STUDIA II STOPNIA
Transkrypt
STUDIA II STOPNIA
STUDIA II STOPNIA (2-letnie magisterskie) Maksymalna liczba studentów mogących wykonywać prace magisterskie – 8 osób Tematyka prac magisterskich wykonywanych w ZSO Tematyka badawcza realizowana w Zakładzie Syntezy Organicznej obejmuje dwa główne nurty. Pierwszy z nich poświęcony jest projektowaniu, chemicznej syntezie i określeniu właściwości farmakologicznych nowych analogów bradykininy (BK) oraz neurohormonów (argininowej wazopresyny (AVP) i oksytocyny (OT)). Badania te mają na celu poszukiwania aktywnych i selektywnych agonów i antagonów tych hormonów mogących znaleźć potencjalne zastosowanie w leczeniu chorób spowodowanych ich nieprawidłowa regulacją. Badaniom tym towarzyszą prace ukierunkowane na chemiczną syntezę modyfikowanych reszt aminokwasowych (reszty N-alkilowanych aminokwasów, fragmenty cykliczne, peptydomimetyki), wykorzystywanych do otrzymywania zaprojektowanych analogów. Drugi główny nurt badań poświecony jest analizie konformacyjnej otrzymanych wcześniej, aktywnych biologicznie peptydów przy użyciu Magnetycznego Rezonansu Jądrowego (2D NMR), Spektroskopii Ramana (RS) i obliczeń teoretycznych. Badania te prowadzone są w celu umożliwienia przewidywania aktywności biologicznej analogów i wstępnej selekcji zaprojektowanych peptydów (przed przystąpieniem do ich chemicznej syntezy i określenia właściwości farmakologicznych). Osoby zainteresowane wykonywaniem prac magisterskich w KSO proszone są o bezpośredni kontakt z osobami prowadzącymi badania. dr Izabela Derdowska dr inż. Emilia Sikorska dr hab. Adam Prahl dr Dariusz Sobolewski pok. 137 pok. 407 pok. 350 pok. 220/1 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 0-58 523 54 18 0-58 523 54 22 0-58 523 54 28 0-58 523 53 16 BLOK ZAJĘĆ ZWIĄZANYCH Z REALIZACJĄ PRACY MAGISTERSKIEJ Wykład specjalizacyjny (30 godzin) - 2 semestr Właściwości fizykochemiczne aminokwasów i ich pochodnych – dr Jarosław Ruczyński Pracownia specjalizacyjna (120 godzin) - 2 semestr Prowadzący - pracownicy Zakładu Syntezy Organicznej Wykład monograficzny w ZSO (2 x 30 godzin)* - 3 i 4 semestr Metody syntezy oraz właściwości biochemiczne protein i glikoprotein I - dr hab. Adam Prahl, prof. nadzwyczajny UG Opis wykładu: Białkowe i niebiałkowe aminokwasy – ich nazewnictwo, klasyfikacja oraz właściwości fizykochemiczne (rozpuszczalność, temperatura topnienia, właściwości kwasowo-zasadowe, właściwości spektroskopowe). Osłony grup funkcyjnych oraz grup łańcuchów bocznych (metody wprowadzania i usuwania, ortogonalność osłon). Metody tworzenia wiązania peptydowego - odczynniki stosowane do sprzęgania reszt aminokwasowych. Taktyka i strategia syntezy peptydów. Planowanie syntezy peptydów – zastosowanie automatyzacji i nowinek technicznych. Synteza peptydów w roztworze i na nośniku stałym. Problemy związane z syntezą peptydów (reakcje uboczne, racemizacja) i metody ich zapobiegania. Syntezy nietypowych aminokwasów, fragmentów imitujących wiązanie peptydowe oraz wprowadzanie do cząsteczek peptydów fragmentów ograniczających swobodę konformacyjną. Przegląd i omówienie właściwości biochemicznych wybranych polipeptydów naturalnych. Umiejętności i kompetencje: nabycie umiejętności projektowania i przeprowadzania chemicznej syntezy peptydów w roztworze oraz na nośniku stałym; rozwiązywanie problemów pojawiających się w czasie syntezy. Wybrane zagadnienia z chemii cukrów, dr hab. Janusz Madaj, prof. nadzwyczajny UG Opis wykładu dostępny na stronach Zakładu Chemii Cukrów Seminarium magisterskie (2 x 30 godzin)** - 3 i 4 semestr Prowadzący - pracownicy Katedry Syntezy Organicznej Pracownia magisterska (2 x 120 godzin) - 3 i 4 semestr Prowadzący - pracownicy Katedry Syntezy Organicznej ** Zajęcia prowadzone wspólnie z Zakładem Chemii Cukrów i Zakładem Chemii Polipeptydów Zalecane przedmioty fakultatywne 1. Chromatografia 2. Współczesne metody spektrometrii mas 3. Niektóre choroby zakaźne 5. Biologicznie czynne peptydy 6. Mechanizmy reakcji w chemii organicznej 7. Nowoczesne metody syntezy chemicznej 8. Chemiczna synteza peptydów Prace magisterskie wykonane/wykonywane w ZSO/KSO *(do roku 2009 Katedra Syntezy Organicznej) 2008/2009 Michał Roszyk ”Synteza analogów argininowej wazopresyny (AVP) modyfikowanych w N-końcowej części cząsteczki resztą Nmp”. Opiekun: dr Izabela Derdowska Sebastian Nowak „Synteza nowych analogów bradykininy o spodziewanej czynności antagonistycznej” Opiekun: dr hab. Adam Prahl, prof. nadzwyczajny UG Monika Ptach „Synteza analogów argininowej wazopresyny (AVP) modyfikowanych na N-końcu przestrzennie rozbudowanymi grupami acylowymi” Opiekun: dr hab. Adam Prahl, prof. nadzwyczajny UG 2007/2008 Anna Breska „Synteza analogów bradykininy o spodziewanej czynności antagonistycznej modyfikowanych w pozycji 4 lub 5 resztą N-benzylo-L-alaniny”. Opiekun: dr Izabela Derdowska Beata Szymczycha „Badanie wpływu obecności reszt kwasu 1-aminocykloheksylo-1-karboksylowego w pozycjach 5 oraz 5 i 8 na właściwości farmakologiczne modelowego antagona bradykininy”. Opiekun: dr hab. Adam Prahl 2006/2007 Marek Rożek „Odtwarzanie pełnoatomowej reprezentacji rozdzielczości”. Opiekun: dr Rajmund Kaźmierkiewicz struktury białka z danych o niskiej Krzysztof Smolara „Badania nad trwałością kompleksów enzymu PrkC z pochodnymi ATP na drodze symulacji dynamiki molekularnej”. Opiekun: dr Rajmund Kaźmierkiewicz 2005/2006 Anna Maria Pszenna „Synteza analogów bradykininy o spodziewanej czynności antagonistycznej w stosunku do receptorów B1”. Opiekun: dr Izabela Derdowska Katarzyna Misiło „Synteza analogów bradykininy zawierających w cząsteczce elementy ograniczające swobodę konformacyjną”. Opiekun: dr Izabela Derdowska Katarzyna Szopińska „Synteza analogów argininowej wazopresyny (avp), modyfikowanych w pozycji 2 lub 3 resztą kwasu l-pipekolinowego”. Opiekun: prof. dr hab. Bernard Lammek Prace doktorskie wykonywane/wykonane w ZSO/KSO* *(do roku 2009 Katedra Syntezy Organicznej) 2008 Dariusz Sobolewski „Wpływ wybranych modyfikacji N-końcowego fragmentu cząsteczki argininowej wazopresyny i jej analogów na czynność farmakologiczną. 2007 Olga Labudda „Analogi bradykininy oraz ich N-acylowane pochodne modyfikowane w C-końcowym fragmencie cząsteczki resztami ograniczającymi swobodę konformacyjną.” Promotor: prof. dr hab. Bernard Lammek 2006 Wioleta Gabriela Kowalczyk „Synteza analogów hormonów neuroprzysadkowych zawierających w cząsteczce fragment ograniczający swobodę konformacyjną.” Promotor: prof. dr hab. Bernard Lammek 2005 Emilia Sikorska „Badania konformacyjne wazopresyny i jej analogów z wykorzystaniem spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego.” Promotor: prof. dr hab. Bernard Lammek 2004 Rafał Ślusarz „Symulowanie dynamiką molekularną blokowania i aktywacji receptorów sprzężonych z białkiem G.” Promotor: prof. dr hab. Bernard Lammek 2002 Beata Jastrzębska „Projektowanie i synteza analogów hormonów neuroprzysadkowych zawierających fragmenty ograniczające swobodę konformacyjną.” Promotor: prof. dr hab. Bernard Lammek