Ćwiczenie 2. TESTY PARAMETRYCZNE Testy istotności dla
Transkrypt
Ćwiczenie 2. TESTY PARAMETRYCZNE Testy istotności dla
Ćwiczenie 2. TESTY PARAMETRYCZNE Testy istotności dla średniej (dla 1 próby) [test z i test t] 1. (ręcznie/R) Program komputerowy wymodelował 12 struktur białkowych i uzyskał następujące oceny (od 0 do 1): 0.467, 0.645, 0.868, 0.472, 0.844, 0.879, 0.405, 0.604, 0.787, 0.449, 0.772, 0.780. Wiedząc, że rozkład ocen generowanych przez program jest normalny z odch. stand. 0.2, zweryfikuj hipotezę na poziomie istotności α = 0.05, że przeciętna wiarygodność przewidywań programu wynosi 0.5. 2. (R) Rozkład czasu półtrwania enzymu metylazy DNA u zdrowych osób jest normalny. Dokonałeś(aś) 5 niezależnych pomiarów okresu półtrwania enzymu i otrzymałeś(aś) następujące wyniki [min]: 216, 222, 230, 228, 233. Zweryfikuj hipotezę, że przeciętny czas działania enzymu wynosi 227 min. Test normalności Shapiro-Wilka 3. (R) Dokonałeś 10-krotnego pomiaru poziomu ekspresji genu PP2A w jednodniowych odstępach: 11.54, 10.07, 9.08, 10.28, 11.27, 10.36, 12.46, 8.80, 10.50, 11.49. Zweryfikuj hipotezę, że poziom ekspresji tego genu przyjmuje rozkład normalny. Test istotności dla dwóch wariancji (dla 2 prób) [test F] 4. (R) Zbadano wzrost kolonii dwóch szczepów bakterii Staphylococcus aureus: chorobotwórczego (MRSA) i oportunistycznego (MSSA). MRSA 71 76 79 89 76 82 73 79 84 86 89 67 77 MSSA 61 62 63 62 66 64 68 65 68 57 61 72 - Zakładając, że w obu populacjach rozkład liczby bakterii jest normalny, czy można powiedzieć, że szczep MRSA charakteryzują się większą zmiennością wzrostu? Test istotności dla dwóch średnich (dla 2 prób) [test t] 5. (R) Ostatnie doniesienia naukowe sugerują, że gen CCND3 (Cyclin D3) odgrywa istotną rolę w rozróżnieniu pacjentów z ostrą białaczką limfoblastyczną (ALL) od pacjentów z ostrą białaczką szpikową (AML). W pliku http://www.combio.pl/files/ccnd3.txt znajdują się wyniki badań ekspresji tego genu osobno u pacjentów ALL i AML. Zbadaj czy między pacjentami ALL i AML występują statystycznie istotne (α = 0.05) różnice w ekspresji genu CCND3. 6. (R) Najnowsze badania sugerują, że po zawale serca we krwi obserwuje się wzmożoną ilość białka C wiążącego miozynę serca. To odkrycie może pomóc w opracowaniu nowych metod diagnozowania zawałów serca. W tym celu, w grupie 10 pacjentów zbadałeś(aś) próbki krwi po okresie 6 godzin od zawału oraz po 2-tygodniowym okresie rehabilitacji. Zawał Rehabilitacja 89 84 92 87 98 87 95 90 95 90 92 90 95 90 92 93 98 93 101 96 Przyjmując poziom istotności α = 0.01, sprawdź hipotezę, że ilość białka C we krwi zmniejsza się po rehabilitacji. TESTY NIEPARAMETRYCZNE Test zgodności dla dwóch prób niezależnych [test U Manna-Whitneya-Wilcoxona] 7. (R) Przebadałeś(aś) zdolność fagocytowania ciał obcych osobno w linii neutrofilii. Monocyty Neutrofile 9 11 12 16 19 20 21 23 komórek monocotyów i 24 - Na poziomie istotności α = 0.05 zweryfikuj hipotezę, że monocyty są w tym aspekcie bardziej wydajne. Testy zgodności dla dwóch prób zależnych [test znaków i par wiązanych WIlcoxona] 8. (R) Wśród 10 klientów zbadano działanie preparatu poprawiającego samopoczucie. W tym celu każdy klient miał za zadanie ocenić swoje samopoczucie przed i po spożyciu preparatu w skali od 1 (bardzo źle) do 6 (bardzo dobrze). Bez preparatu Z preparatem 4 5 3 5 1 1 5 4 4 4 2 6 4 6 4 5 2 3 1 4 Sprawdź na poziomie istotności α = 0.01 czy podany preparat istotnie poprawił humor badanym. 9. (R) Ponieważ zamierzasz być miliarderem prowadzisz badania nad lekiem przyspieszającym czas rozkładu alkoholu w wątrobie. Aby przetestować prototyp leku zmierzyłeś(aś) poziom alkoholu we krwi 10 osób dwukrotnie – 2 godz. po ukończeniu spożywania alkoholu i przyjęciu leku oraz po 2 godz. po ukończeniu spożywania alkoholu. Z lekiem Bez leku 0.4 0.8 1.2 1.6 0.8 0.9 0.3 0.4 2.2 3.0 0.2 0.5 0.7 1.2 1.3 0.6 1.3 1.5 0.6 1.2 Na poziomie istotności α = 0.05 sprawdź czy nowy lek przyspiesza spalanie alkoholu.