sylabus - Samodzielna Katedra Biotechnologii i Biologii Molekularnej

Kod ECTS: 6.15-BM- 09
Nazwa przedmiotu
BIOLOGIA MOLEKULARNA
Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot
Wydział Nauk Przyrodniczych, Samodzielna Katedra Biotechnologii i Biologii Molekularnej
Studia
kierunek
Biotechnologia
stopień
I (studia inżynierskie)
tryb
stacjonarne
specjalność
specjalizacja
Nazwisko osoby prowadzącej (osób prowadzących)
dr hab. Anna Krop-Watorek, prof. U.O., dr Ewa Boniewska-Bernacka
Formy zajęć, sposób ich realizacji i przypisana im liczba godzin
A. Formy zajęć
•
•
Godziny kontaktowe
udział w wykładach: 15 × 1h = 15 h
udział w zajęciach laboratoryjnych:
30 × 1 h = 30 h
konsultacje: 5 × 1 h = 5 h
Razem: 50 h = 2 p. ECTS
wykład (W)
ćwiczenia laboratoryjne (L)
B. Sposób realizacji
•
zajęcia w sali dydaktycznej
Praca własna studenta
przygotowanie do ćw. laboratoryjnych: 15 × 1 h = 15 h
przygotowanie sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych
15 × 1 h = 15 h
przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie:
15 x 1 h = 15 h
Razem 45 h = 2 p. ECTS
C. Liczba godzin
•
•
Liczba punktów ECTS 4
wykład 15 godzin
ćwiczenia laboratoryjne 30 godzin
W (2 p. ECTS) + L (2 p. ECTS) = 4p. ECTS
Status przedmiotu
•
polski
obowiązkowy
Metody dydaktyczne
•
•
Język wykładowy
wykład z prezentacją multimedialną
laboratorium: ćwiczenia laboratoryjne,
dyskusja, pokaz
Forma i sposób zaliczenia oraz podstawowe kryteria oceny lub
wymagania egzaminacyjne
A. Sposób zaliczenia
•
•
egzamin pisemny (W)
zaliczenie z oceną (L)
B. Formy zaliczenia
•
•
W - egzamin pisemny z pytaniami otwartymi i pytaniami
testowymi
L - ocena zaliczeniowa na podstawie ocen cząstkowych
otrzymywanych w trakcie trwania semestru ze sprawdzianów,
aktywności na zajęciach i sprawozdań
C. Podstawowe kryteria
W: do zdania egzaminu wymagane jest udzielenie poprawnych
odpowiedzi na pytania obejmujące 60% materiału
L: ustalenie oceny zaliczeniowej na podstawie ocen cząstkowych,
aktywności na zajęciach i poprawności sprawozdań
Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymogami wstępnymi
A. Wymagania formalne: zaliczone kursy z biologii komórki, i genetyki
B. Wymagania wstępne: dobra orientacja w zagadnieniach z Biologii Komórki, biegła znajomość budowy białek i kwasów
nukleinowych, umiejętność czytania ze zrozumieniem instrukcji do ćwiczeń i obsługi sprzętu laboratoryjnego; zdolność
indywidualnego doboru właściwych źródeł uzupełniających (podręczników, materiałów internetowych); przestrzeganie
zasad BHP
Cele przedmiotu
Zapoznanie studenta z budowa genu i regulacją ekspresji genów, sekwencją wydarzeń i uwarunkowaniami dogmatu biologii
molekularnej (replikacja, mutacja i naprawa DNA; transkrypcja, powstawanie, dojrzewanie i transport mRNA; translacja).
Zapoznanie studentów z metodyką badań materiału genetycznego (klonowanie i sekwencjonowanie DNA, biblioteki genomowe
i cDNA, metoda PCR i jej praktyczne wykorzystanie, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, hybrydyzacja in situ).
Zdobycie praktycznych umiejętności izolacji materiału genetycznego z komórek prokariotycznych i eukariotycznych (metody
izolacji genomowego i plazmidowego DNA, RNA, elektroforeza kwasów nukleinowych).
Treści programowe
A. Problematyka wykładu: obejmuje - wprowadzenie podstawowych pojęć stosowanych w biologii molekularnej; odkrycia
w poszukiwaniu czynnika genetycznego, DNA i rodzaje RNA; zmiany w strukturze chromatyny, modyfikacje chemiczne
histonów w powiązaniu z aktywnością genu. Chromosomy, telomery i telomeraza, aberacje strukturalne chromosomów,
hybrydyzacja in situ, chromosom Philadelphia. Replikacja i jej mechanizm u pro- i eukariota, mechanizm działania polimeraza
DNA, PCR. Rekombinacja homologiczna, naprawa uszkodzonego DNA, progeria.
Choroby wywołane dziedziczeniem zmiennej wielkości segmentów DNA i aberracjami liczbowymi chromosomów.
Transkrypcja, potranskrypcyjna obróbka premRNA, negatywna i pozytywna regulacja transkrypcji, represory i induktory,
rodzaje i działanie czynników transkrypcyjnych, białka regulatorowe. Interferencyjny RNA (iRNA), wyciszenie genów,
translacja i degradacja białek, klonowanie i inżynieria genetyczna, organizmy transgeniczne.
B. Problematyka laboratorium: Izolacja DNA i RNA z komórek bakteryjnych metodą mikrokolumnową. Wykrywanie (1)
mutacji w genie CCR5 Homo sapiens i (2) obecności Salmonella sp. w produktach spożywczych metodą PCR. Transformacja
komórek E. coli wektorem plazmidowym pUC9 i komórek Saccharomyces cerevisiae wektorem wahadłowym pFL44L. Analiza
wyników transformacji. Degradacja DNA
Wykaz literatury
Efekty kształcenia
A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć (zdania egzaminu):
A.1. wykorzystywana podczas zajęć
Węgleński P. Genetyka molekularna, PWN, 2008
Berg JM., Tymoczko JL., Stryer L., Biochemia, PWN, 2009
A.2. studiowana samodzielnie przez studenta
Allison LA., Podstawy biologii molekularnej, Wydawnictwo uniwersytetu warszawskiego, 2007
Brown TA., Genomy, PWN, 2001
Augustyniak J. i Michejda J., Biologia molekularna, PWN, 1999
Bates AD., McLennan AG., Turner PC., White MRH., Biologia Molekularna, Krótkie wykłady, PWN, 2009
King RC, Stansfield WD, Słownik terminów genetycznych, Ośrodek Wydawnictw Naukowych, PAN, Poznań, 2002
B. Literatura uzupełniająca
Garrett RH., Grisham CM., Biochemistry, 2005
Alberts B., Johnson A., Lewis J.,. Raff M., Roberts K., Walter P., Molecular Biology of the Cell,
4th ed, Garland Publishing, 2002
Wiedza
W1 Charakteryzuje podstawowe zjawiska i procesy biologii molekularnej
W2 Opisuje przebieg i zależności dogmatu biologii molekularnej
W3 Opisuje mechanizmy molekularne replikacji, transkrypcji i translacji, przepływu informacji genetycznej i regulacji
ekspresji genów
W4 Opisuje reguły dziedziczenia posługując się opisem molekularnym i genetycznym oraz uwarunkowania
różnorodności biologicznej
W5 Wymienia podstawowe zasady stosowania technik inżynierii genetycznej i komórkowej oraz biotechnologii,
możliwości ich wykorzystania w praktyce, jak również obwarowania bioetyczne
W6 Posługuje się podstawową terminologią naukową w języku polskim i angielskim z zakresu biologii molekularnej i
dziedzin pokrewnych
Umiejętności
U1 Samodzielnie prowadzi doświadczenia związane z izolacją, oczyszczaniem i charakterystyką materiału
genetycznego pod kierunkiem opiekuna
U2 Potrafi uczyć się samodzielnie
U3 Czyta ze zrozumieniem naukowe teksty z dziedziny biologii molekularnej i biotechnologiii w języku angielskim
oraz komunikuje się w tym języku na poziomie B2
U4 Samodzielnie wyszukuje i korzysta z dostępnych źródeł informacji naukowych, w tym elektronicznych
U5 Opracowuje wyniki badań eksperymentalnych, szacuje błędy i niepewność pomiarów
Kompetencje społeczne (postawy)
K1 Rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie oraz podnoszenia kompetencji zawodowych i osobistych
K2 Postępuje zgodnie z zasadami bioetyki
K3 Myśli i działa w sposób przedsiębiorczy wykorzystując wiedzę biologiczną i biotechnologiczną
K4 Reaguje prawidłowo w sytuacji zagrożenia
Kontakt
dr hab. Anna Krop-Watorek
e-mail: [email protected]
tel:
695519468
dr Ewa Boniewska-Bernacka
e-mail: [email protected]
tel:
77 401 60 47