Z\NáDGXRN JRG]6SUDZR]GDQLHSLVHPQHSR]DNRĔF]HQLXNDĪGHJR EORNXWHPDW\F]QHJRVSUDZR]GDĔSRSUDZQH Z\NRQDQLHF]ĊĞFLGRĞZLDGF]DOQHMüZLF]HĔRraz ]DOLF]HQLHNRĔFRZH]FDáRĞFLüZLF]HĔIRUPDSLVHPQD ok. 1 godz.). :\NáDG:SURZDG]HQLHWHRUHW\F]QHGRPHWRG\3&5 2PyZLHQLHVNáDGQLNyZUHDNFML3&5MHMZDUXQNyZ metod identyfikacji DNA oraz aparatury. Projektowanie typowych i zmodyfikowanych starterów do reakcji PCR oraz starterów i sond do reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Projektowanie starterów zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na podstawie podanych sekwencji peptydów. Omówienie reakcji RT i RT-PCR. Mutageneza ukierunkowana i przypadkowa. Technika 5’ i 3’ RACE. Zastosowanie 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów metody PCR. =DMĊFLDODERUDWRU\MQH:SURZDG]HQLHWHRUHW\F]QHGR PHWRG\3&52PyZLHQLHVNáDGQLNyZUHDNFML3&5RUD] RT i RT-3&5RUD]LFKZDUXQNyZ=DSR]QDQLHVLĊ] DSDUDWXUą3URMHNWRZDQLHW\SRZ\FKL]PRG\ILNRZDQ\FK starterów do reakcji PCR oraz starterów i sond do reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Amplifikacja fragmentu DNA - dobranie warunków i przeprowadzenie reakcji PCR, identyfikacja i analiza produktów reakcji PCR. Projektowanie starterów zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na podstawie podanych sekwencji peptydów oraz opracowanie warunków reakcji PCR. Zaprojektowanie mutagenezy ukierunkowanej i przypadkowej dla SRGDQHJRELDáND2SUDFRZDQLHSURWRNRáXGRPHWRG\¶ i 3’ RACE. 1)Berg, Tymoczko, Stryer L. „Biochemia”. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2003 lub Z\GDQLDSyĨQLHMV]H 2)J. Sambrook, D.W. Russel “Molecular Cloning. A laboratory Manual”. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York. Third Edition OXEZ\GDQLDSyĨQLHMV]H 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. (OHPHQW\VNáDGRZH sylabusu Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ RVyESURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Opis Ewolucja molekularna i filogenetyka :\G]LDá%LRWHchnologii EwolMolFilo2 polski - JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK - JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJo toku studiów Studia II stopnia, II semestr GUKDE3DZHá0DFNLHZLF] :\NáDGLüZLF]HQLD Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki, biologii molekularnej oraz bioinformatyki oraz dobra ]QDMRPRĞüMĊ]\NDDQJLHOVNLHJR 15/45 3/2 ECTS Zrozumienie molekularnych podstaw ewolucji. Poznanie algorytmów i metod: przyrównania (dopasowania) par sekwencji (macierz punktów, programowanie dynamiczne) i wielu sekwencji oraz SRSUDZLDQLDLHG\FMLSU]\UyZQDĔ=DSR]QDQLHVLĊ] metodami poszukiwanie: sekwencji podobnych w bazach danych (algorytmy FASTA i BLAST), motywów i wzorów w sekwencjach. Poznanie metod filogenetyki molekularnej: zebranie sekwencji homologicznych, SU]\UyZQDQLHVHNZHQFMLRNUHĞOHQLHPRGHOX substytucji, skonstruowanie drzewa filogenetycznego, analiza i ocena drzewa filogenetycznego. Poznanie na SU]\NáDGDFKHZROXFMLJHQyZELDáHNLJHQRPyZRUaz odtwarzania filogenezy grup organizmów. HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ Molekularne podstawy ewolucji. Przyrównanie (dopasowanie) par sekwencji (macierz punktów, programowanie dynamiczne – przyrównanie lokalne i globalne), systemy punktacji (macierze aminokwasowe 3$0L%/2680NDU\GODSU]HUZRFHQDLVWRWQRĞFL przyrównania. Przyrównanie wielu sekwencji (progresywne przyrównanie globalne, przyrównanie VHNZHQFML]DZLHUDMąF\FKSRZWyU]HQLDLUHDUDQĪDFMH 3RSUDZLDQLHLHG\FMDSU]\UyZQDĔ3RV]XNLZDQLH sekwencji podobnych w bazach danych (algorytmy FASTA i BLAST), kryteria i istRWQRĞüSRGRELHĔVWZD sekwencji. Motywy i wzory w sekwencjach: sposoby ich Z\UDĪDQLDNRQVHQVXVZ\UDĪHQLDUHJXODUQHEORNL profile, logo). Filogenetyka molekularna: etapy analiz filogenetycznych, rodzaje sekwencji homologicznych (ortologi, paralogi, ksenologi), rodzaje modeli VXEVW\WXFML]PLHQQRĞüWHPSDSRGVWDZLHĔZREUĊELH VHNZHQFMLLPLĊG]\UyĪQ\PLVHNZHQFMDPL]HJDU molekularny, rodzaje drzew, metody tworzenia drzew filogenetycznych (UPGMA, NJ, ME, LS/FM, MP, ML, 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów bayesowskie), metoda bootstrap. Ewolucja genów, ELDáHNLJHQRPyZ 1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008 2. D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution (2nd edn). Sinauer Associates Inc., Sunderland, MA. 2000 3. R.D.M. Page, E.C. Holmes. Molecular Evolution. A Phylogenetic Approach. Blackwell Science Ltd. 2000 %+DOOàDWZHGU]HZDILORJHQHW\F]QH:8: ,QIRUPDFMHGRVWĊSQHQDVWURQDFKLQWHUQHWRZ\FKED] GDQ\FKLVWURQDFK]ZLą]DQ\FK]JHQRPLNąL bioinformDW\Ną 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. (OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMprzedmiot Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów Opis Genetyka populacji :\G]LDá%LRWHFKQRORJLL GenetPopul3 polski - JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK - JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, III semestr Dr Dorota Mackiewicz :\NáDGLüZLF]HQLD Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki, ELRORJLLPROHNXODUQHMRUD]GREUD]QDMRPRĞüMĊ]\ND angielskiego. 15/15 2/1 ECTS =UR]XPLHQLH]UyĪQLFRZDQLD]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHM RUD]SR]QDQLHPHFKDQL]PyZGRQLHMSURZDG]ąF\FK Zapoznanie z podstawowymi prawami i modelami wykorzystywanymi w genetyce populacji. Nabycie XPLHMĊWQRĞFLUR]ZLą]\ZDQLDSUREOHPyZGRW\F]ąF\FK ]DFKRZDĔSRSXODFMLRUD]DQDOL]\SURFHVyZZQLHM zacKRG]ąF\FK:\NRU]\VWDQLHZLHG]\WHRUHW\F]QHMGR UR]ZLą]\ZDQLD]DGDĔ]]DNUHVXJHQHW\NLSRSXODFML =DSR]QDQLHVLĊ]SRGVWDZRZ\PLSURJUDPDPL komputerowymi wykorzystywanymi w szacowaniu ]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHMLRSLVLHSRSXODFMLRUD]RFHQLH danych genetycznych stosowanych do tego opisu. HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ Informacja JHQHW\F]QDMDNRSXQNWZ\MĞFLDGRDQDOL]Z genetyce populacji. Rodzaje markerów genetycznych. =PLHQQRĞüJHQHW\F]QDLIHQRW\SRZDZ\VWĊSXMąFDZ SRSXODFMDFK6SRVRE\RUJDQL]DFML]PLHQQRĞFL genetycznej. Rola mutacji, dryfu genetycznego, doboru naturalnego oraz kojarzenia wsobnego i migracji w DVSHNFLH]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHM0ROHNXODUQD genetyka populacji i bioinformatyczna analiza danych oparta o markery genetyczne. Wybrane aspekty HZROXF\MQHMJHQHW\NLLORĞFLRZHMLJHQHW\NLSRSXODFML F]áRZLHND 1. Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark. Podstawy genetyki populacyjnej. Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego 2009. 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. (OHPHQW\VNáDGRZH sylabusu Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ (osób) SURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX 14. Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 15. 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów Opis Komputerowe i matematyczne modelowanie procesów ewolucyjnych :\G]LDá%LRWHFKQRORJLL KompModelProc3 polski - JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK - JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia Ii stopnia, III semestr 3URIGUKDE6WDQLVáDZ&HEUDW :\NáDGLüZLF]HQLD Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki ogólnej, genetyki populacji, biologii molekularnej, programowania i informatyki oraz doEUD]QDMRPRĞü MĊ]\NDDQJLHOVNLHJR Z\NáDGüZLF]HQLD 2/2 ECTS =UR]XPLHQLHLSR]QDQLHDOJRU\WPyZ]ZLą]DQ\FK] komputerowym symulowaniem i matematycznym opisem ewolucji i struktury genetycznej populacji. 1DüZLF]HQLDFKVáXFKDF]H]DSR]QDMąVLĊ]SURJUDPDPL NRPSXWHURZ\PLLSU]HSURZDG]DMąV\PXODFMH] odpowiednio dobieranymi parametrami. Zaliczenie üZLF]HĔSROHJDQDZáDĞFLZHMLQWHUSUHWDFMLRWU]\PDQ\FK wyników modelowania. Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest zaliczenie üZLF]HĔ Egzamin pisemny, odpowiedzi na pytania, wykonanie zadania. Komputerowe modele typu Monte Carlo RSLVXMąFHVWUXNWXUĊJHQHW\F]QąZLHNRZąLHZROXFMĊ genów, genomów i populacji. Model Penna, LotkaVoltera. Matematyczne próby opisania wyników symulacji komputerowych. Analiza baz danych i porównywanie wyników PRGHORZDQLD]RGSRZLDGDMąF\PLVWUXNWXUDPLL SURFHVDPL]DFKRG]ąF\PLZQDWXU]H 'RVWĊSQDZ,17(51(&,(DNWXDOQDSU]HGPLRWRZD OLWHUDWXUDSU]HJOąGRZD 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. (OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ RVyESURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów Opis Wirusologia. :\G]LDá%LRWHFKQRORJLL Wir3. Polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK - RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, III semestr Dr hab. Egbert Piasecki :\NáDG 3RGVWDZRZHZLDGRPRĞFL]PLNURELRORJLL immunologii i biologii molekularnej 30. 3 ECTS 3RGVWDZ\ZLUXVRORJLL]HV]F]HJyOQ\PXZ]JOĊGQLHQLHP ZLUXVyZF]áRZLHND =DOLF]HQLHSLVHPQHNRORNZLXPREHMPXMąFHFDáRĞü Z\NáDGDQHJRPDWHULDáXQDRVWDWQLFK]DMĊFLDFKZ semestrze Wirusologia ogólna: budowa wirusów, klasyfikacja wirusów, genom wirusowy i jego replikacja, cykl Ī\FLRZ\ZLUXVyZ]PLHQQRĞüLHSLGHPLRORJLDZLUXVyZ ZSá\ZZLUXVyZQD]DNDĪRQ\RUJDQL]PLQDNRPyUNL Szczepionki i chemioterapia przeciwwirusowa Wirusologia systematyczna wybranych rodzin wirusów: ortomyksowirusy, pokswirusy, pikornawirusy, hepadnawirusy, flawiwirusy, rabdowirusy, retrowirusy, filo wirusy, wiroidy i HDV, priony 0.DĔWRFK:LUXVRORJLDOHNDUVND3=:/ 2. L. Collier, J. Oxford: Wirusologia, PZWL 2001 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. (OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ RVyESURZDG]ąFHM przedmiot Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\F]QH przedmiotu oraz sposób ich realizacji Opis Prawo autorskie :\G]LDá3UDZD$GPLQLVWUDFMLL(NRQRPLL PrawoAut3 polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, III semestr Dr Julian Jezioro Z\NáDG Brak 30 3 ECTS Przedstawienie uregulowania prawa autorskiego jako HOHPHQWXSUDZDZáDVQRĞci intelektualnej z XZ]JOĊGQLHQLHP]DJDGQLHĔ]ZLą]DQ\FK]G]LDáDOQRĞFLą QDXNRZąLELRWHFKQRORJLąRUD]RGUĊEQRĞFLZ XUHJXORZDQLXSUDZDDXWRUVNLHJRLSUDZDZáDVQRĞFL SU]HP\VáRZHMZ\QDOD]NLELRWHFKQRORJLF]QH Zaliczenia ustne lub pisemne (test). A. Zagadnienia ogólne: Dobra niematerialne jako przedmiot prawa. Przedmioty intelektualne jako szczególny rodzaj dóbr prawnych. 3RMĊFLHL ZHZQĊWU]QDV\VWHPDW\NDSUDZDZáDVQRĞFL LQWHOHNWXDOQHM*HQH]DLĨUyGáDSUDZDSROVNLHJRL UHJXODFMLPLĊG]\QDURGRZ\FK konwencje: EHUQHĔVNDSDU\VNDSRZV]HFKQDLU]\PVND SRUR]XPLHQLD75,36WUDNWDW\:,32XNáDGR ZVSyáSUDF\SDWHQWRZHM3&7NRQZHQFMD PRQDFKLMVNDĝZLDWRZD2UJDQL]DFMD:áDVQRĞFL ,QWHOHNWXDOQHMSUDZRZáDVQRĞFLLQWHOHNWXDOQHMZ UE. =DJDGQLHQLDV]F]HJyáRZe: Prawo autorskie: Przedmiot prawa autorskiego – utwory, przedmioty SUDZSRNUHZQ\FKZRJyOQRĞFLRUD]SRGPLRW\SUDZ autorskich i pokrewnych. Program komputerowy jako V]F]HJyOQ\URG]DMXWZRUX7UHĞüSUDZDXWRUVNLFK ,QWHUQHWMDNRSROHHNVSORDWDFML3U]HMĞFLe autorskich SUDZPDMąWNRZ\FKRUD]XPRZDOLFHQF\MQD2UJDQL]DFMH ]ELRURZHJR]DU]ąG]DQLDSUDZDPLDXWRUVNLPLL pokrewnymi, Komisja Prawa Autorskiego, Fundusz 3URPRFML7ZyUF]RĞFL2FKURQDSUDZDXWRUVNLFK Ochrona wizerunku, tajemnicy korespondencji oraz ĨUyGHáLQIRUPDFML3UDZDSRNUHZQH2FKURQDsui generis baz danych. B. Prawo ZáDVQRĞFLSU]HP\VáRZHM 3URMHNW\Z\QDOD]F]H]HV]F]HJyOQ\PXZ]JOĊGQLHQLHP wynalazku biotechnologicznego). Znaki towarowe, 16. Wykaz literatury podstawowej Powrót do planu studiów oznaczenia geograficzne, zwalczanie nieuczciwej konkurencji oraz uregulowanie antymonopolowe i normalizacyjne. Literatura podstawowa: --H]LRUR3UDZRZáDVQRĞFL intelektualnej, w: Podstawy prawa autorskiego pod UHGDNFMą(*QLHZND:DUV]DZDRUD]Z przygotowaniu); J. Barta, R. Markiewicz, Prawo autorskie, Warszawa 2008. /LWHUDWXUDX]XSHáQLDMąFD J. Barta, M. Czajkowska'ąEURZVND=ûZLąNDOVNL(7UDSOH50DUNLHZLF] Ustawa o prawie autorskim i prawach pokrewnych. Komentarz, Kraków 2005; J. Barta, R. Markiewicz, Ustawa o ochronie baz danych. Komentarz, Warszawa 2002; 3/&RQGH-0,UXUHWDJR\HQD:-DĞODQ- 03OD]DV3UDZRZáDVQRĞFLLQWHOHNWXDOQHMZ8QLL Europejskiej, Warszawa 2003; R. Golat, Prawo autorskie i prawa pokrewne, Warszawa 2005; M. 3RĨQLDN-Niedzielska (red.) Prawo autorskie i prawa SRNUHZQH=DU\VZ\NáDGX%\GJRV]F]6\VWHP Prawa Prywatnego. Tom 13. Prawo autorskie (red. J. Barta), Warszawa 2007; $6]HZF*-\Ī3UDZR ZáDVQRĞFLSU]HP\VáRZHM:DUV]DZD0GX9DOO Prawo patentowe, Warszawa 2+ĩDNRZVNDHenzler, Wynalazek biotechnologiczny - przedmiot patentu, Warszawa 2006. 6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+ Lp. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. (OHPHQW\VNáDGRZH sylabusu Nazwa przedmiotu Nazwa jednostki SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Kod przedmiotu -Ċ]\NZ\NáDGRZ\ *UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ ramach której przedmiot jest realizowany Typ przedmiotu Rok studiów, semestr ,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\ SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW Metody dydaktyczne :\PDJDQLDZVWĊSQH /LF]EDJRG]LQ]DMĊü dydaktycznych Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi =DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu, a WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL zaliczenia poszczególnych IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ zakres danego przedmiotu 7UHĞFLPHU\WRU\czne przedmiotu oraz sposób ich realizacji Wykaz literatury podstawowej Opis Ekonomia :\G]LDá3UDZD$GPLQLVWUDFMLL(NRQRPLL Ekon4 polski - JUXSDWUHĞFLSRGVWDwowych - RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ Studia II stopnia, IV semestr Dr Sebastian Jakubowski :\NáDG Brak 30 3 ECTS &HOHPZ\NáDGXMHVWSUH]HQWDFMDJáyZQ\FKWHRULLL NRQFHSFMLHNRQRPLF]Q\FKRUD]ZVND]DQLHPRĪOLZRĞFLLFK praktycznego wykorzystania przy prowadzeniu G]LDáDOQRĞFLJRVSRGDUF]HM:LHOHXZDJLSRĞZLĊFRQH EĊG]LHRGG]LDá\ZDQLXP\ĞOLHNRQRPLF]QHMLUHJXODFML prawnych na funkcjonowanie gospodarki narodowej. 8F]HVWQLN]DMĊüSRZLQLHQ]GRE\üXPLHMĊWQRĞü samodzielnej analizy zjawisk gospodarczych oraz GRNRQ\ZDQLDRFHQG]LDáDĔU]ąGX]SXQNWXZLG]HQLD potrzeb gospodarki narodowej. Dodatkowo uczestnik SRZLQLHQSR]QDüSRGVWDZRZHQDU]ĊG]LDDQDOL]\ mikroekonomicznej i sposoby ich wykorzystania w SURZDG]HQLXG]LDáDOQRĞFLJRVSRGDUF]HM 2FHQLDQLHFLąJáHRUD]]DOLF]HQLHXVWQH - 3RGVWDZRZHSRMĊFLDLSU]HGPLRWHNRQRPLL - :VSyáF]HVQHV\VWHP\VSRáHF]QR-gospodarcze. - *áyZQHQXUW\ZVSyáF]HVQHMHNRQRPLL - 5\QHNSRS\WSRGDĪ - Podstawy teorii wyboru konsumenta. - 3RGVWDZ\WHRULLSU]HGVLĊEiorstwa. - 5\QNLF]\QQLNyZSURGXNFMLLSRGVWDZ\WHRULLSRG]LDáX - *áyZQHNDWHJRULHLSRMĊFLDPDNURHNRQRPLL3URGXNWL dochód narodowy. - Determinanty dochodu narodowego. - 5RODSDĔVWZDZJRVSRGDUFH - %XGĪHWSDĔVWZD - 6\VWHPSLHQLĊĪQR– kredytowy - Czynniki wzrostu gospodarczego - Bezrobocie - Inflacja - R. Milewski, Podstawy ekonomii, Warszawa, najnowsze wydanie. - D. Begg, S. Fischer, R. Dornbusch, Makroekonomia, PWE, Warszawa, najnowsze wydanie. Powrót do planu studiów