sylabus przedmiotu na studiach wyższych

Transkrypt

sylabus przedmiotu na studiach wyższych
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
(OHPHQW\VNáDGRZH
sylabusu
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Opis
Bioinformatyka i genomika
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLL
BioGenom1
polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK
- JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK
RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, semestr I
GUKDE3DZHá0DFNLHZLF]
:\NáDGLüZLF]HQLD
Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki i
biologii molekularnej oraz dobra znajomRĞüMĊ]\ND
angielskiego.
30/60
4/3 ECTS
3R]QDQLHSRGVWDZRZ\FK]DJDGQLHĔ]G]LHG]LQ\
JHQRPLNLLELRLQIRUPDW\NLRUD]]ZLą]DQ\FK]QLPLEaz
danych; zrozumienie idei algorytmów i metod
komputerowych stosowanych w analizach sekwencji
nukleotydowych w skali genomowej: identyfikowanie
VHNZHQFMLNRGXMąF\FKELDáNRLDQDOL]\VHNZHQFML51$
poznanie podstaw transkryptomiki: analiza
bioinformatyczna SURILOXHNVSUHVMLSU]\NáDG\
]DVWRVRZDĔPLNURPDFLHU]\ZELRORJLLLPHG\F\QLH
SR]QDQLHRUJDQL]DFMLJHQRPyZPHWRGVáXĪąF\FKGRLFK
analizy oraz baz genomowe. Poznanie algorytmów i
PHWRGNRPSXWHURZHMDQDOL]\VHNZHQFMLELDáNRZ\FK
WáXPDF]HQLHVHNZHQFMLQXNOeotydowej na
DPLQRNZDVRZąRNUHĞODQLHSRGVWDZRZ\FKZáDĞFLZRĞFL
IL]\NRFKHPLF]Q\FKELDáNDNRPSXWHURZHWUDZLHQLH
ELDáNDSRV]XNLZDQLHUHJLRQyZWUDQVEáRQRZ\FK
PRG\ILNDFMHSRWUDQVODF\MQHELDáHNRNUHĞODQLH
ORNDOL]DFMLVXENRPyUNRZHMELDáHNSRV]XNLZDQLH
motywóZLGRPHQZELDáNXRNUHĞODQLHVWUXNWXU\
GUXJRU]ĊGRZHMELDáNDZ\NRQ\ZDQLHSU]\UyZQDĔ
strukturalnych, przewidywanie struktur
przestrzennych. Poznanie baz struktur przestrzennych
3'%NODV\ILNDFMLVWUXNWXUDOQHMELDáHNRUD]SURJUDPyZ
GRRJOąGDQLDVWUXNWXUprzestrzennych.
HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ
Podstawowe zagadnienia z dziedziny genomiki,
bioinformatyki, transkryptomiki i proteomiki; rodzaje
genomowych i bioinformatycznych baz danych;
NRPSXWHURZHLGHQW\ILNRZDQLHVHNZHQFMLNRGXMąF\FK
ELDáNRWUDQVNU\SWRPLND- metody analiz
mikromacierzy; analizy genomów i genomika
porównawcza. Komputerowa analiza sekwencji
ELDáNRZ\FKQDSR]LRPLHVWUXNWXU\SLHUZV]RU]ĊGRZHM
GUXJRU]ĊGRZHMLWU]HFLRU]ĊGRZHM3RV]XNLZDQLH
UHJLRQyZWUDQVEáRQRZ\FKPRW\ZyZLGRPHQZELDáNX
Bazy struktur przestrzennych (PDB), przyrównanie
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
VWUXNWXUDOQHELDáHNNODV\ILNDFMDVWUXNWXUDOQDELDáHN
1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja
molekularna, PWN, 2008
2. J.-M. Claverie, C. Notredame. Bioinformatics For
Dummies. Wiley Publishing, Inc. 2006.
3. A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette (red.)
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of
Genes and Proteins. Wiley-Liss, Inc. 2005 (lub wersja
WáXPDF]RQDQDMĊ]\NSROVNLZ\GDQDSU]H]3:1
,QIRUPDFMHGRVWĊSQHQDVWURQDFKLQWHUQHWRZ\FKED]
GDQ\FKLVWURQDFK]ZLą]DQ\FK]JHQRPLNąL
ELRLQIRUPDW\Ną
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
(OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
RVyESURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Opis
Immunologia
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLLZ\NáDG:\G]LDá1DXN
%LRORJLF]Q\FKüZLF]HQLD
Immu1
polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK
- RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
I rok studiów II stopnia, I semestr
'UKDE(ZD0DUFLQNRZVNDZ\NáDG
'U'DULD$XJXVW\QLDNNLHURZQLNüZLF]HĔ
'U*UDĪ\QD0DMNRZVND-6NUREHNüZLF]HQLD
:\NáDGW\JRGQLSRJRG]LQ\W\JRGQLRZR
ûZLF]HQLD– praca w laboratorium
30/30
3/2 ECTS
3R]DOLF]HQLXZ\NáDGXVWXGHQWSRZLQLHQUR]XPLHü
SRGVWDZRZHPHFKDQL]P\UHJXODFMLRGSRUQRĞFL]QDü
PHFKDQL]P\G]LDáDQLDOHNyZSU]HFLZ]DSDOQ\FK
przeciwalergicznych i immunosupresyjnych, metody
produkcji i zastosowDQLDSU]HFLZFLDáSRGVWDZRZH
metody stosowane w diagnostyce i terapii chorób
XNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJRRUD]WHFKQLNLEDGDZF]H
Z\NRU]\VWXMąFHSU]HFLZFLDáD
ûZLF]HQLD8PLHMĊWQRĞüMDNRĞFLRZHMDQDOL]\NRPyUHN
XNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJRZ\VWĊSXMąF\FKZNUZL
obwodowej8PLHMĊWQRĞüIXQNFMRQDOQHMRFHQ\
Z\EUDQ\FKPHFKDQL]PyZXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR
IDJRF\WR]\DNW\ZDFMLXNáDGXGRSHáQLDF]D]GROQRĞFL
DJOXW\QDF\MQ\FKLQHXWUDOL]DF\MQ\FKSU]HFLZFLDá
8PLHMĊWQRĞüLORĞFLRZHMLMDNRĞFLRZHMRFHQ\
SU]HFLZFLDáDQW\JHQyZZPDWHULDOe biologicznym z
zastosowaniem technik immunoenzymatycznych
(/,6$8PLHMĊWQRĞü]DSURMHNWRZDQLDGRZROQHJRWHVWX
ELISA
(J]DPLQ SLVHPQ\ SR ]DNRĔF]HQLX F\NOX Z\NáDGyZ
(termin podstawowy i poprawkowy).
ûZLF]HQLD-- ocena wiedzy teoretycznej : trzy 45PLQXWRZHNRORNZLDNDĪGH]GDQHJREORNX
üZLF]HQLRZHJR
- oFHQD XPLHMĊWQRĞFL DQDOL]\ Z\QLNyZ ] Z\NRQDQ\FK
GRĞZLDGF]HĔ GZD VSUDZR]GDQLD RUD] RFHQD
XPLHMĊWQRĞFLSUDNW\F]Q\FK
:\NáDG6WUXNWXUDLVNáDGQLNLXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR
2GSRUQRĞüQLHVZRLVWDLVZRLVWD2GSRUQRĞü komórkowa
LKXPRUDOQD5R]ZyMNRPyUHNXNáDGX
RGSRUQRĞFLRZHJR3U]HFLZFLDáDLLFK]QDF]HQLHZ
RGSRUQRĞFL7ROHUDQFMDXNáDG]JRGQRĞFL tkankowej,
PHFKDQL]P\UR]UyĪQLDQLDDQW\JHQyZZáDVQ\FKRG
obcych. Immunologia nowotworów: naturalna obrona
SU]HFLZQRZRWZRURZDDQW\JHQ\WRZDU]\V]ąFH
nowotworom, immunoterapia i szczepionki
przeciwnowotworowe. Stan zapalny: komórki i
PHGLDWRU\ELRUąFHXG]LDáZUHDNFMDFK]DSDOQ\FK
przebieg zapalenia i leki przeciwzapalne. Immunologia
FLąĪ\PHFKDQL]P\UR]SR]QDQLDFLąĪ\SU]H]XNáDG
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
RGSRUQRĞFLLUR]ZyMWROHUDQFMLQDSáyGLPPXQRORJLF]QH
SU]\F]\Q\QLHSáRGQRĞFL1LHGRERU\RGSRUQRĞFL
SLHUZRWQHLQDE\WHGLDJQRVW\NDLSU]\NáDG\WHUDSLL
Szczepionki: mechanizmy immunizacji, rodzaje
szczepionek i kierunki rozwoju szczepLHĔ3U]HV]F]HS\L
LPPXQRVXSUHVMD$XWRDJUHVMDF]\QQLNLZSá\ZDMąFHQD
UR]ZyMDXWRDJUHVMLSU]\NáDG\FKRUyE$OHUJLHURG]DMH
przyczyny rozwoju alergii i sposoby leczenia. Techniki
immunologiczne w badaniach laboratoryjnych.
=DVWRVRZDQLDSU]HFLZFLDáZGLDgnostyce i terapii:
PRG\ILNDFMHSU]HFLZFLDáSU]HFLZFLDáDPRQRNORQDOQH
SU]HFLZFLDáDFKLPHU\F]QHLKXPDQL]RZDQH
ûZLF]HQLD.RPyUNLXNáDGXRGSRUQRĞFLRZHJR–
morfologia, funkcja, metody identyfikacji; Budowa i
ZáDĞFLZRĞFLSU]HFLZFLDá3U]HFLZFLDáDPRQRNORQalne;
Receptory PRR; struktury PAMP.
Typy odpowiedzi immunologicznej; Mechanizmy
RGSRUQRĞFLQLHVZRLVWHMIDJRF\WR]DXNáDGGRSHáQLDF]D
F\WRWRNV\F]QRĞüQDWXUDOQDLQGXNRZDQDNRPyUNDPL1.
0HFKDQL]P\RGSRUQRĞFLVZRLVWHMPHFKDQL]P\]DOHĪQH
RGSU]HFLZFLDá2GSRUQRĞüSU]HFLZ]DNDĨQD.RRSHUDFMD
SRPLĊG]\SRV]F]HJyOQ\PLHOHPHQWDPLRGSRZLHG]L
immunologicznej. Unikanie przez patogeny
mechanizmów obronnych gospodarza.
:\NáDG,PPXQRORJLDSRGUHGDNFMą-DNyELVLDND3:1
Immunologia pod UHGDNFMą5RLWWD%URVWRIIDL0DOH
Wydanie polskie PZWL lub angielskie
.UyWNLHZ\NáDG\,PPXQRORJLD/\G\DUG:KHODQ
Fanger, PWN
ûZLF]HQLD*RáąE--DNyELVLDN0/DVHN:6WRNáRVD7
,PPXQRORJLD3:1.ąWQLN-Prastowska I.
Immunochemia w biologii medycznej. Metody
laboratoryjne. PWN, 2009;Abbas A, Lichtman A. ,,
Basic Immunology”, ed. Saunders, 2006
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
(OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
RVyESURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
10.
:\PDJDQLDZVWĊSQe
11.
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
12.
13.
14.
15.
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Opis
Metody PCR-techniki i praktyczne wykorzystanie
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLL
MetPCR1
polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK
- RERZLą]NRZ\GR]DOLF]HQLDWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, I semestr
Prof. dr hab. Mariusz Olczak - Z\NáDG
Dr hab. Teresa Olczak - üZLF]HQLD
:\NáDG=DMĊFLDRGE\ZDMąVLĊSU]H]JRG]LQ
lekcyjnych, raz w tygodniu po 2 jednostki lekcyjne.
ûZLF]HQLDODERUDWRU\MQH=DMĊFLDRGE\ZDMąVLĊSU]H]
tygodni (6,5 godziny lekcyjnej raz w tygodniu, co drugi
W\G]LHĔ - SU]\LORĞFLVWXGHQWyZQLHSU]HNUDF]DMąFHM
RVyE&]ĊĞü]DMĊüSURZDG]RQDMHVWZIRUPLH
GRĞZLDGF]DOQHM&]ĊĞü]DMĊüSROHJDQD
SODQRZDQLXLSU]\JRWRZDQLXGRĞZLDGF]HĔ.DĪGH
]DMĊFLDVąSRSU]HG]RQHWHRUHW\F]Q\PZSURZDG]HQLHP
SU]H]SURZDG]ąFHJR(1-JRG]Z]DOHĪQRĞFLRG
WHPDWX6WXGHQFLSUDFXMąZJUXSDFK-10-osobowych,
FRXPRĪOLZLDLQG\ZLGXDOQHNRQVXOWDFMH]SURZDG]ąF\P
GODNDĪGHJRVWXGHQWD0RĪOLZRĞüNRQVXOWDFMLSR]D
]DMĊFLDPL- 1 raz w tygodniu po 1 godzinie (60 minut).
3RGVWDZRZDZLHG]D]]DNUHVXWHFKQLNXĪ\ZDQ\FKZ
biologii molekularnej
15/45
5 ECTS.
&HOHPSU]HGPLRWXMHVW]DSR]QDQLHVLĊ]PHWRGą3&5,
MHGQą]SRGVWDZRZ\FKWHFKQLNELRORJLLPROHNXODUQHM
stosowanych obecnie w laboratorium, na poziomie
]DDZDQVRZDQ\P=DNáDGDVLĊĪHVWXGHQWSRZLQLHQ
GRJáĊEQLHSR]QDüWHRUHW\F]QHSRGVWDZ\WHFKQLNL3&5
RUD]MHMPRG\ILNDFMLZ\NRQDüSRGVWDZRZąUHDNFMĊ
PCR, a WDNĪH]DSODQRZDüGRĞZLDGF]HQLD]
wykorzystaniem reakcji PCR do mutagenezy oraz
identyfikacji nieznanych sekwencji DNA.
3LVHPQHNRORNZLXP]DOLF]HQLRZH]Z\NáDGXRN
JRG]6SUDZR]GDQLHSLVHPQHSR]DNRĔF]HQLXNDĪGHJR
EORNXWHPDW\F]QHJRVSUDZR]GDĔSRSUDZQH
Z\NRQDQLHF]ĊĞFLGRĞZLDGF]DOQHMüZLF]HĔRraz
]DOLF]HQLHNRĔFRZH]FDáRĞFLüZLF]HĔIRUPDSLVHPQD
ok. 1 godz.).
:\NáDG:SURZDG]HQLHWHRUHW\F]QHGRPHWRG\3&5
2PyZLHQLHVNáDGQLNyZUHDNFML3&5MHMZDUXQNyZ
metod identyfikacji DNA oraz aparatury. Projektowanie
typowych i zmodyfikowanych starterów do reakcji PCR
oraz starterów i sond do reakcji PCR w czasie
rzeczywistym. Projektowanie starterów
zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na
podstawie podanych sekwencji peptydów. Omówienie
reakcji RT i RT-PCR. Mutageneza ukierunkowana i
przypadkowa. Technika 5’ i 3’ RACE. Zastosowanie
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
metody PCR.
=DMĊFLDODERUDWRU\MQH:SURZDG]HQLHWHRUHW\F]QHGR
PHWRG\3&52PyZLHQLHVNáDGQLNyZUHDNFML3&5RUD]
RT i RT-3&5RUD]LFKZDUXQNyZ=DSR]QDQLHVLĊ]
DSDUDWXUą3URMHNWRZDQLHW\SRZ\FKL]PRG\ILNRZDQ\FK
starterów do reakcji PCR oraz starterów i sond do
reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Amplifikacja
fragmentu DNA - dobranie warunków i
przeprowadzenie reakcji PCR, identyfikacja i analiza
produktów reakcji PCR. Projektowanie starterów
zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na
podstawie podanych sekwencji peptydów oraz
opracowanie warunków reakcji PCR. Zaprojektowanie
mutagenezy ukierunkowanej i przypadkowej dla
SRGDQHJRELDáND2SUDFRZDQLHSURWRNRáXGRPHWRG\¶
i 3’ RACE.
1)Berg, Tymoczko, Stryer L. „Biochemia”.
Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2003 lub
Z\GDQLDSyĨQLHMV]H
2)J. Sambrook, D.W. Russel “Molecular Cloning. A
laboratory Manual”. Cold Spring Harbor Laboratory
Press, Cold Spring Harbor, New York. Third Edition
OXEZ\GDQLDSyĨQLHMV]H
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
(OHPHQW\VNáDGRZH
sylabusu
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
RVyESURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Opis
Ewolucja molekularna i filogenetyka
:\G]LDá%LRWHchnologii
EwolMolFilo2
polski
- JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK
- JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX
RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJo toku studiów
Studia II stopnia, II semestr
GUKDE3DZHá0DFNLHZLF]
:\NáDGLüZLF]HQLD
Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki,
biologii molekularnej oraz bioinformatyki oraz dobra
]QDMRPRĞüMĊ]\NDDQJLHOVNLHJR
15/45
3/2 ECTS
Zrozumienie molekularnych podstaw ewolucji.
Poznanie algorytmów i metod: przyrównania
(dopasowania) par sekwencji (macierz punktów,
programowanie dynamiczne) i wielu sekwencji oraz
SRSUDZLDQLDLHG\FMLSU]\UyZQDĔ=DSR]QDQLHVLĊ]
metodami poszukiwanie: sekwencji podobnych w
bazach danych (algorytmy FASTA i BLAST), motywów i
wzorów w sekwencjach. Poznanie metod filogenetyki
molekularnej: zebranie sekwencji homologicznych,
SU]\UyZQDQLHVHNZHQFMLRNUHĞOHQLHPRGHOX
substytucji, skonstruowanie drzewa filogenetycznego,
analiza i ocena drzewa filogenetycznego. Poznanie na
SU]\NáDGDFKHZROXFMLJHQyZELDáHNLJHQRPyZRUaz
odtwarzania filogenezy grup organizmów.
HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ
Molekularne podstawy ewolucji. Przyrównanie
(dopasowanie) par sekwencji (macierz punktów,
programowanie dynamiczne – przyrównanie lokalne i
globalne), systemy punktacji (macierze aminokwasowe
3$0L%/2680NDU\GODSU]HUZRFHQDLVWRWQRĞFL
przyrównania. Przyrównanie wielu sekwencji
(progresywne przyrównanie globalne, przyrównanie
VHNZHQFML]DZLHUDMąF\FKSRZWyU]HQLDLUHDUDQĪDFMH
3RSUDZLDQLHLHG\FMDSU]\UyZQDĔ3RV]XNLZDQLH
sekwencji podobnych w bazach danych (algorytmy
FASTA i BLAST), kryteria i istRWQRĞüSRGRELHĔVWZD
sekwencji. Motywy i wzory w sekwencjach: sposoby ich
Z\UDĪDQLDNRQVHQVXVZ\UDĪHQLDUHJXODUQHEORNL
profile, logo). Filogenetyka molekularna: etapy analiz
filogenetycznych, rodzaje sekwencji homologicznych
(ortologi, paralogi, ksenologi), rodzaje modeli
VXEVW\WXFML]PLHQQRĞüWHPSDSRGVWDZLHĔZREUĊELH
VHNZHQFMLLPLĊG]\UyĪQ\PLVHNZHQFMDPL]HJDU
molekularny, rodzaje drzew, metody tworzenia drzew
filogenetycznych (UPGMA, NJ, ME, LS/FM, MP, ML,
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
bayesowskie), metoda bootstrap. Ewolucja genów,
ELDáHNLJHQRPyZ
1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja
molekularna, PWN, 2008
2. D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular
Evolution (2nd edn). Sinauer Associates Inc.,
Sunderland, MA. 2000
3. R.D.M. Page, E.C. Holmes. Molecular Evolution. A
Phylogenetic Approach. Blackwell Science Ltd. 2000
%+DOOàDWZHGU]HZDILORJHQHW\F]QH:8:
,QIRUPDFMHGRVWĊSQHQDVWURQDFKLQWHUQHWRZ\FKED]
GDQ\FKLVWURQDFK]ZLą]DQ\FK]JHQRPLNąL
bioinformDW\Ną
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
(OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMprzedmiot
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
Opis
Genetyka populacji
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLL
GenetPopul3
polski
- JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK
- JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX
RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, III semestr
Dr Dorota Mackiewicz
:\NáDGLüZLF]HQLD
Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki,
ELRORJLLPROHNXODUQHMRUD]GREUD]QDMRPRĞüMĊ]\ND
angielskiego.
15/15
2/1 ECTS
=UR]XPLHQLH]UyĪQLFRZDQLD]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHM
RUD]SR]QDQLHPHFKDQL]PyZGRQLHMSURZDG]ąF\FK
Zapoznanie z podstawowymi prawami i modelami
wykorzystywanymi w genetyce populacji. Nabycie
XPLHMĊWQRĞFLUR]ZLą]\ZDQLDSUREOHPyZGRW\F]ąF\FK
]DFKRZDĔSRSXODFMLRUD]DQDOL]\SURFHVyZZQLHM
zacKRG]ąF\FK:\NRU]\VWDQLHZLHG]\WHRUHW\F]QHMGR
UR]ZLą]\ZDQLD]DGDĔ]]DNUHVXJHQHW\NLSRSXODFML
=DSR]QDQLHVLĊ]SRGVWDZRZ\PLSURJUDPDPL
komputerowymi wykorzystywanymi w szacowaniu
]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHMLRSLVLHSRSXODFMLRUD]RFHQLH
danych genetycznych stosowanych do tego opisu.
HJ]DPLQSLVHPQ\SyáWHVWL]DOLF]HQLHüZLF]HĔ
Informacja JHQHW\F]QDMDNRSXQNWZ\MĞFLDGRDQDOL]Z
genetyce populacji. Rodzaje markerów genetycznych.
=PLHQQRĞüJHQHW\F]QDLIHQRW\SRZDZ\VWĊSXMąFDZ
SRSXODFMDFK6SRVRE\RUJDQL]DFML]PLHQQRĞFL
genetycznej. Rola mutacji, dryfu genetycznego, doboru
naturalnego oraz kojarzenia wsobnego i migracji w
DVSHNFLH]PLHQQRĞFLJHQHW\F]QHM0ROHNXODUQD
genetyka populacji i bioinformatyczna analiza danych
oparta o markery genetyczne. Wybrane aspekty
HZROXF\MQHMJHQHW\NLLORĞFLRZHMLJHQHW\NLSRSXODFML
F]áRZLHND
1. Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark. Podstawy genetyki
populacyjnej. Wydawnictwa Uniwersytetu
Warszawskiego 2009.
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
(OHPHQW\VNáDGRZH
sylabusu
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
(osób) SURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
14.
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
15.
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
Opis
Komputerowe i matematyczne modelowanie procesów
ewolucyjnych
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLL
KompModelProc3
polski
- JUXSDWUHĞFLNLHUXQNRZ\FK
- JUXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDGRZ\ERUX
RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia Ii stopnia, III semestr
3URIGUKDE6WDQLVáDZ&HEUDW
:\NáDGLüZLF]HQLD
Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki
ogólnej, genetyki populacji, biologii molekularnej,
programowania i informatyki oraz doEUD]QDMRPRĞü
MĊ]\NDDQJLHOVNLHJR
Z\NáDGüZLF]HQLD
2/2 ECTS
=UR]XPLHQLHLSR]QDQLHDOJRU\WPyZ]ZLą]DQ\FK]
komputerowym symulowaniem i matematycznym
opisem ewolucji i struktury genetycznej populacji.
1DüZLF]HQLDFKVáXFKDF]H]DSR]QDMąVLĊ]SURJUDPDPL
NRPSXWHURZ\PLLSU]HSURZDG]DMąV\PXODFMH]
odpowiednio dobieranymi parametrami. Zaliczenie
üZLF]HĔSROHJDQDZáDĞFLZHMLQWHUSUHWDFMLRWU]\PDQ\FK
wyników modelowania.
Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest zaliczenie
üZLF]HĔ
Egzamin pisemny, odpowiedzi na pytania, wykonanie
zadania.
Komputerowe modele typu Monte Carlo
RSLVXMąFHVWUXNWXUĊJHQHW\F]QąZLHNRZąLHZROXFMĊ
genów, genomów i populacji. Model Penna, LotkaVoltera. Matematyczne próby opisania wyników
symulacji komputerowych.
Analiza baz danych i porównywanie wyników
PRGHORZDQLD]RGSRZLDGDMąF\PLVWUXNWXUDPLL
SURFHVDPL]DFKRG]ąF\PLZQDWXU]H
'RVWĊSQDZ,17(51(&,(DNWXDOQDSU]HGPLRWRZD
OLWHUDWXUDSU]HJOąGRZD
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
(OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
RVyESURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
Opis
Wirusologia.
:\G]LDá%LRWHFKQRORJLL
Wir3.
Polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK
- RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, III semestr
Dr hab. Egbert Piasecki
:\NáDG
3RGVWDZRZHZLDGRPRĞFL]PLNURELRORJLL immunologii i
biologii molekularnej
30.
3 ECTS
3RGVWDZ\ZLUXVRORJLL]HV]F]HJyOQ\PXZ]JOĊGQLHQLHP
ZLUXVyZF]áRZLHND
=DOLF]HQLHSLVHPQHNRORNZLXPREHMPXMąFHFDáRĞü
Z\NáDGDQHJRPDWHULDáXQDRVWDWQLFK]DMĊFLDFKZ
semestrze
Wirusologia ogólna: budowa wirusów, klasyfikacja
wirusów, genom wirusowy i jego replikacja, cykl
Ī\FLRZ\ZLUXVyZ]PLHQQRĞüLHSLGHPLRORJLDZLUXVyZ
ZSá\ZZLUXVyZQD]DNDĪRQ\RUJDQL]PLQDNRPyUNL
Szczepionki i chemioterapia przeciwwirusowa
Wirusologia systematyczna wybranych rodzin wirusów:
ortomyksowirusy, pokswirusy, pikornawirusy,
hepadnawirusy, flawiwirusy, rabdowirusy, retrowirusy,
filo wirusy, wiroidy i HDV, priony
0.DĔWRFK:LUXVRORJLDOHNDUVND3=:/
2. L. Collier, J. Oxford: Wirusologia, PZWL 2001
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
(OHPHQW\VNáDGRZHV\ODEXVX
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
RVyESURZDG]ąFHM
przedmiot
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\F]QH
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Opis
Prawo autorskie
:\G]LDá3UDZD$GPLQLVWUDFMLL(NRQRPLL
PrawoAut3
polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDZRZ\FK
RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, III semestr
Dr Julian Jezioro
Z\NáDG
Brak
30
3 ECTS
Przedstawienie uregulowania prawa autorskiego jako
HOHPHQWXSUDZDZáDVQRĞci intelektualnej z
XZ]JOĊGQLHQLHP]DJDGQLHĔ]ZLą]DQ\FK]G]LDáDOQRĞFLą
QDXNRZąLELRWHFKQRORJLąRUD]RGUĊEQRĞFLZ
XUHJXORZDQLXSUDZDDXWRUVNLHJRLSUDZDZáDVQRĞFL
SU]HP\VáRZHMZ\QDOD]NLELRWHFKQRORJLF]QH
Zaliczenia ustne lub pisemne (test).
A. Zagadnienia ogólne: Dobra niematerialne jako
przedmiot prawa. Przedmioty intelektualne jako
szczególny rodzaj dóbr prawnych. 3RMĊFLHL
ZHZQĊWU]QDV\VWHPDW\NDSUDZDZáDVQRĞFL
LQWHOHNWXDOQHM*HQH]DLĨUyGáDSUDZDSROVNLHJRL
UHJXODFMLPLĊG]\QDURGRZ\FK konwencje:
EHUQHĔVNDSDU\VNDSRZV]HFKQDLU]\PVND
SRUR]XPLHQLD75,36WUDNWDW\:,32XNáDGR
ZVSyáSUDF\SDWHQWRZHM3&7NRQZHQFMD
PRQDFKLMVNDĝZLDWRZD2UJDQL]DFMD:áDVQRĞFL
,QWHOHNWXDOQHMSUDZRZáDVQRĞFLLQWHOHNWXDOQHMZ
UE.
=DJDGQLHQLDV]F]HJyáRZe: Prawo autorskie:
Przedmiot prawa autorskiego – utwory, przedmioty
SUDZSRNUHZQ\FKZRJyOQRĞFLRUD]SRGPLRW\SUDZ
autorskich i pokrewnych. Program komputerowy jako
V]F]HJyOQ\URG]DMXWZRUX7UHĞüSUDZDXWRUVNLFK
,QWHUQHWMDNRSROHHNVSORDWDFML3U]HMĞFLe autorskich
SUDZPDMąWNRZ\FKRUD]XPRZDOLFHQF\MQD2UJDQL]DFMH
]ELRURZHJR]DU]ąG]DQLDSUDZDPLDXWRUVNLPLL
pokrewnymi, Komisja Prawa Autorskiego, Fundusz
3URPRFML7ZyUF]RĞFL2FKURQDSUDZDXWRUVNLFK
Ochrona wizerunku, tajemnicy korespondencji oraz
ĨUyGHáLQIRUPDFML3UDZDSRNUHZQH2FKURQDsui
generis baz danych. B. Prawo ZáDVQRĞFLSU]HP\VáRZHM
3URMHNW\Z\QDOD]F]H]HV]F]HJyOQ\PXZ]JOĊGQLHQLHP
wynalazku biotechnologicznego). Znaki towarowe,
16.
Wykaz literatury
podstawowej
Powrót do planu studiów
oznaczenia geograficzne, zwalczanie nieuczciwej
konkurencji oraz uregulowanie antymonopolowe i
normalizacyjne.
Literatura podstawowa: --H]LRUR3UDZRZáDVQRĞFL
intelektualnej, w: Podstawy prawa autorskiego pod
UHGDNFMą(*QLHZND:DUV]DZDRUD]Z
przygotowaniu); J. Barta, R. Markiewicz, Prawo
autorskie, Warszawa 2008.
/LWHUDWXUDX]XSHáQLDMąFD J. Barta, M. Czajkowska'ąEURZVND=ûZLąNDOVNL(7UDSOH50DUNLHZLF]
Ustawa o prawie autorskim i prawach pokrewnych.
Komentarz, Kraków 2005; J. Barta, R. Markiewicz,
Ustawa o ochronie baz danych. Komentarz, Warszawa
2002; 3/&RQGH-0,UXUHWDJR\HQD:-DĞODQ-
03OD]DV3UDZRZáDVQRĞFLLQWHOHNWXDOQHMZ8QLL
Europejskiej, Warszawa 2003; R. Golat, Prawo
autorskie i prawa pokrewne, Warszawa 2005; M.
3RĨQLDN-Niedzielska (red.) Prawo autorskie i prawa
SRNUHZQH=DU\VZ\NáDGX%\GJRV]F]6\VWHP
Prawa Prywatnego. Tom 13. Prawo autorskie (red. J.
Barta), Warszawa 2007; $6]HZF*-\Ī3UDZR
ZáDVQRĞFLSU]HP\VáRZHM:DUV]DZD0GX9DOO
Prawo patentowe, Warszawa 2+ĩDNRZVNDHenzler, Wynalazek biotechnologiczny - przedmiot
patentu, Warszawa 2006.
6</$%8635=('0,2781$678',$&+:<ĩ6=<&+
Lp.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
(OHPHQW\VNáDGRZH
sylabusu
Nazwa przedmiotu
Nazwa jednostki
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Kod przedmiotu
-Ċ]\NZ\NáDGRZ\
*UXSDWUHĞFLNV]WDáFHQLDZ
ramach której przedmiot
jest realizowany
Typ przedmiotu
Rok studiów, semestr
,PLĊLQD]ZLVNRRVRE\
SURZDG]ąFHMSU]HGPLRW
Metody dydaktyczne
:\PDJDQLDZVWĊSQH
/LF]EDJRG]LQ]DMĊü
dydaktycznych
Liczba punktów ECTS
przypisana przedmiotowi
=DáRĪHQLHLFHOHSU]HGPLRWX
Forma i warunki zaliczenia
przedmiotu, w tym zasady
dopuszczenia do egzaminu,
zaliczenia z przedmiotu, a
WDNĪHIRUPĊLZDUXQNL
zaliczenia poszczególnych
IRUP]DMĊüZFKRG]ąF\FKZ
zakres danego przedmiotu
7UHĞFLPHU\WRU\czne
przedmiotu oraz sposób ich
realizacji
Wykaz literatury
podstawowej
Opis
Ekonomia
:\G]LDá3UDZD$GPLQLVWUDFMLL(NRQRPLL
Ekon4
polski
- JUXSDWUHĞFLSRGVWDwowych
- RERZLą]NRZ\GRXNRĔF]HQLDFDáHJRWRNXVWXGLyZ
Studia II stopnia, IV semestr
Dr Sebastian Jakubowski
:\NáDG
Brak
30
3 ECTS
&HOHPZ\NáDGXMHVWSUH]HQWDFMDJáyZQ\FKWHRULLL
NRQFHSFMLHNRQRPLF]Q\FKRUD]ZVND]DQLHPRĪOLZRĞFLLFK
praktycznego wykorzystania przy prowadzeniu
G]LDáDOQRĞFLJRVSRGDUF]HM:LHOHXZDJLSRĞZLĊFRQH
EĊG]LHRGG]LDá\ZDQLXP\ĞOLHNRQRPLF]QHMLUHJXODFML
prawnych na funkcjonowanie gospodarki narodowej.
8F]HVWQLN]DMĊüSRZLQLHQ]GRE\üXPLHMĊWQRĞü
samodzielnej analizy zjawisk gospodarczych oraz
GRNRQ\ZDQLDRFHQG]LDáDĔU]ąGX]SXQNWXZLG]HQLD
potrzeb gospodarki narodowej. Dodatkowo uczestnik
SRZLQLHQSR]QDüSRGVWDZRZHQDU]ĊG]LDDQDOL]\
mikroekonomicznej i sposoby ich wykorzystania w
SURZDG]HQLXG]LDáDOQRĞFLJRVSRGDUF]HM
2FHQLDQLHFLąJáHRUD]]DOLF]HQLHXVWQH
- 3RGVWDZRZHSRMĊFLDLSU]HGPLRWHNRQRPLL
- :VSyáF]HVQHV\VWHP\VSRáHF]QR-gospodarcze.
- *áyZQHQXUW\ZVSyáF]HVQHMHNRQRPLL
- 5\QHNSRS\WSRGDĪ
- Podstawy teorii wyboru konsumenta.
- 3RGVWDZ\WHRULLSU]HGVLĊEiorstwa.
- 5\QNLF]\QQLNyZSURGXNFMLLSRGVWDZ\WHRULLSRG]LDáX
- *áyZQHNDWHJRULHLSRMĊFLDPDNURHNRQRPLL3URGXNWL
dochód narodowy.
- Determinanty dochodu narodowego.
- 5RODSDĔVWZDZJRVSRGDUFH
- %XGĪHWSDĔVWZD
- 6\VWHPSLHQLĊĪQR– kredytowy
- Czynniki wzrostu gospodarczego
- Bezrobocie
- Inflacja
- R. Milewski, Podstawy ekonomii, Warszawa,
najnowsze wydanie.
- D. Begg, S. Fischer, R. Dornbusch, Makroekonomia,
PWE, Warszawa, najnowsze wydanie.
Powrót do planu studiów