opisy kursów/ przedmiotów

Transkrypt

OPIS KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3006w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Ewa Żymańczyk-Duda dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,
Zasady metabolizmu komórkowego,
Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba
godzin
1.
Molekularne podstawy życia
4
2.
Struktura funkcjonalna komórki
4
3.
Mitoza i mejoza
4
4.
Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii
4
5.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny
4
6.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta
-
sterowanie organizmem zwierzęcym
2
-
podpora i ruch ciała
2
-
przetwarzanie pożywienia
2
1
-
wymiana gazowa
2
-
system transportu i odporności-komórki krwi
2
Ćwiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Literatura uzupełniająca
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3006w
Course title
Biology I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Ewa Żymańczyk-Duda, dr inż.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Number of hours
/ week
2
Form of the
course
completion
exam
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
Prerequisites
2
Course description
Structural and functional cell anatomy,
Cell metabolism universals,
Cell diversity and cooperation in multicellular systems
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
Molecular basis of life
4
2.
Functional structure of cell
4
3.
Mitosis and meiosis
4
4.
Universals of cell metabolism. Energy processing
4
5.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants
4
6.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals
-
orchestrating the animal organism
2
-
movement and support
2
-
processing food and wastes
2
-
gas exchange
2
-
internal transport and defense-blood cells
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
3
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
BTC3006w
Biologia I
Barbara Lejczak Prof. dr hab.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
egzamin
Wymagania wstępne
Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,
Zasady metabolizmu komórkowego,
Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych
Liczba
godzin
1.
Molekularne podstawy życia
4
2.
Struktura funkcjonalna komórki
4
3.
Mitoza i mejoza
4
4.
Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii
4
5.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny
4
6.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta
7.
sterowanie organizmem zwierzęcym
2
8.
podpora i ruch ciała
2
9.
przetwarzanie pożywienia
2
4
10. wymiana gazowa
2
11. system transportu i odporności-komórki krwi
2
Warunki zaliczenia
egzamin
Course code
BTC3006w
Course title
Biology I
Barbara Lejczak, Prof. dr hab.
Course form
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Lecture
2
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
exam
Prerequisites
5
Course description
Structural and functional cell anatomy,
Cell metabolism universals,
Cell diversity and cooperation in multicellular systems
Lecture
Number of hours
1.
Molecular basis of life
4
2.
Functional structure of cell
4
3.
Mitosis and meiosis
4
4.
Universals of cell metabolism. Energy processing
4
5.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants
4
6.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals
orchestrating the animal organism
2
movement and support
processing food and wastes
2
gas exchange
2
internal transport and defense-blood cells
2
2
Basic literature
exam
6
BTC3007w
Biologia II
Barbara Lejczak Prof. dr hab.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
egzamin
Wymagania wstępne
Roślina, zwierzę-nowa generacja. Ewolucja prebiotyczna. Pochodzenie i historia życia. Biosfera i ekosystemy.
Elementy ekologii populacji. Chemizm oddziaływań pomiędzy organizmami.
Liczba
godzin
1.
Jak powstaje i rozwija się organizm zwierzęcy ?
2
2.
Jak powstaje i rozwija się organizm roślinny ?
2
3.
Źródła zmienności genetycznej.
4
4.
Jak powstało i ewoluowało życie ?
2
5.
Czynniki i mechanizmy ewolucji-pochodzenie gatunku.
2
6.
Przedmiot ekologii, podstawowe pojęcia.
2
7.
Procesy ekologiczne.
2
8.
Czynniki środowiska.
2
9.
Tolerancja ekologiczna.
2
10. Ekologia biocenoz.
2
7
11. Sukcesja ekologiczna.
2
12. Relacje pomiędzy organizmami tworzącymi biocenozę, chemia ekologiczna.
2
13. Ekologia populacji.
2
Warunki zaliczenia
egzamin
Course code
BTC3007w
Course title
Biology II
Course form
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Lecture
2
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
exam
Prerequisites
8
Course description
Plant and animal – new generation. Prebiotic evolution. The origin and history of life. Bisphere and ecosystems.
Population ecology. Chemistry of the interaction between organisms.
Lecture
Number of hours
1.
Growth and development of a plant.
2
2.
Growth and development of an animal
2
3.
Chromosomes, genes, heredity.
4
4.
Life history and evolution.
2
5.
Mechanisms of evolution – the origin of species.
2
6.
Ecology – what is it about?
2
7.
Ecological processes.
2
8.
Environmental factors.
2
9.
Theory of ecological tolerance.
2
10. Ecology of biocenoses.
2
11. Succesion: ecosystem change and stability.
2
12. Interactions between organisms.
2
13. Population ecology.
2
Basic literature
exam
9
BTC3008w
Mikrobiologia
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
egzamin
Wymagania wstępne
Zaliczone kursy: Biologia I oraz Biologia II
Charakterystyka drobnoustrojów. Wirusy i patogeny subwirusowe. Komórka prokariotyczna - anatomia
strukturalna. Zmienność genetyczna. Metabolizm. Grupy fizjologiczne drobnoustrojów. Systematyka i
diagnostyka.
Liczba godzin
1. Podstawowa charakterystyka drobnoustrojów.
2
2. Wirusy i patogeny subwirusowe.
4
3. Hodowla i wzrost mikroorganizmów.
2
4. Morfologia komórki prokariotycznej, struktury subkomórkowe i ich funkcje. Cykle
4
życiowe
5. Podział komórki, replikacja DNA i kontrola ekspresji genow.
4
6. Rodzaje i mechanizmy zmienności genetycznej u bakterii.
4
7. Metabolizm tlenowy bakterii.
2
8. Bakterie autotroficzne – fotosynteza bakteryjna
2
9. Bakterie autotroficzne – chemosynteza. Metanogeny i metylotrofy.
2
10
10. Metabolizm beztlenowy bakterii – charakterystyka bakterii beztlenowych i
2
fermentujących.
11. Podstawy systematyki i diagnostyki bakterii.
2
„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993
„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.
“Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie” P. Singleton, PWN 2000
Warunki zaliczenia
Egzamin
Course code
BTC3008w
Course title
Microbiology
Barbara Lejczak
Course form
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Lecture
2
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
exam
Prerequisites
11
Passed exam: Biology I and Biology II
Course description
Characteristics of microorganisms. Viruses and subviral patogens. Structural and functional anatomy of
prokaryotic cell. Genetic diversity. Metabolism. Physiological groups of microorganisms. Principles of
systematics and diagnostics.
Lecture
Number of hours
1. The basic characteristic of microorganisms.
2
2. Viruses and subviral patogens.
4
3. Nutrition, cultivation and growth of microorganisms.
2
4. Procaryotic cell organization, structure and function, life cycles.
4
5. Cell division, DNA replication, regulation of gene expression.
4
6. Mechanisms of genetic diversity in bacteria.
4
7. Bacterial aerobic metabolism.
2
8. Autotrophic bacteria – bacterial photosynthesis.
2
9. Autotrophic bacteria – chemolitotrophy. Metanogens, methylotrophs.
2
10. Bacterial anaerobic metabolism – characteristic of anaerobic bacteria.
2
Fermentating bacteria.
11. Principles of bacterial systematics and diagnostics.
2
Basic literature
„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993
„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.
exam
12
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
BTC4034w,s
Metody biotechnologiczne w ochronie środowiska
Katarzyna Chojnacka, dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma
zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
2
2
kolokwium
referat
Liczba
punktów
3+2
Wymagania wstępne
Celem kursu jest przedstawienie metod biotechnologicznych stosowanych w oczyszczaniu wód, powietrza oraz
w unieszkodliwianiu odpadów stałych. Kurs obejmuje dyskusję zagadnień związanych zarówno z tradycyjnymi
metodami oczyszczania ścieków komunalnych pracujących na bazie osadu czynnego jak i metod nowoczesnych
usuwania zanieczyszczeń nieorganicznych (w tym metali ciężkich) oraz organicznych (ksenobiotyków) –
biosorpcji i bioakumulacji. Zostaną przedstawione również możliwości zastosowania organizmów żywych do
uzdatniania powietrza (biofiltry) oraz unieszkodliwiania odpadów stałych (kompostowanie, biodegradacja).
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Procesy biotechnologiczne w ochronie środowiska.
1
2. Charakterystyka zanieczyszczenia powietrza, wód oraz odpady stałe.
1
3. Oczyszczanie ścieków metodą osadu czynnego.
2
4. Mikrobiologia ścieków i osadu czynnego. Statyka i kinetyka wzrostu mikroorganizmów
2
oraz usuwania węgla (BZT5).
5. Nitryfikacja, denitryfikacja usuwanie związków fosforu.
2
6. Biosorpcja i bioakumulacja jonów metali ciężkich oraz związków organicznych.
2
7. Zastosowanie mikroorganizmów immobilizowanych
do oczyszczania ścieków i
2
unieszkodliwiania odpadów.
8. Zastosowanie mikroalg i mikrofitów w biotechnologii środowiskowej.
2
9. Procesy biotechnologiczne w uzdatnianiu wody pitnej.
1
10. Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym.
2
11. Stawy i laguny.
2
12. Dezynfekcja.
1
13. Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków.
1
14. Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków.
2
15. Metody biohydrometalurgiczne.
1
16. Stabilizacja szlamów - trawienie tlenowe i beztlenowe..
1
17. Zagospodarowanie odpadów stałych – metody kompostowania.
1
18. Bioremediacja gruntów i gleb.
1
19. Uzdatnianie powietrza z zastosowaniem filtrów biologicznych.
1
13
20. Biotechnologia odsiarczania węgla i ropy naftowej.
21. Przyszłość zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.
1
1
Celem seminarium jest samodzielne zapoznanie się z aktualnym stanem wiedzy naukowej i praktycznej
zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.. Będą poruszane następujące zagadnienia:
1. Charakterystyka ścieków
2. Terminologia w oczyszczaniu ścieków
3. Konwencjonalne metody oczyszczania ścieków
4. Osad czynny - mikrobiologia, hodowla, denitryfikacja, nitryfikacja, biologiczne metody usuwania
fosforu.
5. Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym
6. Stawy i laguny - procesy tlenowe i beztlenowe
7. Biotechnologia środowiskowa mikroalg.
8. Oczyszczanie przez glebę
9. Bioremediacja i kompostowanie
10. Stabilizacja szlamów
11. Dezynfekcja
12. Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków
13. Zaawansowane metody oczyszczania ścieków
14. Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków
15. Przyszłość oczyszczania i ponownego wykorzystania ścieków
Materiał do samodzielnego opracowania
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,
1995
5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,
1996
9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000
Warunki zaliczenia
kolokwium
14
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
BTC4034w,s
Course title
Methods biotechnological in environmental protection
Supervising course lecturer
Katarzyna Chojnacka, Ph. D.
Other course lecturers
Course structure
Course form
Number of
hours /week
Form of the
course
completion
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
2
2
colloquium
lecture
Number of
credits
3+2
Prerequisites
Course description
The aim of the lecture is to present biotechnological methods of water, air conditioning and solid wastes
treatment. The lecture discusses issues associated with traditional methods of municipal wastes treatment
(activated sludge method), as well as modern methods of inorganic (mainly heavy metals) and organic
(xenobiotics) pollutants removal with the application of processes of biosorption and bioaccumulation. Also the
possibilities of living organisms application in air treatment (biofilters) and solid wastes disposal (composting,
biodegradation) are discussed.
Lecture
Number of hours
1. Biotechnological processes in environmental protection.
1
2. Characteristics of air and water pollutants and solid wastes.
1
3. Activated sludge method of wastewater treatment.
2
4. Microbiology of effluents and activated sludge. Statics and kinetics of microbial growth
2
and organic carbon removal (BOD).
5. Nitrification, denitrification, and phosphorus removal..
2
6. Biosorption and bioaccumulation of heavy metal ions and organic compounds.
2
7. The application of immobilized microorganisms in wastewater treatment and solid wastes
2
conditioning.
8. The application of microalgae and microphytes in environmental biotechnology.
2
9. Biotechnological methods of water purification.
1
10. Aerobic process in biological beds.
2
11. Ponds and lagoons.
2
12. Disinfection.
1
13. Design of unit process in wastewater treatment technologies.
1
14. Wastewater disposal and reuse.
2
15. Biohydrometallurgical methods.
1
16. Sludges conditioning - aerobic and anaerobic processes.
1
17. Utilization of solid wastes – composting methods.
1
18. Bioremediation of grounds and soils.
1
19. Air conditioning with the application of biological filters.
1
15
20. Biotechnological methods of coal and crude oil desulfurization.
21. The future aspects of the application of biotechnological methods in environmental
protection.
1
1
Classes, seminars - the contents
The aim of the seminar is to check the state-of-the-art and know-how in the application of biotechnological
methods in environmental protection. The following problems will be discussed:
1. Characteristics of effluents
2. Terminology in wastewater treatment
3. Conventional methods of wastewater treatment
4. Activated sludge - microbiology, culture, nitrification, denitrification, biological processes of phosphorus
removal
5. Aerobic process in biological beds.
6. Ponds and lagoons - aerobic and anaerobic processes.
7. Remediation by soil
8. Bioremediation and composting
9. Stabilization of sludges
10. Disinfecting
11. Wastewater treatment plant design
12. Advanced methods of wastewater treatment
13. Environmental microalgal biotechnology
14. Wastes reuse and disposal
15. The future trends in environmental biotechnology.
Material for self preparation
Core literature
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,
1995
5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,
1996
9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000
Conditions for course credition
lecture
16
TCC4227w,s
Ochrona środowiska
Henryk GÓRECKI, prof. zw.
Józef Hoffmann, dr hab.; Helena Górecka, dr, Krystyna Hoffmann, dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma
zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
2
1
egzamin
zaliczenie
Liczba
punktów
3+1
Wymagania wstępne
Celem kursu jest przedstawienie podstawowych problemów związanych z ochroną środowiska przed
działalnością gospodarczą człowieka. W kursie uwzględniono przedstawienie problemów związanych z
obiegiem substancji w przyrodzie, ochroną ekosystemów. przedstawiona zostaną główne źródła przemysłowych
skażeń, a także wpływ działalności rolniczej na środowisko. Przedstawione szeroko metody monitorowania
skażeń, a także nowe systemy bezpiecznej dla środowiska budowli nowych obiektów przemysłowych.
Liczba godzin
1. Krążenie materii w przyrodzie
1
2. Cyrkulacja atmosfery
1
3. Rozprzestrzenianie się zanieczyszczeń w atmosferze
2
4. Obieg wody w przyrodzie
2
5. Antropogeniczne zagrożenia wód powierzchniowych i podziemnych
2
6. Składniki gleb i ich przemiany
2
7. Degradacja i ochrona gleb
2
8. Główne przyczyny zmian środowiska wywołane działalnością człowieka
2
9. Zanieczyszczenia wywołane przez produkcję rolną i hodowlaną
2
10. Główne rodzaje zanieczyszczeń wytwarzanych przez energetykę, przemysł ciężki, rolno2
spożywczy, papierniczy i inne.
11. Odpady komunalne: problemy ich składowania i utylizacji
2
12. Systemy monitoringu zanieczyszczeń środowiska
2
13. Międzynarodowe konwencje dotyczące ochrony środowiska
2
14. Zasady BAT – The Best Available Technology – w proekologicznym projektowaniu
2
15. Zasady zrównoważonego rolnictwa tzw. Code of the Best Agricultural Practice
2
16. Główne przepisy prawne i organizacja ochrony środowiska w Polsce.
2
17
• Międzynarodowe programy ekologiczne
• Program Odpowiedzialność i Troska
• Proekologiczne rozwiązania w krajowym przemyśle
• Rekultywacja terenów przemysłowych
• Procedura inwestowania w przemyśle biolotechnologicznym i chemicznym
• Oceny oddziaływania na środowisko
• Bezpieczne dla środowiska systemy dystrybucji chemikaliów
• Zasady bezpiecznego transportu i magazynowania
• Gospodarka opakowaniami
• Systemy zarządzania środowiskiem – ISO – 14 000
• Racjonalna gospodarka wodno-ściekowa
• Eutrofizacja zbiorników wodnych
• Związki fosforu w środowisku
• Obieg związków azotu w środowisku przyrodniczym
• Gospodarka odpadami i osadami ściekowymi
• Racjonalizacja zużycia energii w produkcji biotechnologicznej i chemicznej
• Obieg metali w środowisku i łańcuchu pokarmowym
• Dopuszczalna emisja
• Bezpieczne dla zdrowia i środowiska warunki pracy
• Dyrektywy Unii Europejskiej chroniące środowisko
• Bezpieczne dla zdrowia i środowiska stosowanie agrochemikaliów
• Światowe katastrofy ekologiczne.
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego, 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne 2002
P. Kowali – Ochrona środowiska glebowego 2002.
Pr. Zbior. - Zarządzanie środowiskiem 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska 1999
Warunki zaliczenia
egzamin
Course code
TCC4227w,s
Course title
Environmental protection
Henryk GÓRECKI, prof. zw.
18
Othe course lecturers
Józef Hoffmann dr hab. Helena Górecka dr, Krystyna Hoffmann dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.
Course structure
Course form
Number of
hours /week
Form of the
course
completion
Lecture
Classes
Laboratory
2
examination
Project
Seminar
1
Number
of credits
3+1
test
Prerequisites
Course description
The main contamination of environment caused by energetic system, industry, agricultural – food industry, paper
industry, petroleum industry, fertilizer industry. Municipal wastes, their storage and utilization. Monitoring of
environmental pollution. System of the Best Available Technology. The Best Code of Agricultural Practice.
International convention on environmental protection. Environmental regulations and organization of
environmental protection in Poland.
Lecture
Number of hours
1. Substances circulation in nature
1
2. Circulation in atmosphere
1
3.Propagation of impurities in atmosphere
2
4. Water cycle in nature
2
5. Antropogenic pollution of surface and underground water
2
6. The chemistry of soils
2
7.Soil degradation and soil protection
2
8. The main of environmental changes caused by human activity
2
9. Pollution of the environment by agriculture and husbandry
2
10. The main contamination of environment caused by energetic system, industry,
2
agricultural-food industry, paper industry, petroleum industry, fertilizer industry
11. Municipal wastes, their storage and utilization
2
12. Monitoring of environmental pollution
2
13. System of Best Available Technology
2
14. The Best Code of Agricultural Practice
2
15. International conversion of environmental protection
2
16. Environmental regulations and organization of environmental protection in Poland .
2
• International environmental programs
• Responisible and Care Program
• Safe and environmental solutions in domestic industry
• Recultivation of post-industrial land
• The investment system in chemical and biotechnological industry
• Estimation of environmental impacts
• Safe systems of chemical distribution
• Application of packing in the environmental protection system
•
The principles of the safe transport and storage
• Environmental Management System ISO 14 000
• Management of water in industrial systems
• Eutrofisation of rivers, lakes and coastal water
19
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Compounds of phosphorus in environment
Waste and sewage waste management system
Optimal energy use in biotechnological and chemical industry
Metals in environment and in food chain
Emission standard in industry
Safe occupational condition of work
Pollution control in directives of EC
Safe for health and environment agrochemical use
Ecological world catastrofes
Core literature
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne, 2002
P. Kawali – Ochrona środowiska glebowego, 2002
Pr. Zbior. – Zarządzanie środowiskiem, 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska, 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska, 1999.
20
BTC4031w,c
Inżynieria bioprocesowa I
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.
Lucyna Górska, dr inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma
zaliczenia
Ćwiczenia
2
2
egzamin
kolokwium
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
3+2
Wymagania wstępne
Charakterystyka reaktorów i bioreaktorów oraz metody ich obliczania i doboru.
1. Podstawy inżynierii bioreaktorów
2. Bilansowanie przemian biochemicznych
3. Bilans elementarny przemiany i przemiana podstawowa
4. Stopnie redukcji przemiany biochemicznej
5. Podstawy kinetyki reakcji enzymatycznych
6. Modele wzrostu populacji mikroorganizmów
7. Bioreaktory idealne
8. Bioreaktory nieidealne
9. Bilansowanie bioreaktorów
10. Makro - i mikromieszanie
11. Podstawowe typy hodowli wgłębnej
12. Bioreaktory enzymatyczne
13. Bioreaktory z unieruchomionym materiałem biologicznym
14. Obliczanie i projektowanie bioreaktorów
Liczba godzin
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
Zasady bilansowania obiektów otwartych i zamkniętych. Bilans masowy przepływu. Obliczenia oporów
przepływu w rurociągach. Praktyczne wykorzystanie równania Bernoulliego. Obliczanie wężownic, wypływ
cieczy ze zbiornika. Obliczenia instalacji pompowych i dobór pomp. Obliczenia dotyczące opadania cząstek
stałych. Rozdzielanie zawiesin: filtracja, płukanie placka filtracyjnego, sedymentacja. Prawa wymiany ciepła:
przewodzenie, wnikanie i przenikanie ciepła. Bilans wymiany ciepła. Obliczanie wymienników ciepła.
21
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986
Warunki zaliczenia
wykład: egzamin
ćwiczenia: obecności, kolokwium
Course code
BTC4031w,c
Course title
Bioprocess engineering I
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.
Course structure
Course form
Number of
hours /week
Form of the
course
completion
Lecture
Classes
2
2
examination
colloquium
Laboratory
Project
Seminar
Number of
credits
3+2
Prerequisites
Course description
Reactors and bioreactors characteristics - methods of choice and calculation.
22
Lecture
1. Fundamentals of bioreactors engineering
2. Balance of biotechnological systems
3. Balance of basic transformations
4. Reduction degree in biochemical transformation
5. Fundamentals of enzyme reaction kinetics
6. Models of growth of microorganisms
7. Ideal bioreactors
8. Non-ideal bioreactors
9. Balance of bioreactors
10. Micro- and macromixing
11. Basic type of microorganisms growth
12. Enzyme bioreactors
13. Immobilization of biocatalyst
14. Bioreactors design
Number of hours
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
The rules of balancing of open and closed systems. Mass balance of flow. Calculation of flow resistances in
pipelines. Practical usage of Bernoulli equation. Pipe coil calculations, liquid out flow a tank. Pump installation
calculations and pump selection. Solid particles settlement calculations. Suspension separation: filtration,
sedimentation. Heat transfer laws: cocduction, individual and overall heat transfer. Heat transfer balance. Heat
exchanger calculations.
Core literature
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986
Lecture: examination
Classes: colloquium
23
BTC4032w,l
Inżynieria bioprocesowa II
Andrzej Kołtuniewicz, prof. dr hab. inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma
zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
2
3
egzamin
sprawozdania,
kolokwium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
3+3
Wymagania wstępne
Inżynieria bioprocesowa I. Chemia fizyczna. Analiza matematyczna.
Kurs przygotowuje do zrozumienia i stosowania dyfuzyjno – cieplnych procesów jednostkowych w biotechnologii do przygotowania i rozdziału substratów i produktów.
1. Przewodzenie ciepła, konwekcja, promieniowanie, wrzenie i kondensacja par
2. Nieustalony transport ciepła, Przykłady obliczeń cieplnych bioprocesów
3. Transport masy w bioprocesach,
4. Dyfuzja nieustalona i ustalona, Wyznaczanie współczynników dyfuzji
5. Mechanizmy transportu masy, Teorie transportu masy na granicy faz
6. Metody przygotowania surowców (up-stream processing0, dezintegracja komórek
7. Dobór metod oczyszczania i rozdziału bioproduktów
8.. Metody membranowe – odwrócona osmoza, nanofiltracja, ultrafiltracja, elektrodializa
9. Metody sorpcyjne, destylacja, ekstrakcja
10. Metody elektrokinetyczne
11. Suszenie materiałów biologicznych
Liczba godzin
7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3
Profil prędkości płynu w rurociągu. Charakterystyka pompy. Wyznaczanie współczynnika wypływu na
podstawie czasu opróżniania zbiornika. Wymiennik ciepła typu „rura w rurze”. Wnikanie i przenikanie ciepła w
24
mieszalniku cieczy. Wnikanie ciepła przy wrzeniu cieczy. Wyznaczanie WRPT w rektyfikacyjnej kolumnie z
wypełnieniem. Charakterystyka kolumny wypełnionej. Objętościowy współczynnik i wysokość jednostki
przenikania masy. Stopień wyekstrahowania. Kinetyka rozpuszczania ciała stałego. Adsorpcja izotermiczna
okresowa.
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980
2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3
3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985
2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji
Warunki zaliczenia
Wykład: egzamin pisemny i ustny
Laboratorium: sprawozdania i kolokwium
Course code
BTC4032w,l
Course title
Bioprocess engineering II
Andrzej Kołtuniewicz, dr hab. inż., prof.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Course structure
Course form
Number of
hours /week
Form of the
course
completion
Lecture
Classes
Laboratory
2
3
examination
reports, test
Project
Seminar
Number of
credits
3+3
Prerequisites
Bioprocess engineering I. Physical chemistry. Mathematical analysis.
25
Course description
The course prepares to understanding and application thermo-diffusional unit processes in biotechnology for
preparing and separation of substrates and products.
Lecture
1. Conduction, convection, radiation, boiling, vapour condensation
2. Unsteady heat transport
3. Heat transport calculations in bioprocesses
4. Mass transport in bioprocesses
5. Unsteady and steady state diffusion.
6. Determination of diffusion coefficients
7. Mechanism of mass transfer
8. Mechanisms and theories on mass transport in interface
9. Mass transport calculations in bioprocesses
10. Diffusional methods of separation
11. Drying of biological materials
Number of hours
7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3
Distribution of fluid velocity in pipe. Pump characteristics. Determination of outflow coefficient by measuring
time of liquid discharge from a tank. Double pipe heat exchanger. Heat transfer in batch mixer. Heat transfer
during liquid evaporation. Determination of HETP in packed rectification column. Packed column
characteristics. Overall mass transfer coefficient and the height of mass transfer unit. Extraction efficiency.
Kinetics of solids dissolution. Periodic isothermal adsorption.
Core literature
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980
2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3
3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985
2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji
Lecture: Examination
Lab.: reports, test
26
BTC4038w
Kultury tkankowe
Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
egzamin
Wymagania wstępne
biochemia, biologia molekularna, biologia komórki, inżynieria genetyczna
Kurs rozpoczyna się porównaniem budowy komórek roślinnych i zwierzęcych oraz kaskad regulacji procesów
fizjologicznych na poziomie molekularnym, po czym omawia czynniki determinujące i regulujące cykl
komórkowy. Wprowadza w sposoby prowadzenia hodowli różnych linii komórkowych roślinnych i zwierzęcych
(stałych i suspensyjnych) z uwzględnieniem wpływu czynników zewnętrznych na wzrost i różnicowanie
komórek. W trakcie kursu studenci będą mogli poznać techniki pozwalające na modyfikacje genetyczne
komórek prowadzonych w kulturze oraz metody wykorzystania kultur tkankowych i modyfikacji komórek do
produkcji roślin i zwierząt transgenicznych. Omówione zostanie zastosowanie hodowli komórkowych w
technologii komórkowej do klonowania roślin i zwierząt oraz do produkcji przeciwciał monoklonalnych.
Odrębna część wykładu poświęcona będzie badaniu podłoża molekularnego chorób genetycznych, testowaniu
nowoczesnych technik stosowanych w terapii genowej, poznawaniu molekularnych podstaw procesów
onkogenezy, identyfikacji onkogenów i genów supresorowych.. Kurs wprowadza również w zagadnienia
dotyczące procesów różnicowania i czynników, które indukują różnicowanie organizmów roślinnych i
zwierzęcych.
Liczba godzin
1.Budowa i fizjologia komórki zwierzęcej i roślinnej
2
2. Cykl komórkowy i jego regulacja na poziomie molekularnym .
2
3.Kultury komórkowe roślinne
2
4. Kultury komórkowe zwierzęce
2
5. Genetyczne modyfikacje komórek zwierzęcych
4
27
6. Genetyczne modyfikacje komórek roślinnych
7. Produkcja przeciwciał monoklonalnych
4
2
8.Technologia komórkowa – klonowanie roślin i zwierząt
4
9. Kultury komórkowe w badaniu procesów onkogenezy i molekularnych podstaw chorób
genetycznych
4
10. Rożnicowanie i indukcja procesów różnicowania
4
•
Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.
•
Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002
•
Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.
•
Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers.
Publikacje w czasopismach naukowych
Warunki zaliczenia
egzamin
Course code
BTC4038w
Course title
Plant and animal tissue cultures
Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD
28
Course form
Lecture
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
2
Number of
points
3
egzam
Prerequisites
biochemistry, molecular biology, cell biology, genetic engineering
Course description
The course starts with the comparison of the structure of the plant and animal cells as well as regulatory
cascades of the physiological processes, on the molecular level, and then discusses the factors which determine
and regulate the cell cycle. This course will introduce to the methods of growing tissue cultures of different plant
and animal cell lines (solid and in suspension) with the emphasis to the influence of the environmental factors on
the growth and differentiation of the cell. During this course the students will learn the techniques allowing
genetic transformation of the cells in the culture and the methods utilizing tissue cultures and cell modifications
for production of the transgenic plants and animals. The application of the tissue cultures in cell technology for
plants and animal coloning and in hybridoma technology will be discussed. The separate part of the course will
be devoted to depict the investigation of the molecular basiis of the genetic disorders, testing the modern
techniques being developed for gene therapy, revealing the molecular basis of oncogenesis and identification of
oncogenes and suppressor genes. The course will introduce also to the problems of differentiation processes and
the factors which induce differentiation in plant and animal organisms.
Lecture
Number of hours
1. The structure and physiology of plant and animal cells
2
2. Cell cycle and its regulation on the molecular level
2
3. Plant tissue cultures
2
4. Animal tissue cultures
2
5. Genetic modification of animal cells
4
6. Genetic modifications of plant cells
4
7. Hybridoma technology
2
8. Cell technology – plant and animal cloning
9. Tissue cultures in investigation of oncogenesis and molecular basis of genetic disorders
10. Differentiation and induction of differentiation processes
4
4
4
Basic literature
29
•
Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.
•
Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002
•
Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.
•
Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers
Publications in scientific journals
egzam
30
BTC4036w
Inżynieria genetyczna
Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
3
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
5
Egzamin
Wymagania wstępne
Biochemia I
Kurs podstaw inżynierii genetycznej. Obejmuje zagadnienia związane z podstawami inżynierii genetycznej.
Kurs omawia problemy zależności między ekspresją genów a ich funkcją, różne aspekty praktyczne i
teoretyczne klonowania genów, analizy sekwencji DNA, podstawowe pojęcia proteomiki i genomiki,
zagadnienia związane z otrzymywaniem rekombinowanych białek, jak również roli klonowania genów w
medycynie i rolnictwie.
1.
Liczba godzin
Co to jest klonowanie DNA? Wprowadzenie do podstawowych problemów i
technik inżynierii genetycznej.
2
2.
Plazmidy i bakteriofagi jako narzędzia transferu genów.
2
3.
Manipulowanie oczyszczonym DNA.
4.
Wektory i metody używane do klonowania w E. coli.
5.
Wektory i metody używane do klonowania w komórkach eukariotycznych.
6.
Poszukiwanie klonu specyficznego genu.
2
7.
Sekwencjonowanie DNA i mutageneza.
2
8.
Reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR).
9.
Badanie lokalizacji i struktury genu.
2
2
2
31
10. Badanie ekspresji i funkcji genu.
2
11. Analiza genomów i proteomów.
2
12. Produkcja białek rekombinowanych.
13. Klonowanie DNA i jego analiza w medycynie.
2
14. Klonowanie DNA i jego analiza w rolnictwie.
2
Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4th edition, 2001, Blackwell Science Ltd.
Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.
Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6th edition, 2001, Blackwell
Science
Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3rd edition, 2003, Blackwell
Science
Warunki zaliczenia
Egzamin
Course code
BTC4036w
Course title
Genetic Engineering
Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
32
points
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
3
5
Examination
Prerequisites
Biochemistry I
Course description
Course of the basics of genetic engineering. Course consists of the problems of relationships between gene
expression and function, molecular cloning, DNA manipulation, gene exploring, basics of proteomics and
genomics, obtaining of recombinant proteins and the role of cloned DNA in medicine and agriculture.
Lecture
1.
Number of hours
What is this DNA cloning? Introduction to basic problems and techniques of genetic
engineering.
2
2.
Vehicles for gene cloning: plasmids and bacteriophages.
2
3.
Manipulation of purified DNA.
2
4.
Cloning vectors for E. coli.
2
5.
Cloning vectors for eukaryotes.
6.
How to obtain a clone of a specific gene.
7.
DNA sequencing and mutagensis.
2
8.
The polymerase chain reaction (PCR).
2
9.
Studying gene location and structure.
2
10. Studying gene expression and function.
11. Studying genomes and proteomes.
2
2
12. Production of recombinant proteins.
2
13. Gene cloning and DNA analysis in medicine.
2
14. Gene cloning and DNA analysis in forensic science.
2
Basic literature
Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4th edition, 2001, Blackwell Science Ltd.
Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.
33
Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6th edition, 2001, Blackwell
Science
Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3rd edition, 2003, Blackwell
Science
Examination
34
BTC3010w
Biochemia II
Piotr Dobryszycki dr inż.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
Egzamin
Wymagania wstępne
Kontynuacja kursu Biochemia I obejmująca zagadnienia związane z uzyskiwaniem energii w procesach
metabolicznych i biosyntezą elementów budulcowych.
Liczba godzin
1. Glikoliza.
2
2. Cykl Krebsa.
2
3.Fosforylacja oksydacyjna.
3
4.Szlak pentozofosforanowy i glukoneogeneza.
2
5.Metabolizm glikogenu.
3
6.Metabolizm kwasów tłuszczowych.
2
7.Rozkład aminokwasów i cykl mocznikowy.
2
8.Fotosynteza.
4
.9.Biosynteza lipidów i steroidów błon komórkowych
2
10.Biosynteza aminokwasów i hemu.
2
11.Biosynteza nukleotydów.
2
12.Integracja metabolizmu.
35
2
Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Warunki zaliczenia
Egzamin testowy z Biochemią I
Course code
BTC3010w
Course title
Biochemistr II
Piotr Dobryszycki, dr
Course form
Lecture
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
2
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
examination
Prerequisites
Biochemistry I
Course description
Continuation of the Biochemistry I course which contains problems of transducing and storing energy and
36
synthesizing the molecules of life.
Lecture
Number of hours
1. Glycolisis.
2
2. The citric acid cycle.
2
3.Oxidative phosphorylation.
3
4.The pentose phosphate pathway and gluconeogenesis.
2
5.Glycogen metabolism.
3
6.Fatty acid metabolism.
2
7.Amino acid catabolism and urea cycle.
2
8.Photosynthesis.
4
.9.The biosynthesis of membrane lipids and steroids.
2
10.The biosynthesis of amino acids and heme.
2
11.Nucleotide biosynthesis.
2
12.The integration of metabolism
Basic literature
Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)
Test examination with Biochemistry I
37
BTC 4035w
Biotechnologia
Prof. dr hab. Barbara Lejczak, dr inż. Magdalena Klimek-Ochab
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
4
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium Projekt
Seminarium
Punkty
6
egzamin
Wymagania wstępne
Zaliczone kursy: Biologia I, II oraz Mikrobiologia
Praktyczne zastosowania procesów biotransformacji z użyciem mikroorganizmów i enzymów, selekcja i
odpowiednie przygotowanie mikroorganizmu do procesu biotechnologicznego. Biotechnologia w różnych
gałęziach przemysłu.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
Techniczne zastosowania biokatalizy, biokataliatory.
Selekcja i doskonalenie mikroorganizmów. Produkcuja biomasy.
Przechowywanie mikroorganizmów. Metody kontroli przyrostu biomasy.
Formy biokatalizatorów i metody ich zastosowania.
Dlaczego reakcje enzymatyczne? Mity i prawdy o zastosowaniu technicznym
enzymów.
Procesy techniczne wykorzystujące jeden lub więcej etapów biokatalizowanych.
Zastosowanie biotechnologii w przemyśle farmaceutycznym.
Nowoczesna biotechnologia w medycynie.
Technologiczne zastosowanie procesów fermentacji w przemyśle spożywczym.
Biokatalityczne usprawnianie w produkcji żywności.
Preparaty enzymatyczne w różnych dziedzinach przemysłu.
Biotechnologia w przemyśle chemicznym.
Biotechnologia w rolnictwie.
Biotechnologia dla ochrony środowiska
Biokopalnictwo.
Liczba godzin
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
38
Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993.
Warunki zaliczenia
egzamin
Course code
BTC 4035w
Course title
Biotechnology
Course form
Lecture
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Exercises
4
Laboratory
Project
Seminar
Numbr of
points
6
exam
Prerequisites
Passed exam from Biology I, II, Microbiology
Course description
Practical application of biotransformation, using microorganisms or enzymes, selection and preparation of
microorganisms for biotechnological process. Biotechnology in various branches of industry
Lecture
Number of hours
39
Technical application of biocatalysis, biocatalysts.
Selection and modyfication of microorganisms, biomass production.
Storage of microorganisms. Methods of biomass production control.
Forms of biocatalysts and application methods.
Why enzymatic reactions? Myth and facts on technical use of enzymes.
Technical processes using one or more biocatalysed steps.
Biotechnology in pharmaceutical industry.
Modern biotechnology in medicine.
Technological use of fermentation process in food industry.
Biocatalytic rationalization in food production.
Enzyme preparations in various branches of industry.
Biotechnology in chemical industry.
Biotechnology in agriculture.
Biotechnology fo environment protection.
Biomining.
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
Basic literature
Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993
exam
40
BTC3006l
Biologia I
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Laboratorium
2
Projekt
Seminarium
Punkty
2
kolokwium
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs Biologia I.
Liczba godzin
Technika pracy z mikroskopem. Anatomia i morfologia komórki. Tkanki roślinne i zwierzęce. Podziały
komórkowe. Utlenianie biologiczne. Wpływ czynników środowiska na komórki. Chemiczne składniki komórki.
Enzymy, oznaczanie aktywności enzymatycznej w materiale biologicznym.
C. Ville „Biologia”
G. Brum “Biology exploring life”
Warunki zaliczenia
41
kolokwium
Course code
BTC 3006l
Course title
Biology I
Course form
Lecture
Exercises
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Laboratory
2
Project
Seminar
Number of
points
2
coloqium
Prerequisites
Course description
Lecture
Number of hours
Work with microscope. Cell anatomy and morphology. Plants and animal issues. Cell divisions. Biological
respiration. The influenze of environmental factors on cells. Chemical molecules of the cell. Enzymes. Assay of
enzymes activity in biological samples.
Basic literature
42
C. Ville “Biologia”
G. Brum “Biology exploring life”.
coloqium
43
BTC3008l
Mikrobiologia
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Laboratorium
2
Projekt
Seminarium
Punkty
2
kolokwium
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs Biologia I i II.
Liczba godzin
Praca w laboratorium mikrobiologicznym. Metody sterylizacji. Techniki posiewów. Oznaczanie liczby
komórek bakterii. Izolacja czystych kultur. Morfologia komórki bakteryjnej-barwienie. Wzrost bakterii.
Wymagania odżywcze mikroorganizmów. Oddychanie beztlenowe. Stosunki między drobnoustrojami.Wpływ
czynników fizycznych i chemicznych na drobnoustroje.
W.J.H. Kunicki-Goldfinger „Życie bakterii”
P.A. Ketchum „Microbiology”
Warunki zaliczenia
44
kolokwium
Course code
BTC 3008l
Course title
Microbiology
Course form
Lecture
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Exercises
Laboratory
2
Project
Seminar
Number of
points
2
coloqium
Prerequisites
Course description
Lecture
Number of hours
Principles of work in microbiological laboratory. Methods of sterilization. Techniques for growing cultures of
microorganisms. Isolation of pure cultures of microorganisms. Growth rates – bacterial growth curve.
Morphology of the bacterial cell – simple and differential staining. Nutrition requirements – bacterial growth.
Anaerobic respiration. Realationship between different bacterial species. The influenze of phisical and chemical
factors on microorganisms.
Basic literature
45
W.J.H. Kunicki-Goldfinger “Życie bakterii”
P.A. Ketchum “Microbiology”
coloqium
46
BTC4036l
Inżynieria genetyczna.
Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.
Grzegorz Rymarczyk, mgr inż., Agnieszka Rusek mgr inż., Elżbieta Wieczorek dr inż., Iwona Grad dr inż.,
doktoranci Zakładu Biochemii
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Laboratorium Projekt
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
3
Seminarium
Punkty
3
kolokwium
Wymagania wstępne
Biochemia I, Biochemia II, Biologia molekularna, Inżynieria genetyczna
Przygotowanie rekombinowanego genu i jego ekspresja w komórkach E.coli, jako przykład zastosowania
technik manipulacji DNA. Przygotowanie wektora ekspresyjnego pGEX-2T do klonowania w celu
przedstawienia postawowych technik laboratoryjnych inżynierii genetycznej.
Liczba godzin
1. Amplifikacja fragmentu genu metodą PCR. 2. Elektroforeza analityczna produktów reakcji PCR. 3. Izolacja
DNA insertu z żelu agarozowego. 4. Ligacja insertu z wektorem ekspresyjnym. 5. transformacja komórek E.coli
produktem ligacji. 6. selekcja docelowego klonu insertu. 7. Ekspresja sklonowanego genu w E.coli. 8.
Elektroforeza SDS-PAGE jako metoda detekcji docelowego peptydu. 9. Przygotowanie komórek
kompetentnych. 10. Transformacja komórek plazmidem testowym. 11. Przygotowanie markera wagowego
DNA. 12. trawieniewektora ekspresyjnego enzymem restrykcyjnym. 13. Defosforylacja DNA wektorowego. 14.
47
Elektroforeza preparatywna DNA wektorowego.
Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001
Warunki zaliczenia
Prawidłowe wykonanie doświadczenia. Nabycie umiejętności zaplanowania amplifikacji i ekspresji genu w
systemie bakteryjnym. Nabycie umiejętności zaplanowania i interpretacji eksperymentów manipulacji DNA.
Course code
BTC4036l
Course title
Genetic engineering.
Ożyhar Andrzej, dr hab., prof
Grzegorz Rymarczyk, M.Sc.., Agnieszka Rusek M.Sc.., Elżbieta Wieczorek PhD., Iwona Grad PhD., doctoral
students of the Division of Biochemistry
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Project
3
Seminar
Number of
points
3
test
Prerequisites
Biochemistry I, Biochemistry II, Molecular biology, Genetic engineering.
Course description
Preparation of a recombinant procaryotic expression vector as an example of basic DNA manipulation
techniques. Preparation of a cloned gene in a recombinant plasmid vector and its expression in E.coli host cells.
Lecture
Number of hours
48
1. Preparation of competent E.coli host cells. 2. transformation of competent cells with a test pasmid. 3. DNAladder preparation. 4. Restriction digestion of an expression vector. 5. Dephosphorylation of an expression
vector. 6. Preparative electrophoresis of vector DNA in agarose gel.. 7. Amplification of a desired gene fragment
using the PCR products. 8. Isolation of the insert DNA from an agarose gel. 9. Ligation of the insert into the
expression vector. 10. Transformation of E.coli cells with the ligation products. 11. selection of the desired
clone. 12. Expression of a cloned gene in E.coli host cells. 13. Detection of the target polypeptide using SDSPAGE analysis.
Basic literature
Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001
Students should perform the experiment correctly and acquire the ability to plan and interpret the results of basic
DNA manipulation techniques and plan the amplification and expression of a gene in a bacterial system.
49
OPIS KURSÓW/PRZEDMIOTÓW
BTC 4044w
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne
Imię nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Prof. dr hab. inż. Paweł Kafarski
Imiona i nazwiska oraz tytuły/ stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma
kolokwium
zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Wymagania wstępne
Chemia organiczna, mikrobiologia, biochemia
Zastosowanie mikroorganizmów, enzymów i katalitycznych przeciwciał w syntezie organicznej
Wykład ( podać z dokładnością do 2 godzin)
Liczba godzin
1
Definicje. Biotransformacje jako jeden ze sposobów unieczynniania
2
ksenobiotyków. Enzymy faz: pierwszej, drugiej i trzeciej biotransformacji.
2
Transformacje mikrobiologiczne jako narzędzie „Zielonej Chemii”. Dobór
2
mikroorganizmów, w tym kombinatoryjne projektowanie biokatalizatorów i
ukierunkowana ewolucja
3
Przykłady biokatalitycznych procesów utleniania-redukcji, manipulacja
2
stereoselektywnością reakcji
4
Reakcje hydroksylacji, transformacje mikrobiologiczne steroidów
2
5
Lipazy i mikroorganizmy lipolityczne, dobór biokatalizatorów, modelowanie
2
molekularne jako technika wspomagająca
6
Oksynitrylazy – od cyjanogenezy do syntezy asymetrycznej, procesy
2
chemoenzymatyczne
7
Biokatalityczna synteza epoksydów i dioli jako przykład transformacji
2
prowadzących do produktów z kilkoma centrami asymetrii
8
Glikotransferazy najpowszechniejszy przykład zastosowania transferaz
2
9
Biokataliza za pomocą immobilizowanych mikroorganizmów
2
10
Biokataliza w środowiskach niewodnych, micelarnych i w układach
2
dwufazowych
11
Biokataliza w mediach niekonwencjonalnych (gazy w stanie nadkrytycznym,
2
ciecze jonowe)
12
Transformacje enzymatyczne w przemysłach farmaceutycznym,
2
50
13
14
kosmetycznym i chemicznym
Katalityczne przeciwciała i „sztuczne enzymy” jako biokatalizatory
2
Ćwiczenia , seminarium – zawartość merytoryczna
Laboratorium, projekt – zawartość merytoryczna
P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995
Literatura dodatkowa
K. Drauz & H. Waldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002
Warunki zaliczenia
Egzamin wspólny z egzaminem z biotechnologii (w postaci dodatkowych pytań)
Course code
BTC 4044w
Course title
Biotechnology – microbial transformations
Names, first name and degree of the lecturer/supervisor
Prof. Paweł Kafarski
Form in witch the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Numbers of
hours/week
2
Form of the
test
course
completion
Laboratory
Project
Seminar
51
Prerequisites
Organic chemistry, microbiology, biochemistry
Course description
The use of microorganisms, enzymes and catalytic antibodies in organic synthesis
Lecture
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Definitions. Biotransformations as a mean of degradation of xenobiotics. Enzymes
of first, second and third phase of biotransformation
Microbial transformations as a tool of “Green Chemistry”. The choice of
microorganisms including combinatorial design and directed evolution
Examples of biocatalytic red-ox processes, manipulations with stereoselectivity of
reaction
Hydroxylations, microbial transformations of steroids
Lipases and lypolitic microorganisms, choice of biocatalysts, molecular modelling
as helper technique
Oxynitrilases – from cyanogenesis to asymmetric synthesis, chemoenzymatic
processes
Biocatalytic synthesis of epoxides and diols as an example of transformations
leading to products with multiple asymmetric centers
Glycotransferases, the most popular example of transferases
Biocatalysis by means of immobilized microorganisms
Biocatalysis in non-aqueous, micellar and biphasic media
Biocatalysis in non-conventional media (supercritical gases, ionic liquids)
Enzymatic transformations in pharmaceutical, cosmetic and chemical industry
Catalytic antibodies and artificial enzymes as biocatalysts
Number
of hours
2
2
2
Exercises, seminar –the contents
Laboratory, project –the contents
Basic literature
P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995
K. Drauz & H. WAldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002
Conditions of the course acceptance/credition
Exam written alongside with biotechnology test
52
BTC 4044w
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne
Wanda Peczyńska – Czoch, dr hab.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma
zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
2
Liczba
punktów
3
kolokwium
Wymagania wstępne
Chemia organiczna, biochemia, mikrobiologia
Zastosowanie drobnoustrojów i izolowanych z nich enzymów do prowadzenia reakcji biotransformacji
związków organicznych
1. Metody prowadzenia reakcji transformacji mikrobiologicznych (biotransformacji)
2. Zasady doboru drobnoustrojów
3. Udział oksydoreduktaz w reakcjach biokonwersji
4. Reakcje biokonwersji katalizowane przez transferazy
5. Procesy hydrolityczne
6. Transformacje mikrobiologiczne w przemyśle farmaceutycznym
7. Kontrolowane procesy biodegradacyjne
Liczba godzin
2
2
6
2
8
6
4
53
Warunki zaliczenia
Course code
BTC 4044w
Course title
Biotechnology – microbial transformations
Wanda Peczyńska – Czoch , dr hab.
Course structure
Course form
Number of hours
/week
Form of the
course completion
Lecture
Classes
Laboratory
2
Project
Seminar
Number of
credits
3
test
Prerequisites
Organic chemistry, biochemistry, microbiology
Course description
Application of whole microbial cells and isolated enzymes to biotransformation of organic compounds
Lecture
1.Methods of microbial transformations (biotransformations)
2. Selection of microrganisms
3.Oxidoreductases in bioconversion reactions
4.Transferases in bioconversion processes
5.Hydrolytic processes
6.Microbial transformations in pharmaceutical industry
7.Controlled biodegradative processes
Number of hours
54
Core literature
55
BTC4037w,l
Mikrobiologia przemysłowa
Magdalena Rucka, dr
Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr inż.
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
2
egzamin
Laboratorium
Projekt
Seminarium
2
Punkty
3+2
sprawozdania
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs: Mikrobiologia ogólna
Kurs ma wprowadzić słuchaczy w zagadnienia związane z przemysłowymi metodami fermentacyjnymi.
Poruszane będą problemy przygotowywania podłóż, kultur starterowych, izolacji i ulepszania szczepów.
Omawiane będą typy hodowli, możliwości sterowania metabolizmem drobnoustrojów oraz wykorzystanie
komórek immobilizowanych.
Liczba godzin
1.Mikroorganizmy o znaczeniu przemysłowym
2
2.Selekcja mikroorganizmów, dobór kryteriów
2
3.Selekcja mutantów indukowanych syntezujących metabolity pierwotne, wtórne, enzymy o
znaczeniu przemysłowym.
2
2
4.Ulepszanie mikroorganizmów – metody
2
5.Przygotowanie kultur starterowych dla potrzeb przemysłowych
2
6.Metody przechowywania szczepów produkcyjnych
7.Podłoża przemysłowe
2
8.Typy hodowli drobnoustrojów, wykorzystanie przemysłowe, zalety i wady
4
9.Sterowanie metabolizmem. Indukcja, metody obejścia sprzężenia zwrotnego
2
56
10.Fermentacja beztlenowa – wykorzystanie przemysłowe
2
11.Biosynteza związków biologicznie czynnych, szlaki metaboliczne, przykłady
12.Hodowla mikroorganizmów zrekombinowanych
2
13. Nośniki i metody unieruchamiania komórek mikroorganizmów
2
14. Przykłady zastosowań przemysłowych komórek unieruchomionych
2
2
Izolacja drobnoustrojów o pożądanych właściwościach.
Przechowywanie i zabezpieczanie szczepów.
Typy hodowli.
Produkcja substancji biologicznie czynnych.
Ulepszanie szczepów
Immobilizacja komórek.
P. Stanbury , A.Whiteker :Principles of Fermentation Technology, Pergamon Press
Z.Libudzisz, K. Kowal: Mikrobiologia Techniczna, Politechnika Łódzka,2000
Warunki zaliczenia
Zdanie pozytywnie egzaminu
Course code
BTC4037w
Course title
Industrial Microbiology
Magdalena Rucka, dr
57
Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr eng.,
Course form
Lecture
Number of hours /
week
Form of the course
completion
Exercises
Laboratory
2
Exam
Project
Seminar
2
Number of
points
3+2
reports
Prerequisites
Microbiology
Course description
The course shall introduce listeners to industrial fermentation processes, isolation, preservation and
improvement of industrial important microorganisms. The development of inocula, types of cultures, control of
microbial metabolism are also discussed.
Lecture
Number of hours
1. Microorganisms of industrial importance
2
2. Selection of microorganisms, criteria
2
3. Selection of induced mutants synthesizing primary, secondary metabolites and enzymes of
industrial importance
2
2
4. Improvement of industrially important microorganisms
2
5. Development of inocula for industrial purposes
2
6. Preservation of microorganisms
7. Media for industrial fermentation
2
8, Types of cultures, industrial application
4
9. Metabolism control
2
10.Anaerobic fermentation – industrial application
2
11.Biosynthesis of biologically active compounds
2
12.Culture of recombinant microorganisms
2
13.Carriers and methods of cell immobilization
2
14.Industrial application of immobilized cells
2
Selection of microorganisms of desired characteristics
Preservation of microorganisms
58
Types of culture
Production of biologically active substances
Improvement of strains
Immobilization of cells
Basic literature
Exam
59
OPISY KURSU/ PRZEDMIOTU
BTC3011w
Biofizyka
Marek Langner dr hab.
Forma kursu
Tygodniowa liczba godzin
Forma zaliczenia
Wykład
ćwiczenia
laboratorium
Projekt
seminarium
Punkty
2
Egzamin
3
Wymagania wstępne
Fizyka, analiza matematyczna, chemia fizyczna, biochemia
Celem wykładu jest przedstawienie metodologii i przedmiotu biofizyki. Prezentowany materiał został dobrany w
taki sposób aby student zapoznał się z kompleksowym podejściem do nauk biologicznych. Omawiane
zagadnienia łączą w sobie szereg dyscyplin naukowych, w tym fizykę, biochemię, biologię, chemii fizyczną
wraz z wybranymi zastosowaniami formalizmu matematycznego. Tematem wiodącym wykładu jest transmisja
sygnału nerwowego. Przykład ten pozwala przedstawić złożoność zjawisk na różnych poziomach organizacji
materii. Poczynając od oddziaływań na poziomie molekularnym, poprzez formowanie się struktur
supramolekularnych a kończąc na funkcjonowaniu organelli oraz całych komórek. W trakcie prezentowania tych
zagadnień omawiane są wybrane zagadnienia z termodynamiki, transportu masy, bioenergetyki oraz ich
znaczenie dla funkcjonowania komórki. Po wysłuchaniu wykładu student powinien posiadać zarówno wiedzę
szczegółową z zakresu prezentowanych zagadnień oraz ogólne rozeznanie w metodologii współczesnych nauk
biologicznych.
Wykład
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
Wprowadzenie – poziomy organizacji materii ożywionej – skale czasowe, energetyczne i
przestrzenne.
Przedmiot i podstawowe pojęcia termodynamiki.
Energia swobodna – stany konformacyjne makromolekuł, enzym oraz znaczenie energii
swobodnej w procesach metabolicznych.
Reakcje sprzężone oraz znaczenie nośników energii.
Woda – właściwości, napięcie powierzchniowe, wiązanie wodorowe i efekt hydrofobowy.
Elektrostatyka w układach wielofazowych.
Oddziaływania van der Waalsa – teoria oraz znaczenie w układach biologicznych.
Stałe wiązania oraz adsorpcja na granicy faz.
Budowa błony biologicznej oraz transport bierny.
Transport ułatwiony.
Elektrostatyka błon biologicznych – potencjał błonowy, potencjał powierzchniowy i dipolowy.
Transport aktywny oraz wybrane przykłady kanałów jonowych.
Transport sprzężony – symport, antyport oraz pojęcie pompy głównej.
Impuls nerwowy – potencjał spoczynkowy, aktywacja oraz transmisja sygnału nerwowego.
Transformacja energii w układach biologicznych na przykładzie F0F1-ATPazy.
L.godz.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
60
2
2
2
Literatura podstawowa i dodatkowa
Klasyczne podręczniki z biochemii i chemii fizycznej. Artykuły naukowe i wybrane strony internetowe.
Materiały znajdujące się na stronie internetowej wykładu.
Warunki zaliczenia
Egzamin
Course code
BTC3011w
Course title
Biophysics
dr hab. Marek Langner
Course form
Number of hours / week
Form of the course completion
Lecture
Number of points
2
Exam
3
Prerequisites
Physics, biochemistry, physical chemistry, calculus.
Course description
The main aim of the lecture is to present the subject and methodology of biophysics. Presented material was
selected in such a way that student can acquire knowledge on the modern approaches to biological sciences.
Discussed problems are designed to show the synthesis of various sciences, including physics, biochemistry,
biology, physical chemistry along with selected application of mathematical formalisms. Leading theme of the
lecture is the transmission of nervous signal. This example allows to present the complexity of biological
processes occurring simultaneously on various organizational levels. Ranging from interactions between
molecules and macromolecules and supramolecular aggregates formation to the functioning of organelles and
whole cells. In the course of this presentation selected topic on thermodynamics, mass transport, bioenergetics as
well as their role for cell functioning are discuss. After completion of the lecture student should acquire the detail
knowledge on presented subject and general overview of methodology employed in studies on biological
material.
Lectures
1. Introduction – the organization of biological material – time, distance and energy scale.
2. Basic concepts of thermodynamics
3. Free energy – conformational states of macromolecules, enzymes and meaning of free energy
No. of hours
2
2
61
in metabolic processes.
4. Coupled reactions and the role of energy caring molecules.
5. Water – properties, surface tension, hydrogen bonds and hydrophobic effect.
6. Electrostatics in multiphase systems.
7. van der Waals interactions – theory and their role in biological systems.
8. Biding constant and adsorption on interfaces.
9. Structure of the biological membranes and passive transport.
10. Mediated transport.
11. Electrostatics of membranes – membrane, surface and dipole potentials.
12. Active transport and selected examples of ionic channels.
13. Coupled transport – symport, antiport and the concept of master pump.
14. Nerve signal – resting potential, activation and propagation of neuronal impulse.
15. Energy conversion in biological systems - F0F1-ATPze example.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Core and additional literature
Textbooks in Biochemistry and Physical Chemistry, scientific articles and selected web seats. Materials from the
lecture web-sit.
Exam
62
BTC4033l
Enzymologia
Piotr Dobryszycki, adiunkt/dr inż.
Elżbieta Wieczorek, adiunkt/dr inż., Rusek Agnieszka, asystent/mgr inż., doktoranci Zakładu Biochemii I-4
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Laboratorium
3
Projekt
Seminarium
Punkty
3
cząstkowe
kolokwia
Wymagania wstępne
Rozpoczęcie kursu Biochemii I
Kurs obejmuje naukę metod otrzymywania, oczyszczania i wstępnego opisu enzymów. Studenci poznają m.in.
spektrofotometryczne metody wyznaczania stężenia enzymów, różne sposoby wyrażania aktywności
enzymatycznej, oznaczanie N-końcowego aminokwasu, badanie stabilności białek w oparciu o krzywe
denaturacyjne. Ponadto poznają wykorzystanie widm różnicowych i spektroskopii fluorescencyjnej w badaniach
enzymów.
Kurs obejmuje: 1. Oznaczanie aktywności enzymatycznej króliczej aldolazy mięśniowej – aktywność
specyficzna, aktywność aldolazowa, aktywność całkowita. 2. Preparacja aldolazy z mięśni królika. 3.
Krystalizacja aldolazy, określenie wydajności preparacji 4. Trawienie aldolazy karboksypeptydazą A. 5.
Dansylowanie peptydu. 6. Chromatograficzne oznaczanie N-końcowej reszty peptydu. 7. Oznaczanie
fosforanów – metodą Amesa, Dubina. 8. Wyznaczanie stabilności enzymów w oparciu o zmiany przebiegu
krzywych denaturacyjnych 9. Wyznaczanie wydajności kwantowej fluoroforów – zastosowania spektroskopii
fluorescencyjnej w biochemii. 10. Metoda Bradford oznaczania białek,
63
1.
Instrukcje do ćwiczeń.
2.
Oryginalne publikacje (dostarczone wraz z instrukcjami)
Podręcznik L. Stryera „Biochemia”
Warunki zaliczenia
Zaliczenie wszystkich kolokwiów cząstkowych i wszystkich sprawozdań z poszczególnych ćwiczeń.
Course code
BTC4033l
Course title
Enzymology
Piotr Dobryszycki, adjunct/dr
Elżbieta Wieczorek, adjunct/dr., Rusek Agnieszka, assistent/MS, PhD students of the Dept. of Biochemistry
Institute of Organic Chemistry Biochemistry and Biotechnology
Course form
Lecture
Exercises
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Laboratory
3
Project
Seminar
Number of
points
3
colloquia
Prerequisites
Beginning of the Biochemistry I course
Course description
Course consists of the methods of isolation, purification and indroductory description of the enzymes such as
spectrophotometric methods of the determination of enzyme concentration, different ways of enzymatic activity
presentation, determination of peptide N-terminal residue, protein digestion, obtaining of difference spectra and
their application in the investigation of the enzyme stability, obtaining of the unfolding curves and their analysis
and the biochemical applications of the fluorescence spectroscopy.
64
Course consists of: 1. Determination of the enzymatic activity of rabbit muscle aldolase. – specific activity,
aldolase activity, total activity. 2. Preparation of aldolase from rabbit muscle. 3. Aldolase crystallization,
calculation of the preparation yield. 4. Aldolase digestion with carboxypeptidase A 5. Peptide N-terminus
labeling with dansyl chloride. 6. Chromatographic identification of N-terminal residue. 7. Method of Ames and
Dubin – organic phosphor determination. 8. Determination of protein stability basing on the changes of
denaturation curves. 9. Determination of protein fluorophores quantum yield – biochemical applications of
fluorescence spectroscopy. 10. Bradford method – determination of protein concentration.
Basic literature
1.
The inctructions to excercises.
2.
Original papers .
L. Stryer „Biochemistry” textbook.
Passing all the colloquia and preparation of all the excercises’ reports.
65
BLC5005w
Biologia molekularna
Forma kursu
Tygodniowa
liczba godzin
Wykład
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
5
Forma zaliczenia
Wymagania wstępne
Zaliczenie kursu Biochemii
Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.
1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.
Liczba godzin
2
2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.
2
3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.
2
4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.
2
5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.
2
6.
2
Mechanizmy naprawy DNA.
7. Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i
eukariontów.
2
8.
Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.
2
9.
Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.
2
66
2
10. Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.
2
11. Kontrola ekspresji genów u prokariontów.
2
12. Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.
2
13. Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.
2
14. Terapia genowa.
2
Ćwiczenia, seminarium - zawartość tematyczna2
Stryer „Biochemia”, PWN 2002
Bruce Alberts, Dennis Bray, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, James D. Watson "Molecular Biology of
the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002
Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002
Warunki zaliczenia
Egzamin
Course code
BLC5005w
Course title
Molecular biology
Andrzej Ożyhar dr hab., prof.
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Punkty
67
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
3
5
examination
Prerequisites
Course description
Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.
Lecture
1. DNA and RNA – chemical composition and structure
2.
Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.
3.
DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.
4.
Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.
5.
DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.
Number of hours
2
2
2
2
2
2
6.
Mechanisms of DNA repair.
7.
Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.
8.
Prokaryotic DNA replication.
2
9.
Eukaryotic DNA replication.
2
2
10. Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.
2
11. Control of prokaryotic gene expression.
2
12. Control of gene expression in eukaryotic cells
13. Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational
modifications.
2
2
14. Gene therapy.
aboratory, project – the contents
68
Basic literature
Passing an examination.
69
BLC5005s
Biologia molekularna
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Tygodniowa
liczba godzin
Seminarium
Punkty
2
2
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Kurs towarzyszący Biologii Molekularnej (BLC5005w)
Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.
Liczba godzin
1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.
2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.
3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.
4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.
5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.
15. Mechanizmy naprawy DNA.
16. Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i
eukariontów.
70
17. Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.
18. Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.
19. Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.
20. Kontrola ekspresji genów u prokariontów.
21. Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.
22. Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.
23. Terapia genowa.
Warunki zaliczenia
kolokwium zaliczeniowe
Course code
BLC5005s
Course title
Molecular biology
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
71
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
2
2
colloqium
Prerequisites
Course description
Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.
Lecture
Number of hours
1. DNA and RNA – chemical composition and structure
15. Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.
16. DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.
17. Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.
18. DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.
19. Mechanisms of DNA repair.
20. Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.
21. Prokaryotic DNA replication.
22. Eukaryotic DNA replication.
23. Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.
24. Control of prokaryotic gene expression.
25. Control of gene expression in eukaryotic cells
26. Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational modifications.
27. Gene therapy.
Basic literature
Stryer „Biochemistry”, W.H. Freeman ed. , 1997
72
Colloqium
73
BTC3009w
Biochemia I
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
2
3
kolokwium
Wymagania wstępne
Kurs podstaw biochemii obejmujący zagadnienia związane z budową i funkcją białek i kwasów nukleinowych,
podstawy enzymologii, metabolizm, funkcjonowanie błon biologicznych, przekazywanie sygnałów
biologicznych, podstawowe pojęcia immunologii.
Liczba godzin
1.Struktura i funkcja białek.
2
2. Poznawanie białek.
2
3.DNA i RNA : cząsteczki dziedziczności.
2
4.Hemoglobina: przykład białka allosterycznego.
2
5.Enzymy: podstawowe pojęcia i kinetyka.
2
6.Strategie katalityczne.
2
7.Strategie regulacyjne.
2
8.Budowa i dynamika błony.
2
.9.Kanały i pompy błonowe
2
10.Przeciwciała i receptory limfocytów T.
2
11.Motory molekularne.
2
74
12.Fałdowanie się i projektowanie białek.
2
13.Metabolizm: podstawowe pojęcia i organizacja.
2
14.Węglowodany.
2
Warunki zaliczenia
Egzamin testowy łącznie z Biochemia II
Course code
BTC3009w
Course title
Biochemistry I
Piotr Dobryszycki dr
Course form
Number of hours
/ week
Lecture
Exercises
2
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
Form of the
course
completion
75
Prerequisites
Course description
Course of the basics of biochemistry. Course consists of the problems of protein and nucleic acids structure and
function, enzymology, intoduction to metabolism, biological membranes, biological signals transduction, basics
of immunology.
Lecture
Number of hours
1.Protein structure and function.
2
2. Exploring proteins.
2
3.DNA and RNA : molecules of heredity.
2
4.Hemoglobin : example of allosteric protein.
2
5.Enzymes: basic concepts and kinetics.
2
6.Catalytic strategies.
2
7.Regulatory strategies.
2
8.Membranes structure and dynamics.
2
.9.Membrane channels and pumps.
2
10.Antibodies and lymphocyte T receptors.
2
11.Molecular motors.
2
12.Protein folding and design.
2
13.Metabolism: basic concepts and organization.
2
14.Carbohydrates.
2
Basic literature
Test examination with Biochemistry II
76
BTC4030w
Genetyka
Forma kursu
Wykład
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma zaliczenia
Ćwiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
3
Egzamin
Wymagania wstępne
Kurs podstaw genetyki z odniesieniami do problemów medycznych. Opis genów i ich funkcji, analiza genomu,
regulacja ekspresji genów, genetyka populacyjna,
Liczba godzin
3
1.
Genetyka Mendlowska.
2.
Dziedziczenie cech sprzężonych i uwarunkowanych przez płeć.
3
3.
Dziedziczenie cytoplazmatyczne.
3
4.
Źródła zmienności genetycznej.
5.
Mapowanie genów.
6.
Analiza genomów.
7.
Choroby metaboliczne o podłożu genetycznym.
3
8.
Genetyka nowotworów.
3
9.
Genetyka populacyjna.
3
3
3
10. Genetyka rozwoju.
77
Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002
Korf B.R. “ Genetyka człowieka” PWN 2003
Warunki zaliczenia
Course code
BTC4030w
Course title
Genetics
Course form
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Lecture
Exercises
2
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
3
Examination
Prerequisites
78
Course description
Course of genetics principles with medical problems approach. Description of the genes, their function, genome
analysis, gene expression regulation, genetics of population.
Lecture
Number of hours
1.
Mendelian genetics.
2.
Sex-linked genetic transmission.
3.
Cytoplasmatic inheritance.
4.
Origins of genetic changes.
3
5.
Gene mapping.
3
6.
Genom analysis.
3
7.
Inborn errors of metabolism.
8.
Genetics of cancer.
9.
Population genetics.
3
10. Developmental genetics.
3
3
3
3
Basic literature
Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002
Korf B.R. “ Human Genetics. A Problem Based Approach”
Examination
79
BTC3009l
Biochemia I
Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doktoranci Zakładu Biochemii i Laboratorium
Biochemii Medycznej P.Wr.
Forma kursu
Wykład
Ćwiczenia
Tygodniowa
liczba godzin
Forma zaliczenia
Laboratorium
4
Projekt
Seminarium
Punkty
4
kolokwium
Wymagania wstępne
Kurs równoległy z wykładem Biochemia I
Kurs podstawowych metod biochemii białek i kwasów nukleinowych.
Liczba godzin
Instrukcje do ćwiczeń
80
Warunki zaliczenia
Kolokwium
Course code
BTC3009l
Course title
Biochemistry I
Piotr Dobryszycki dr
Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doctoral students of the Division of Biochemistry and
Laboratory of Medical Biochemistry Inst. Of Org. Chem., Biochemistry and Biotechnology.
Course form
Lecture
Exercises
Number of hours
/ week
Form of the
course
completion
Laboratory
Project
4
Seminar
Number of
points
4
colloqium
Prerequisites
Course parallel to Biochemistry I - lecture
Course description
Course of the basic methods of biochemistry of proteins and nucleic acids.
Lecture
Number of hours
81
Excersises : 1. Enzymatic kinetics, 2. Protein’s thiol groups and disulphide bridges. 3. Effect of temperature and
pH on enzymatic activity. 4. Gel filtration. 5. Enzymatic hydrolysis. 6. Amphoteric character of amino acids and
proteins. 7.DNA isolation from calf thymus. 8.Analysis of DNA melting curve. 9. Analysis of mechanismis of
the enzymatic reaction. 10. Protein electrophoresis.
Basic literature
Instructions for excercises.
test
82

opisy kursów/ przedmiotów

Transkrypt

Podobne dokumenty

ETD 2003 Wprowadzenie do elektroniki i telekomunikacji 2

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:

ETD 1061

ETD 2909 Szecowka

Podstawy organizacji i zarządzania w administracji publicznej

Issues of contemporary art dr Roman Nieczyporowski

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:

Changes in Central Europe and Poland in the 20th c.