Poszukiwanie mutacji w genie kodującym Maf1 z linii komórek

Poszukiwanie mutacji w genie kodującym Maf1 z linii
komórek białaczki.
Jedną z cech charakterystycznych komórek nowotworowych jest ich niekontrolowana
proliferacja. Istotną rolę w procesie nowotworzenia odgrywa deregulacja Pol III. Polimeraza
ta jest kontrolowana przez wiele czynników, w tym przez białka będące supresorami
nowotworzenia, takie jak RB czy p53 oraz przez białka będące potencjalnymi onkogenami jak
c-Myc. Zakłócenia w aktywności tych białek wpływają negatywnie na prawidłowe
funkcjonowanie Pol III.
Oprócz wymienionych czynników istotną rolę w regulacji aktywności Pol III odgrywa
białko HsMaf1. W komórkach nowotworowych obserwuje się zwiększony poziom
transkrypcji genów zależnych od Pol III. W związku z tym białko HsMaf1, będące
represorem Pol III, może pełnić rolę supresora nowotworzenia. Zaobserwowano, iż poprzez
zwiększenie poziomu HsMaf1 w komórkach nowotworowych można przeciwdziałać ich
wzrostowi niezależnemu od adhezji. Dane te wskazują, na istnienie związku między
zaburzeniami w funkcjonowaniu komórek, prowadzącymi do transformacji nowotworowej,
a upośledzeniem funkcji białka HsMaf1. Niekorzystne zmiany w funkcjonowaniu białka
HsMaf1 mogą być spowodowane mutacjami w genie kodującym to białko.
Istotą przedstawionej pracy badawczej było sekwencjonowanie genu HsMaf1 z linii
komórkowej białaczki HL60. Celem sekwencjonowania było zidentyfikowanie mutacji
mogących mieć potencjalny związek z transformacją nowotworową. Niestety, nie udało się
zsekwencjonować całego genu, zatem analiza otrzymanych wyników nie jest kompletna.
Porównanie otrzymanych fragmentów z sekwencją genu HsMaf1 znajdującą się w bazie
GenBank pozwoliła wytypować 7 mutacji w genie HsMaf1 z czego 2 znajdują się w egzonie.
Tylko jedna z tych dwóch mutacji prowadzi do zmiany w sekwencji aminokwasowej białka
HsMaf1 (mutacja typu missense). Druga mutacja jest mutacją cichą. Dalsza analiza wykazała
iż wszystkie wykryte mutacje stanowią przykład polimorfizmu pojedynczego nukleotydu
(SNP), są więc mutacjami powszechnie spotykanymi w populacji ludzkiej. Zidentyfikowane
mutacje nie są więc specyficzne dla komórek nowotworowych typu HL60, tak więc nie
można w sposób bezpośredni powiązać faktu ich wystąpienia w genie HsMaf1
z transformacją nowotworową. Ponieważ jednak nie jest znany wpływ mutacji typu SNP na
funkcjonowanie białka HsMaf1, nie można całkowicie wykluczyć, iż któraś ze znalezionych
mutacji sprzyja transformacji nowotworowej.