Techniki analizy ruchomych - Wydział Rolnictwa i Biologii

Opis modułu kształcenia / przedmiotu (sylabus)
Rok akademicki:
Grupa przedmiotów:
Numer katalogowy:
Nazwa przedmiotu1):
Techniki analizy ruchomych elementów genetycznych
Tłumaczenie nazwy na jęz. angielski3):
Molecular genetic elements (MGE) analysis techniques
4)
ECTS 1
1,5
BIOLOGIA
Kierunek studiów :
5)
Koordynator przedmiotu :
Mgr Agata Goryluk-Salmonowicz
Prowadzący zajęcia6):
Mgr Agata Goryluk-Salmonowicz
7)
Jednostka realizująca :
Samodzielny Zakład Biologii Mikroorganizmów
Wydział, dla którego przedmiot jest
realizowany8):
Wydział Rolnictwa i Biologii
9)
Status przedmiotu :
a) przedmiot fakultatywny
b) stopień II rok ……
c) stacjonarne
Cykl dydaktyczny10):
Semestr letni
Jęz. wykładowy11):
polski
Założenia i cele przedmiotu12):
Nadrzędnym celem przedmiotu jest zapoznanie studentów z metodami wykorzystywanymi do izolacji i badania
ruchomych elementów genetycznych występujących u bakterii.
Formy dydaktyczne, liczba godzin13):
Metody dydaktyczne14):
a)
wykład;
liczba godzin 8;
b)
ćwiczenia audytoryjne/dyskusja;
liczba godzin 7;
Prezentacje komputerowe, rozwiązywanie problemu, dyskusja,
1.
2.
3.
4.
Pełny opis przedmiotu15):
5.
6.
Wymagania formalne (przedmioty
wprowadzające)16):
Wprowadzenie: co to są ruchome elementy genetyczne (MGE) (1h)
Historia odkrycia ruchomych elementów DNA (1h)
Podział i charakterystyka MGE (integrony, superintegrony, IS, TE, plazmidy, struktura molekularna i
funkcje kodowane przez MGE) (2h)
Metody identyfikacji MGE (wektory pułapkowe w identyfikacji TE, egzogenne i endogenne metody
izolacji plazmidów, poszukiwanie plazmidów w różnych środowiskach) (2h)
Możliwości wykorzystania MGE w inżynierii genetycznej (2h)
Techniki analizy MGE: studenci, w oparciu o materiały literaturowe lub/i własne doświadczenie,
przygotowują materiał do dyskusji dotyczący różnych technik izolacji i pracy z wykorzystaniem MGE,
podczas dyskusji zostaną poruszone problemy jakie można napotkać podczas wykonywania tego typu
doświadczeń (7h).
Mikrobiologia ogólna, Genetyka i biotechnologia bakterii
Student powinien posiadać podstawową wiedzę z zakresu mikrobiologii i
genetyki
01 - Zna terminologię i podstawowe informacje
związaną z GME, opisuje metody izolacji i pracy z
GME.
02 - Pracuje w zespole podczas przygotowywania się 05 Posiada umiejętność wystąpień
prezentowaną podczas zajęć audytoryjnych
do zajęć audytoryjnych
03 - Korzysta z literatury również anglojęzycznej
podczas przygotowywania się do ćwiczeń
04 - Zbiera i interpretuje dane empiryczne i formułuje
odpowiednie wnioski
17)
Założenia wstępne :
Efekty kształcenia18):
Sposób weryfikacji efektów kształcenia19):
ustnych
01-05 udział w dyskusjach oraz praca końcowa
Forma dokumentacji osiągniętych efektów Praca końcowa napisana na podstawie wykładów oraz materiałów przygotowywanych do dyskusji. Prace te
kształcenia 20):
będą przechowywane przez okres 5 lat przez wykładowcę.
Elementy i wagi mające wpływ na ocenę
Obecność na zajęciach (40%), praca końcowa (40%), udział w dyskusji (20%)
końcową21):
Miejsce realizacji zajęć22):
Sala seminaryjna
23)
Literatura podstawowa i uzupełniająca :
1. „Genetyka molekularna” P. Węgleński, PWN, 1995
2.”Biologia molekularna bakterii” J. Baj, Z. Markiewicz, PWN, 2006
3. „Biotechnologia molekularna”J. Buchowicz, PWN,2007
4. “Plasmid isolation from bacteria” C. Rohde, B. Henze, DSMZ GmbH, 2011
5.” Exogenous Isolation of Mobilizing Plasmids from Polluted Soils and Sludges” Eva Top, Ingrid De Smet, Willy Verstraete, Roger Dijkmans and Max
7
Mergeay, Appl Environ Microbiol 60(3): 831–839, 1994
UWAGI24):
8
Wskaźniki ilościowe charakteryzujące moduł/przedmiot25) :
Szacunkowa sumaryczna liczba godzin pracy studenta (kontaktowych i pracy własnej) niezbędna dla osiągnięcia zakładanych efektów
kształcenia18) - na tej podstawie należy wypełnić pole ECTS2:
40 h
Łączna liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
0,75 ECTS
Łączna liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym, takich jak zajęcia laboratoryjne,
projektowe, itp.:
0,75 ECTS
Tabela zgodności kierunkowych efektów kształcenia z efektami przedmiotu 26)
Nr /symbol
efektu
01/ K_W01,
Wymienione w wierszu efekty kształcenia:
Zna terminologię i podstawowe informacje związaną z GME, opisuje metody izolacji i
K_W02,K_W03,
pracy z GME.
Odniesienie do efektów dla programu
kształcenia na kierunku
P2A_W01 P2A_W02 P2A_W03 P2A_W05
P2A_W07
K_W03
02/ K_K02
Pracuje w zespole podczas przygotowywania się do zajęć audytoryjnych
P2A_K02
03/ K_U02
04/ K_U06
Korzysta z literatury również anglojęzycznej podczas przygotowywania się do ćwiczeń
P2A-U02
Zbiera i interpretuje dane empiryczne i formułuje odpowiednie wnioski
P2A-U06
05/ K_U10
Posiada umiejętność wystąpień ustnych prezentowaną podczas zajęć audytoryjnych
P2A-U10
9
2)
Całkowity nakład czasu pracy - przyporządkowania ECTS :
Wykłady oraz ćwiczenia audytoryjne
Udział w konsultacjach (1/3 wszystkich konsultacji)
Przygotowanie się studenta do zajęć audytoryjnych
Przygotowanie pracy pisemnej przez studenta
Razem:
15h
5h
10 h
10 h
40 h
1,5 ECTS
10