28-29 czerwca 2012 Warsztaty Real

28-29 czerwca 2012 Warsztaty
Real-time PCR w oznaczeniach
jakościowych i ilościowych
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
28-29 czerwca 2012 | Poznań | Uniwersytet Medyczny Katedra i Zakład
Biochemii i Biologii Molekularne
ZAPRASZAMY:
biologów molekularnych, biotechnologów i diagnostów laboratoryjnych (z zakresu
genetyki medycznej i poradnictwa genetycznego)
Prowadzący:
– dr Marcin Hołysz, Katedra i Zakład Biochemii i Biologii Molekularnej,
Uniwersytet Medyczny w Poznaniu
– dr Błażej Rubiś, Katedra i Zakład Chemii Klinicznej i Diagnostyki Molekularnej
PROGRAM:
DZIEŃ 1 | 28 czerwca 2012 Technika Real-time PCR – Oznaczenia ilościowe
9.55
Rozpoczęcie warsztatów
10.00
Wykład: Podstawy techniki Real-time PCR
– podstawy techniki Real-time PCR
– formaty detekcji (sondy, barwniki, fluorochromy)
– nomenklatura związana z techniką Real-time PCR (Ct, Cp, ΔΔCt, krzywa
standardowa, wydajność reakcji)
11.00
Projektowanie eksperymentu
– dobór materiału badawczego
– przygotowanie prób (izolacja kwasów nukleinowych, warunki RT PCR)
– zastosowanie Real-Time do oznaczania ilościowego kwasów nukleinowych –
kwantyfikacja względna i bezwzględna
12.00
Przerwa na kawę
12.15
Projektowanie eksperymentu – c.d.
– projektowanie starterów i sond – dostępne oprogramowanie komercyjne i
darmowe, jak i ile zamawiać, przechowywanie, przygotowanie roztworów
roboczych
– dobór genów referencyjnych – standaryzacja wyników
– eksperymenty typu dose-course i time-course
13.15
Przerwa na obiad
14.15
Przygotowanie do eksperymentu
14.30
Część praktyczna – oznaczenie względne (relative quantification) –
reakcja multiplex w formacie Dual-color z kompensacją kolorów
W trakcie reakcji:
– Universal Probe Library (UPL)
– Panele Real-Time Ready
16.15
Interpretacja wyników
16.30
Sesja troubleshooting w oznaczeniach ilościowych
17.00
Zakończenie dnia
DZIEŃ 2 | 29 czerwca 2012 Real-Time w oznaczeniach jakościowych –
genotypowanie
9.00
Wprowadzenie do genotypowania
– SNP, mutacje i ich znaczenie
– genotypowanie techniką real-time PCR jako alternatywa dla RFLP i SSCP
9.30
Projektowanie eksperymentu
– formaty detekcji stosowane w analizie jakościowej
– projektowanie sond HybProbe i Simple Probe – LightCycler Probe Design
Software
– gene scanning – High Resolution Melting (HRM)
– genotypowanie typu end-point – sondy hydrolizujące
10.45
Przerwa na kawę
11.00
Przygotowanie do eksperymentu
11.15
Część praktyczna – genotypowanie metodą HRM
W trakcie reakcji – oznaczenie statusu metylacji z zastosowaniem metody HRM
13.00
Interpretacja wyników
13.15
Przerwa na lunch
14.15
Przygotowanie do reakcji genotypowania za pomoca sond
(HybProbe /Taqman)
W trakcie reakcji – troubleshooting w reakcjach jakościowych
15.30
Interpretacja wyników
16.00
Zakończenie
Więcej informacji: http://www.cemed.pl/spotkania/2012/rt_pcr3/index.php
Rejestracja: http://www.cemed.pl/spotkania/2012/rt_pcr3/formularz_pr.php
Biuro Organizacyjne:
Centrum Edukacji Medycznej CEMED Sp. z o.o.
02-757 Warszawa, ul. Pory 78 p. VI
tel. (022) 355 85 01, fax (022) 355 85 18
e-mail: [email protected]
www.cemed.pl
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Czas na eksperymenty
Niezależna Grupa Popularyzatorów Nauki EKSPERYMENTATORZY
specjalizuje się w niekonwencjonalnych działaniach, promujących
dziedziny przyrodnicze. Zespół pasjonatów przekazuje wiedzę z zakresu
chemii, fizyki i biologii, bawiąc, inspirując oraz zadziwiając.
Wiele z działań grupy może stać się barwnym elementem rozmaitych wydarzeń i
przedsięwzięć i pomóc w zrozumieniu świata nauki, nie tylko przez
najmłodszych. Pierwsza impreza grupy odbędzie się sobotę 26 maja na
Uniwersytecie Śląskim w Katowicach przy ulicy Bankowej 14. Będą to warsztaty
na temat obecności i działania substancji trujących w naszym otoczeniu.
Niezależna Grupa Popularyzatorów Nauki EKSPERYMENTATORZY zaprasza
wszystkie zainteresowane osoby, niezależnie od wieku.
W czasie warsztatów zostaną zaprezentowane toksyczne rośliny i zwierzęta oraz
omówione właściwości występujących w nich substancji. Uczestnicy usłyszą o
historycznej i współczesnej roli trucizn w życiu człowieka.
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Szczegóły na stronie:
www.eksperymentatorzy.org
Anatomia dla początkujących –
ciekawa seria na onet VOD
Na platformie Onet VOD pojawił się ciekawy cykl programów „Anatomia
dla początkujących”. Prezenterem programu jest Dr Gunther von Hagens,
niemiecki lekarz, patomorfolog i anatom, wynalazca plastynacji, który
wykonuje przedstawione na filmach sekcje (jest to jedyny patolog, który
wykonuje sekcje w kapeluszu).
Ze względu na nagrania przedstawiające prawdziwe sekcje, cykl przeznaczony
jest dla osób dorosłych. Program nagrano w Instytucie Plastynacji w Heidelbergu
w Niemczech w obecności dawców ciał i studentów. Wykorzystane do sekcji ciała
były przekazane przez ich właścicieli na cele naukowe.
Cykl
znajdziecie
tutaj: http://vod.onet.pl/anatomia-dla-poczatkujacych,10620,serial.html
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Program
recenzja
e-HEMATimage
–
Czy autoszkolenie może być efektywne? Przedstawiamy program eHEMATimage, znakomite narzędzie do podnoszenia kwalifikacji
diagnostów zajmujących się hematologią.
Wielu z nas surfuje po setkach stron internetowych w poszukiwaniu
wartościowych programów doskonalących. Bezskutecznie. Zawiłość haseł w
wyszukiwarkach oraz mnogość szkoleń uniemożliwia selektywny wybór
odpowiedniego autoszkolenia. Aby zaoszczędzić czas osób zainteresowanych
podnoszeniem swoich kwalifikacji z zakresu hematologii, pozwolę sobie
przedstawić szkolenie ustawiczne e-HEMATimage, w którym miałam okazję wziąć
udział.
Program e-HEMATimage jest częścią projektu o nazwie e-MEDICINimage,
realizowanego przy wsparciu finansowym Komisji Europejskiej. Projekt ten
obejmuje szkolenie z zakresu mikologii, parazytologii oraz hematologii.
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Kształcenie z zakresu hematologii to 9 przypadków klinicznych w roku, które
uczestnik ma za zadanie zdiagnozować. Forma szkolenia jest bardzo ciekawa.
Opiera się ona na krótkim przedstawieniu przez ekspertów przypadku klinicznego
poprzez opis okoliczności pobrania krwi pacjenta oraz podanie wyników
morfologii krwi obwodowej. W niektórych przypadkach udostępniane są również
parametry biochemiczne. W każdym pliku użytkownik otrzymuje 3 pytania
pomocnicze, które mają ukierunkować go w analizie przypadku. Jednym z
najważniejszych elementów rozpoznania jest 25 obrazów rozmazu krwi
obwodowej pacjenta. Zadaniem uczestnika jest określenie typu widocznej na
obrazie komórki tj. w przypadku liczenia odsetka krwinek białych. W razie
wątpliwości można skorzystać z atlasu porównawczego. Rozpoznanie zostaje
uwieńczone odpowiedzią uczestnika. Powinna ona zawierać określenie rodzaju
nieprawidłowości w komórkach (wybrane z listy), hipotezę diagnozy oraz zalecane
testy diagnostyczne. Po walidacji otrzymujemy prawidłowe rozpoznanie wraz z
oceną naszej diagnozy. Dodatkowym wyjaśnieniem zaobserwowanych patologii
jest szczegółowa analiza przypadku przez eksperta, wysyłana na nasz adres
mailowy.
e-HEMATimage jest programem dla osób zainteresowanych realizacją i
interpretacją podstawowych badań laboratoryjnych. Pierwszorazowy udział w
programie jest całkowicie bezpłatny. Więcej informacji na temat e-HEMATimage
znajdziecie na:
http://www.e-hematimage.eu/index.jsp
Uczestnicząc w e-HEMATimage miałam okazję wiele się dowiedzieć o patologiach
hematologicznych. Program uczy nie tylko odróżniania nieprawidłowości komórek
krwi obwodowej, ale również zmusza do analitycznego myślenia, do łączenia
faktów.
Nie każdy z nas pracuje w ośrodku hematologicznym. W codziennej pracy
laboratoryjnej niezbyt często spotykamy się z patologiami komórek krwi
obwodowej. Z powodu braku praktyki w rozpoznawaniu nieprawidłowości łatwo o
przeoczenie. Dlatego też podnośmy swoje kwalifikacje i korzystajmy z możliwości,
które dają nam programy takie jak e-HEMATimage.
Agnieszka Paszczela
Nowy program FNP – zgłoszenia do
16 kwietnia!
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej uruchomiła nowy program – Mentoring
FNP – skierowany do laureatów i stypendystów fundacji. Każdy laureat
tego programu będzie miał szansę rozwinąć współpracę o charakterze
relacji mistrz-uczeń ze znanym badaczem. Zgłoszenia trwają do 16
kwietnia.
Celem programu jest umożliwienie jego uczestnikom (młodym naukowcom
pracującym w Polsce) nawiązania kontaktów i współpracy mentoringowej z
doświadczonymi uczonymi – z Polski lub z zagranicy – o uznanym dorobku
naukowym. Program wspiera pracę w parach mentor-mentorowany tzw. one-toone mentoring.
Tzw. „mentorowanym” może zostać osoba ze stopniem naukowym doktora, która
jest laureatem bądź stypendystą FNP, a mentorem – wskazana przez
mentorowanego osoba, uznana w międzynarodowym środowisku naukowym.
Celem programu jest umożliwienie jego uczestnikom – młodym naukowcom
pracującym w Polsce – nawiązania kontaktów i współpracy mentoringowej z
doświadczonymi uczonymi – z Polski lub z zagranicy.
Podstawą relacji mentoringowej ma być opracowany przez obie strony plan
współpracy obejmujący okres nie krótszy niż rok i nie dłuższy niż 2 lata.
Naukowcom zakwalifikowanym do programu fundacja zapewnia dofinansowanie
do 4 krótkich spotkań mentora i mentorowanego. Laureatom zwrócone będą więc
koszty biletów na przejazd oraz – do pewnego limitu – koszty noclegu, wyżywienia
i transportu poniesione na miejscu.
Mentoring FNP powstał w ramach projektu SKILLS. Kwalifikacja do programu
odbywać się będzie się 4 razy w roku.
Szczegóły
projektu
na
stronie: http://www.fnp.org.pl/programy/aktualne_programy_fnp/projekt_skills/me
ntoring_fnp
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Bioinformatyka – internetowe
szkolenie Ion Torrent
W dniach 13 oraz 28 marca, 12 oraz 23 kwietnia odbędzie się internetowe
szkolenie bioinformatyczne z analizy danych uzyskanych za pomocą urządzenia
Ion Torrent. Szkolenie jest przeznaczone głównie dla osób nie mających
dużego doświadczenia w zakresie bioinformatyki.
Zapisy: http://resource.lifetechnologies.com/pages/WE17339/
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Szkolenie
z
komercjalizacji
wyników badań dla pracowników
naukowych z Wielkopolski: zgłoś
się, zainkasuj 2000zł
Dzięki funduszom z programu Operacyjnego Kapitał Ludzki wystartowało
kilka projektów mających na celu zachęcenie naukowców do
komercjalizacji wyników badań na zasadzie spółek Spin-Off. W
Wielkopolsce trwa właśnie nabór do projektu „BIO-TECH TRANSFER.
Staże i szkolenia biotechnologiczne w INNO-GENE S.A.”
Program darmowego szkolenia oferowanego przez INNO-GENE S.A adresowany
jest do pracowników naukowych i naukowo-dydaktycznych, zajmujących się
stricte biotechnologią.
Nabór wniosków jest prowadzony do 29 lutego, więc zainteresowani muszą się
spieszyć. W celu rejestracji należy wypełnić formularz dostępny na stronie firmy
CB DNA. Ranking zgłoszeń przyjmowany jest w oparciu o punktowane
uzasadnienie chęci udziału w projekcie. Co ważne, dodatkowe punkty
przyznawane są kobietom i osobom zdecydowanym na faktyczne stworzenie firmy.
Projekt trwa 2 tygodnie, podczas których uczestnik zapozna się warunkami
tworzenia spółki spin-off, uzyska fachowe doradztwo co do swojego pomysłu i
pozna „od kuchni” możliwości komercjalizacji technik molekularnych
wykorzystywanych w CB DNA.
Po pomyślnie zakończonym szkoleniu
uczestnik otrzyma dodatkowo 2000zł brutto!
Dalsze informacje o projekcie: strona projektu Biotech-Transfer
Ion Torrent – zaproszenie na
warsztaty w Darmstadt
Life Technologies zaprasza na bezpłatne warsztaty: „Ion Torrent
Technology Workshop”, które będą miały na celu zapoznanie się z
technologią Ion Torrent, oraz obsługą urządzenia do sekwencjonowania
genomu. Spotkanie odbędzie się w Niemczech, w Darmstadt w dniach 14 marca
oraz 19 kwietnia 2012 roku. Udział w warsztatach jest bezpłatny, jednak
organizatorzy nie pokrywają kosztów dojazdu, oraz pobytu.
Więcej
informacji: http://dolinabiotechnologiczna.pl/wp-content/uploads/2012/02/Invitatio
n-Ion-Torrent.pdf
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
Promocja Kół Naukowych
Nie musisz być prezesem. Jeśli należysz do koła naukowego i chcesz, żeby
świat biotechnologów dowiedział się o tym, co robicie, napisz do nas!
Pomożemy w promocji Koła, zareklamujemy organizowaną przez Was
konferencję, zaproponujemy szkolenia.
W ostatnich miesiącach wysłaliśmy zaproszenia do współpracy do ponad
czterdziestu biotechnologicznych Kół Naukowych w całej Polsce. Część z nich
odpowiedziała na nasze zaproszenie. Już wkrótce zostaną opublikowane pierwsze
opisy działalności kół naukowych.
Jeśli chcesz się pochwalić działalnością swojego Koła Naukowego, skontaktuj się z
nami przez bramkę kontaktową!
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych
E-seminarium „Array CGH and
Genomics
Medicine
in
Hematological Malignancies”
Perlan Technologies Polska zaprasza do udziału w e-seminarium pt „Array
CGH and Genomics Medicine in Hematological Malignancies”, które
odbędzie się 9 lutego o 17.00. Seminarium będzie będzie prowadziła p.
Annette Leon Meredith, GenPath, BioReference Laboratories, Inc.
Szczegółowe informacje na temat seminarium znajdziecie po kliknięciu tutaj.
Warsztaty Real-time PCR w oznaczeniach jakościowych i ilościowych