Rozszerzony profil badań Najistotniejsze osiągnięcia naukowe w

Katedra Genetyki
A. Profil badawczy
Badania Katedry Genetyki koncentrują się wokół genomiki funkcjonalnej roślin uprawnych
i modelowych. Obejmują one poszukiwanie genów warunkujących procesy wzrostu
i rozwoju oraz mechanizmów ich regulacji, a w szczególności genów związanych
z rozwojem i architekturą systemu korzeniowego w tym róŜnicowaniem włośników,
hormonalną regulacją wzrostu z udziałem giberelin, auksyn i brasinosteroidów, procesami
totipotencji i morfogenezy roślin in vitro, a takŜe z tolerancją na stresy abiotyczne. Ponadto
prowadzone są badania zróŜnicowania genetycznego w populacjach wybranych gatunków
roślin.
W badaniach tych wykorzystuje się klasyczne metody indukowania zmienności i analizy
genetycznej oraz techniki molekularne jak: markery molekularne (AFLP, SSR, SNP);
sekwencjonowanie i klonowanie DNA; analizy transkryptomów z wykorzystaniem
mikromacierzy DNA, subtraktywnej hybrydyzacji cDNA, Real-Time qPCR oraz roślin
transgenicznych; metody analizy róŜnicowej proteomów; strategia TILLING a takŜe techniki
bioinformatyczne. Stosowane są takŜe techniki kultur in vitro roślin jak: somatyczna
embriogeneza, organogeneza, mikropropagacja, kultury protoplastów, kultury pylnikowe,
a takŜe transformacja genetyczna roślin z wykorzystaniem Agrobacterium.
Obiektami badań są: gatunek modelowy Arabidopsis thaliana, rośliny uprawne takie jak
Hordeum vulgare, Triticum aestivum, Avena sativa, Brassica napus oraz rośliny
z ekosystemów naturalnych jak Reynoutria sp., Marsilea quadrifolia, Brachypodium
pinnatum.
B. Najistotniejsze osiągnięcia naukowe w ciągu ostatnich pięciu lat (2004-2008)
Opracowanie wysokowydajnej metody uzyskiwania somatycznych zarodków u modelowego
gatunku Arabidopsis thaliana (patent Nr. P- 335550) oraz wykazanie funkcji genu LEC2
w indukcji somatycznej embriogenezy. Stworzenie i genetyczne scharakteryzowanie
kolekcji mutantów włośnikowych Hordeum vulgare. Szczegółowe zmapowanie genów
o kluczowym znaczeniu dla morfogenezy włośników. Wykazanie roli beta ekspansyny
w procesie inicjacji włośników u H. vulgare. Zidentyfikowanie nowych genów biorących
udział w syntezie i sygnalingu brasinosteroidów u H. vulgare. Stworzenie platformy
TILLING dla genomiki funkcjonalnej i hodowli H. vulgare.
C. Pięć najwaŜniejszych publikacji naukowych Katedry Genetyki w okresie 2004-2009
Janiak, A. and I. Szarejko, 2007. Molecular mapping of genes involved in root hair formation in barley. Euphytica
157: 95-11
Guzy-Wróbelska, J., A. Labocha, M. Kwasniewski and I. Szarejko, 2007. Different recombination frequencies in
wheat doubled haploid populations obtained through maize pollination and anther culture. Euphytica 156:
173-183
Kwasniewski, M. and I. Szarejko, 2006. Molecular cloning and characterization of beta-expansin gene related to
root hair formation in barley. Plant Physiol. 141(3): 1149-1158
Gaj, M.D, S. Zhang, J.J. Harada, P.G. Lemaux. 2005. LEAFY COTYLEDON genes are essential for induction of
somatic embryogenesis of Arabidopsis. Planta, 222: 977-988
Maluszynski, M., K.J. Kasha, B.P. Forster and I. Szarejko (Eds). 2003. Doubled Haploid Production in Crop Plants.
A Manual, Kluwer Acad. Publ., Dordrecht, pp. 1-428.